Research and application status of molecular simulation technology in food field [PDF]
In the food field, a large number of phenomena and problems that are difficult to be macroscopically explained by traditional experimental methods occur during the process of research and development in upstream laboratories to production in downstream ...
BI Xinjian +5 more
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全波形反演是一种利用地震波传播的动力学特征来获取地下介质物性参数的反演方法,可为揭示地下精细结构提供重要依据。本文以弹性波方程作为数学模型来模拟地震波传播规律并进行相应的反演方法研究。为提高计算效率与反演结果的准确性,可将近似解析离散化(NAD)算子用于频率域弹性波方程的正演模拟。本文在频率域NAD离散的基础上推导阻抗矩阵的稀疏分块结构与反演目标函数对模型参数的梯度计算公式,由此建立基于NAD算子的频率域弹性波全波形反演方法。为验证该方法的有效性,文中通过数值实验对多种典型介质模型进行反演计算 ...
Xiaoting Yang, Ning Wang, Chao Lang
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Computational Simulations of Zinc Enzyme:Challenges and Recent Advances [PDF]
锌酶在人体中分布非常广泛,种类繁多,是当前最受关注的金属酶之一。由于在锌配位结构上的多样性以及zn2+饱和的d轨道带来的“光谱寂静“性,导致许多实验研究手段受限。计算模拟在锌酶的研究中发挥着越来越重要的作用,已经成为不可或缺的研究工具。现代量子化学计算模拟方法,特别是被视为研究生物大分子体系非常有效的QM/MM组合方法,目前已经被广泛应用于探讨复杂多变的锌配位结构以及锌酶催化反应机理。通过在QM/MM水平下开展的分子动力学模拟,可以揭示锌酶体系中结构与功能间的相互关系。此外 ...
巫瑞波, 张颖凯, 曹泽星
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Exploration of the Binding Mechanism between Puerarin and β-Lactoglobulin Using Fluorescence Spectroscopy and Molecular Dynamics Simulation [PDF]
The binding mechanism of puerarin (PUE) to β-lactoglobulin (β-lg) was investigated by fluorescence spectroscopy, molecular docking, and molecular dynamics simulation.
MA Bo, LI Rong, XU Ao, DUAN Wenjie, HUANG Yechuan
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A new method of molecular dynamics simulations based on perturbation theory —— Extended Langevin Dynamics [PDF]
分子构型,与分子的性质及反应活性密切相关,因而确定分子构型成为化学领域中的重要课题。实验测定分子构型的手段多种多样,不同实验测定的构型也具有不同的物理意义。在各种构型的定义中,平衡构型的定义是物理意义最为明确的,其对应的是Born-Oppenheimer近似下的势能面最低点。但是,由于分子处于不断运动中,实验上确定分子的平衡构型是相当困难的。 另一方面,从理论上预测分子的各种性质时,也需要考虑振动和转动的影响。这方面已经有很多的理论工作,然而,在处理较为复杂的分子体系时,尚未有一种方法能令人满意 ...
申同昊
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Effect of Particle Agglomeration on Thermal Conductivity of Solar Salt Nanofluids [PDF]
ObjectivesNanofluid technology is an important means to improve the thermal conductivity of energy storage materials in solar thermal power plants. However, the nanoparticles in actual molten salt based nanofluid usually aggregate and settle down, which ...
CUI Liu +4 more
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Preliminary Studies of Molecular Simulation on the Liquid Crystal ehaviors and Glass Transition Temperatures of N-benzyl Chitosan Derivatives [PDF]
壳聚糖结构单元中含有-NH2和-OH,因此可对它进行多种化学修饰,这些丰富的化学修饰方法为研究壳聚糖及其衍生物的液晶性提供了很好的条件。利用它进行分子量、取代度和取代基大小等结构因素对溶致液晶行为影响的研究已先后报道,但取代基上特征官能团的位置变化(羟基在苯环的邻、间、对位上)对其溶致液晶性的影响的研究还尚未见有报道。本文拟通过实验合成一系列取代基上特征官能团的位置发生变化的壳聚糖衍生物,对其溶致液晶性进行研究,并通过分子模拟的手段,研究壳聚糖衍生物结构与性质的关系 ...
曾志群
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Molecular Dynamics Study of Neutral Polymer Brushes and Polyelectrolyte Brushes [PDF]
聚合物分子是由基本单元以共价键相连的,它具有大分子的性质。对聚合物分子的最基础的认识可以追溯到Flory对良溶剂中单链溶胀的研究,以及Huggines和Flory的热力学研究等。后来聚合物物理的主要理论发展,包括了聚合物链的Edwards模型,deGennes建立的链扩散爬行理论等。目前,对聚合物的研究了解还在继续深入,聚合物结晶,带电聚合物,聚合物刷等都是高分子研究领域的几大热点,这些研究在生物医药方面有着重要的应用。 本文通过分子动力学模拟,研究了中性线形和环状聚合物刷,以及带电聚合物刷的性质 ...
何素贞
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Research progress on the structure of hydration films at solid–liquid interfaces [PDF]
Solid–liquid interfaces are pervasive across the material world, playing a crucial role in various fields such as mineral flotation, oil mining and processing, and soil improvement.
Chunbao SUN, Jue KOU, Na ZHANG
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Endogenous Polysaccharides Interact with Collagen to Enhance Its Swelling Effect during the Roasting of Beijing Roast Duck [PDF]
To gain in-depth insight into the mechanisms and molecular pathways of physicochemical transformation in duck skin during high-temperature roasting, this study systematically analyzed the changes in hardness, toughness, chewiness, water distribution, and
WU Ruiyun, WANG Zhenyu, CHANG Cheng, LIU Linggao, ZHANG Dequan
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