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纳米孔长读测序鉴定肝癌细胞中低氧特异性转录本 [PDF]

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
目的应用纳米孔长读长测序技术,深入分析正常肝实质细胞和肝癌细胞在低氧环境下的特异性转录组变化,以期阐明肿瘤细胞在低氧条件下生存与转移的内在机制,从而为肿瘤的精准靶向治疗开辟新的视角与策略。方法实验选取正常肝实质细胞系THLE-3与肝癌细胞系Hep3B作为研究对象,分别置于常氧与低氧条件下培养48 h后,提取其总RNA。随后,采用纳米孔测序技术,对这两种细胞系在不同氧浓度下的转录组进行高通量、高精度的测序分析。结果本研究成功构建了基于纳米孔三代测序技术的低氧转录本数据集,展现了前所未有的测序精度。通过GO(
高力, 沈晟齐, 高平
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Modeling fluid´s dynamics in fractal porous media on Qp(Qp上分形多孔介质的流体动力学模型)

open access: yesZhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2022
利用p-adic域中的同胚映射,将在超距空间上多孔介质的流体动力学模型推广至分形集,运用苏维宜定义的拟微分算子Tα,研究了一类满足初始条件的液体滴在分形多孔介质上流体动力学的反应扩散拟微分方程,得到了该方程的定解,并进一步讨论了该定解的敛散性。
WUBo(吴波)
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Highly efficient fluid-solid coupled incompressible SPH simulation method for atherosclerotic plaque generation(动脉粥样硬化斑块生成的高效流固耦合不可压缩SPH模拟方法)

open access: yesZhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2023
动脉粥样硬化是导致心血管疾病和中风的关键诱因,对该病变过程进行模拟与可视化有助于开展医学研究。为解决现有模拟方法不能可视化动脉粥样硬化斑块生成过程以及模拟速度过慢问题,提出了一种基于高效流固耦合不可压缩光滑粒子流体动力学(smoothed particle hydrodynamics,SPH)的斑块生成模拟方法。首先,基于流固耦合不可压缩SPH方法,将血液离散为不可压缩流体粒子,以控制血液流动的稳定性;然后,使用斑块生成模型对血液、单核细胞等粒子建模,对血液成分进行病理性分析,控制斑块生成;最后 ...
汪飞(WANG Fei)   +5 more
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Molecular dynamics simulation of the effect of SDS / SDBS on the wettability of anthracite [PDF]

open access: yes, 2022
In order to explore the microscopic mechanism of anionic surfactants in coal mine dust removal. Using molecular dynamics simulation methods, two commonly used anionic surfactants, sodium dodecyl sulfate (SDS) and sodium dodecylbenzene sulfonate (SDBS ...
Guochao YAN   +5 more
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The configurational transition of polyelectrolyte chain confined in a cylinder(聚电解质链在柱状受限下的构象转变)

open access: yesZhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2023
采用粗粒化分子动力学模拟方法,研究了受限于圆柱体内的聚电解质链的构象行为。通过计算链平均回旋半径、平均持久长度和平均形状因子等物理量,重点探究反离子价态、链刚性和受限孔径等对聚电解质链尺寸和构象转变的影响。结果表明,受限聚电解质链可形成稳定的棒状、球状、折叠链状和环状结构。尤其在三价反离子诱导下,半刚性聚电解质链可形成稳定的环状结构,并由切向相关函数表征。通过统计反离子分布,进一步探讨了聚电解质链和离子凝结的机制。同时讨论了环的成核和生长动力学特征 ...
高菊先(GAO Juxian)   +2 more
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不同温度和压强下甲基乙烯基硅橡胶聚合物的分子动力学模拟研究

open access: yesDianci bileiqi, 2021
分子模拟技术因能够解释聚合物材料宏观结构和微观结构的关系,故被广泛应用于聚合物材料的性能研究。材料的微观物理性质用密度来表征,材料的微观力学性质用杨氏模量和泊松比来表征。在模拟体系中,用Materials studio 7.0软件构建一条原子数为237的分子链,经几何及能量优化得到稳定结构,晶胞参数设置为30×30×30,然后使用Amorphous Cell构建3种不同温度体系分子链数为9的晶胞,密度设置为0.98 g/cm3,最后用Forcite ...
翟鹏飞, 彭玉峰, 韩雪云
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葡萄糖氧化酶与6-脱氧-D-葡萄糖作用机制的模拟分析 [PDF]

open access: yes, 2018
葡萄糖氧化酶(GOx)具有多种用途,它是一种氧化还原酶,也是一种需氧脱氢酶,与生命的重要物质葡萄糖和氧有密切联系,且对人体无毒无害。本文基于分子动力学模拟手段,对GOx以及含有底物6-脱氧-D-葡萄糖的GOx复合物分子进行了计算分析,通过分析复合物体系中能量、回转半径、二级结构等相关数据,探究了GOx与底物6-脱氧-D ...
李成伟, 赵小水
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盘形悬式瓷绝缘子在多刚体模型下的风偏应力分析

open access: yesDianci bileiqi, 2021
分析模拟盘形悬式瓷绝缘子串风偏运行时承受的应力大小可预防风偏闪络事故的发生。对此采用ANSYS Fluent计算流体动力学(CFD)软件,建立了基于RNG k-ε湍流模型的绝缘子串-导线三维模型并进行分析。首先计算出刚体与多刚体模型在多种风速下受到的von-Mises等效应力情况,并将两者与受力公式的计算结果进行对比分析。为进一步研究绝缘子串上不同位置的受力,又模拟并比较了多刚体模型在不同风速时相应位置的受力大小。结果表明,在风速大于30 m/s时,多刚体模型由于考虑风偏过程中各绝缘子之间的定点转动现象,
孟婧, 陈炯, 毕祥宜
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The study of antimony(V) adsorption by commercial iron oxide red(氧化铁红对印染废水中锑(V)的吸附性能)

open access: yesZhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2022
印染行业锑(Sb)污染严重,常规除锑工艺难以达标,铁氧化物对水中锑及其化合物具有良好的吸附效果,选取氧化铁红110、138与190,分别记为T110、T138、T190,对模拟印染废水中的Sb(V)进行吸附去除。结果表明,当Sb(V)初始浓度为200 μg·L-1,投加量为0.2 g·L-1时,T138的除锑效果最佳,去除率可达99.44%。XRD图谱显示,氧化铁红的主要成分为α-Fe2O3。TEM与XPS图谱表明,T138的颗粒形状较不规则且相对粗糙,含还原态铁与丰富的羟基位点,有利于吸附Sb(V ...
ZHOUChuchen(周楚晨)   +5 more
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A novel nonlinear system and its hyperchaotic control(一个新的非线性系统及其超混沌控制)

open access: yesZhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2012
为产生复杂的超混沌吸引子,对经典的Lü系统变形,引入一个非线性状态反馈控制器,构造了一个新的四维非线性系统,并对系统的基本动力学特性进行了简要研究,得到系统的吸引子、分岔图和Lyapunov指数谱及分数维数,系统随新引入的参数变化呈现周期、拟周期、混沌及超混沌动力学行为.利用系统单变量的比例微分反馈控制法,抑制了该系统的超混沌运动,理论分析和计算机模拟结果表明了该方法的有效性和正确性.
GAOZhi-zhong(高智中)
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