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盐胁迫下拟南芥 SCAMP 基因克隆和表达的生物信息学分析

, 2020
为探究分泌载体膜蛋白(Secretory carrier membrane protein, SCAMP)的功能,采用PCR方法从模式植物拟南芥中克隆到5个SCAMP基因,进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR技术分析5个SCAMP基因在盐胁迫下的表达模式。结果显示,拟南芥SCAMP蛋白的相对分子量为30.1~33.2 kDa,等电点为6.60~9.18,属于不稳定性疏水蛋白,二级蛋白结构中主要包含4种构象:α–螺旋(Alpha helix, Hh)、无规则卷曲(Randon coil, Cc ...
白雪杨   +4 more
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橡胶草 SRPP2 基因克隆及表达分析

, 2020
TkSRPP2是橡胶草SRPP基因家族的成员,在天然橡胶生物合成和橡胶粒子稳定方面起重要作用。采用PCR技术从橡胶草中克隆得到TkSRPP2基因全长序列,对其进行生物信息学分析、烟草亚细胞定位及定量表达分析。结果显示,TkSRPP2基因全长633 bp,编码210个氨基酸,蛋白质相对分子质量为23.15 kD,理论等电点(pI)8.51。系统进化分析表明TkSRPP2蛋白与莴苣SRPP3蛋白亲缘关系最近。烟草亚细胞定位显示TkSRPP2蛋白位于细胞质中。TkSRPP2基因在主要在根中表达 ...
张睿珠   +7 more
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半滑舌鳎蛋白激酶C-alpha(PKCα)的基因克隆和免疫应答分析

, 2020
蛋白激酶C(PKC)广泛参与哺乳动物T、B淋巴细胞涉及的免疫反应并发挥重要作用,然而PKC在鱼类免疫过程中的作用却少有报道。本研究在半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)中克隆了PKC家族的典型成员PKCα(命名为CsPKCα),并进行了分子特征和表达模式分析。CsPKCα的cDNA全长为2315 bp,其中,开放阅读框(ORF)为2013 bp。qRT-PCR分析显示,CsPKCα在各个组织中广泛表达,其中,在鳃、肝脏、皮肤和肠中具有较高的转录水平 ...
李坤明   +7 more
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油菜 FBA 基因克隆、表达分析及其与抗旱性的关系

, 2020
为了解果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(fructose-1,6-bisphosphate aldolase,FBA)在油菜抗旱中的作用,揭示油菜干旱胁迫下FBA基因表达量、光合指标、产量等之间的关系,为油菜等作物抗旱性鉴定和抗旱性改良提供依据。以抗旱性强的甘蓝型油菜94005为材料,在初花期进行干旱胁迫处理,以正常浇水作为对照;测定叶片光合参数和FBA酶活性,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析FBA基因的表达量;采用RACE方法对FBA基因进行全长克隆,并对测序结果进行生物信息学分析 ...
谢小玉   +9 more
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巴马香猪 VRTN 基因克隆、表达及其多态性与繁殖性状的关联分析

, 2020
旨在研究VRTN(vertebrae development homolog)基因在巴马香猪群体中的编码区序列特征、组织表达情况、脊椎数性状因果突变位点ins291的等位基因频率及其与乳头数和产仔数性状的关联。本研究采集3头0日龄巴马香猪组织,利用cDNA克隆技术获得VRTN基因编码区全长序列并进行生物信息学分析,利用荧光定量PCR技术检测VRTN在心、肝、脾、肺、肾、背最长肌和皮下脂肪组织中的表达情况;采集279头经产巴马香猪母猪血液,检测ins291位点在该群体中的频率分布,并与乳头数 ...
莫家远   +15 more
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三疣梭子蟹 Toll4 基因克隆及其在病原和低盐胁迫中的表达特征分析

, 2018
采用RACE技术克隆得到三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)TLRs家族的一个新基因,将其命名为PtToll4。该基因cDNA全长为4276 bp,5'和3'非编码区分别为339 bp和1252 bp,编码一个含有895个氨基酸、分子量为102.5 kDa、理论等电点为6.03的蛋白质。PtToll4蛋白是一个跨膜蛋白,存在胞外区LRR、LRRCT结构域及保守的胞内区TIR结构域。同源性及系统进化分析显示,PtToll4氨基酸序列与中华绒螯蟹(Eriocheir ...
张杰   +11 more
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固氮菌( Ensifer meliloti 1021)降解苯甲腈及其代谢酶的基因克隆和表达

, 2019
对固氮菌(Ensifer meliloti 1021)降解环境污染物苯甲腈途径及其相关酶进行了基因克隆和表达研究。高效液相色谱法(HPLC)分析显示En.meliloti 1021静息细胞可将苯甲腈降解为苯甲酰胺和苯甲酸。En.meliloti 1021全基因组中没有腈水解酶(nitrilase)基因,但有1个腈水合酶(nitrile hydratase)基因和12个酰胺酶(amidase)基因,因而其降解苯甲腈生成苯甲酸是经腈水合酶/酰胺酶途径。PCR扩增En.meliloti ...
郭静静   +9 more
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罂粟与虞美人可待因-O-脱甲基酶基因克隆及序列分析

, 2019
CODM是可待因和吗啡生物合成过程中的关键酶,本实验以NCBI数据库中的可待因-O-脱甲基酶基因(codeine-O-demethylase,CODM)序列为参考,克隆得到了罂粟和虞美人的CODM核苷酸序列,并对二者进行序列比对及生物信息学分析。结果发现,罂粟CODM有3种基因型,而虞美人CODM有5种基因型;生物信息学分析显示所有CODM蛋白无信号肽序列,预测这些蛋白都为非分泌性蛋白,属于Pcbc superfamily超基因家族。罂粟CODM氨基酸序列相同,但在不同罂粟资源中的表达量有明显差异 ...
郝丹丹   +13 more
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猪 LPAR3 基因克隆及其在子宫内膜细胞的表达

, 2019
目的 获得猪LPAR3基因完整mRNA及基因结构,研究其启动子活性;探究LPAR3基因在子宫内膜的转录调控及可能影响母猪产仔的机制。 方法 应用5'RACE和3'RACE技术获取LPAR3基因完整mRNA序列;预测5'调控区潜在的启动子转录因子结合位点及CpG岛,构建不同长度的启动子双荧光素酶报告基因重组载体,与pRL-TK质粒共同转染至猪子宫内膜细胞,检测启动子活性;应用RT-qPCR比较LPAR3基因在妊娠第12天的二花脸猪和长大二元猪子宫内膜的相对表达量 ...
廖妙容   +17 more
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牙鲆 NTF3 基因克隆与表达分析

, 2021
陈志鹏   +4 more
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