شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین همولیزین باسیلوس پامیلوس و داکینگ آن با کلسترول و پیشگویی تغییرات کنفورماسیونی این پروتئین در طراحی دارو با کمک بیوانفورماتیک [PDF]
همولیزین یک پروتئین خارج سلولی است که توسط بسیاری از باکتریهای بیماریزا و غیر بیماریزا ترشح میشود. سطح فعالیت آنها غشایپلاسمایی گلبولهای قرمز خون میباشد.
نیلوفر ساسانی +2 more
doaj +1 more source
مطالعه رفتار جذب و خواص دینامیکی مخلوط هیدروکربن-آب-گاز اسیدی در فضای نانوحفرات کربناته و کائولینیتی با استفاده از روش شبیهسازی دینامیک مولکولی [PDF]
در این مقاله با انجام شبیهسازیهای دینامیک مولکولی (برای نخستین بار) یک راهکار مقایسهای جهت مطالعه رفتار جذب سیال شامل هیدروکربن(پروپان، نرمال هگزان، نرمال هپتان، نرمال دکان)- آب- گاز اسیدی بر سطوح (1014) کلسیم کربنات و (001) کائولینیت در فضای ...
بابک فاضل عبدل آبادی +1 more
doaj +1 more source
بررسی اثر چسبندگی بین دو سطح بر کار نیروی اصطکاک و سایش در مقیاس نانو با استفاده از دینامیک مولکولی [PDF]
در این پژوهش، با بهرهگیری از دینامیک مولکولی اثر چسبندگی بر میزان حذف و جدا شدن مواد در طی فرایند خراش در مقیاس نانو و به روش عددی با کمک آزمون نانو خراش موردمطالعه قرارگرفته است.
میرابوالفضل مختاری
doaj
شبیهسازی دینامیک مولکولی تبدیل هیدروژنی نرمال هپتان برروی کاتالیست :Pt/MSU تأثیر مورفولوژی و توپولوژی کاتالیست بر رفتار آن از دیدگاه نفوذ و سینتیک [PDF]
دینامیک مولکولی فرایند تبدیل هیدروژنی نرمال هپتان برروی کاتالیست دوعاملی Pt/MSU بهروش مونت کارلو شبیهسازی شدهاست. در این تحقیق با تحلیل مورفولوژی و توپولوژی (ریختشناسی و جایشناسی) ساختار کاتالیست، کارایی و رفتار آن در ازای نفوذ ذرات خوراک درون حفره ...
محمدجواد اسدی نسب +3 more
doaj +1 more source
تأثیر اثرات ترمودینامیکی بر تغییرات انرژی و مقایسهی برهمکنشهای ساختاری در پروتئینِ گیرندهی فاکتور رشد عصبی و آنزیم پروتئینی مؤثر در یادگیری [PDF]
زمینه و هدف: دینامیک مولکولی، روشی برای شبیهسازی رفتار ترمودینامیکی مواد در سه فاز جامد، مایع و گاز با استفاده از نیرو، سرعت و مکان ذرات میباشد. دربین این عوامل، مهمترین عامل، نیرو است. در شبیهسازی دینامیک مولکولی کلاسیک، نیرو از پتانسیل کلاسیک بهدست
ریحانه صباغزاده
doaj
مقایسه شبیه سازی جذب کلکتور سدیم اولئات بر سطح 001 هماتیت با جذب مولکول آب بر سطح آبدوست هماتیت به روش دینامیک مولکولی [PDF]
این مقاله، یک تحقیق بر پایه شبیهسازی دینامیک مولکولی است که به بررسی مکانیزیم جذب سدیم اولئات (NaOl) بر روی سطح 001 کانی اکسیدی و به شدت آبدوست هماتیت در محیط فلوتاسیون و تاثیر آن بر خواص ترشوندگی این کانی میپردازد. شبیهسازیهای دینامیک مولکولی انجام
شرمین هاشمی +2 more
doaj +1 more source
شبیهسازی دینامیک مولکولی بر روی رفتار کمانش گرافن عاملدار شده با نایلون 6 و 6 در محیط سیال آبی [PDF]
در این مقاله، رفتار کمانشی گرافن عاملدار شده کووالانسی با نایلون 6 و 6 در محیطهای خلأ و آبی با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی مورد تحلیل و بررسی قرارگرفته است.
شهرام آجری +1 more
doaj
مطالعه ابتدا به ساکن تحول نقص خودبیننشین در ساختار بلوری 4H-SiC [PDF]
اثرات ماکروسکوپی تخریب تابشی بر مواد ناشی از برهمنهی تدریجی آسیبهای اولیه در مقیاس اتمی است. در این پژوهش با استفاده از روش شبیهسازی دینامیک مولکولی ابتدا به ساکن، اثرات حضور نقصهای نقطهای خودبیننشین بر خواص الکترونی و ساختاری 4H-SiC مورد بررسی ...
نادیا بابایی بیدمشکی +1 more
doaj +1 more source
تحلیل خواص مکانیکی نانوکامپوزیت آلومینیوم- گرافن با نقص جای خالی و حفره به روش دینامیک مولکولی [PDF]
مطالعه حاضر، خواص مکانیکی از جمله مدول یانگ و تنش استحکام کششی نانوکامپوزیت آلومینیوم تقویت شده با گرافین ناقص با نقص حفره و نقص جایخالی تحت کشش تک محوره با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی مورد بررسی قرار داده است.
علی ابراهیمی +1 more
doaj +1 more source
محاسبات مکانیک مولکولی و بررسی تأثیر حلال بر اثرات محیطی و ترمودینامیکی آنزیم کولین استیل ترانسفراز [PDF]
چکیده زمینه و هدف: فعالیت استیل کولین و آنزیم استیل کولین ترانسفراز در بیماری آلزایمر بررسی و مشخص شده است. از این جهت، نقص آنها میتواند باعث کاهش حافظه و یادگیری شود. میدانهای نیرو، بر ساختار کولین استیل ترانسفراز تأثیر دارند.
ریحانه صباغزاده
doaj

