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基于微卫星标记的藏原羚遗传多样性及亲缘关系分析

open access: yes野生动物学报
遗传多样性和亲缘关系的研究对于野生动物种群的健康维持和长久繁衍具有重要意义。为评估三江源国家公园长江源园区藏原羚(Procapra picticaudata)种群的遗传多样性,本研究共采集24个藏原羚集群的149份新鲜粪便样本,利用MB066、HDZ8、HDZ496等8个微卫星位点进行基因分型,最终识别出105个藏原羚个体,并利用性别鉴定引物确定其中有雌性77只,雄性28只。结果表明:8个微卫星位点的平均等位基因数为21.125,平均多态信息含量(PIC)为0.708,观测杂合度(Ho)为0.219~0.
李其琴   +4 more
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基于微卫星的大熊猫群体遗传多样性分析及亲子鉴定

open access: yes野生动物学报
为了探究秦岭大熊猫(Ailuropoda melanoleuca qinlingensis)圈养种群的遗传多样性和亲子关系,指导其科学繁育,本研究建立了一套优化的技术体系。利用筛选出的9个高分辨率微卫星位点(以四碱基重复为主)进行PCR扩增与毛细管电泳分型,并对32只个体进行遗传多样性分析。结果显示:通过均质化与热孵育预处理,显著提升了粪便样本中宿主基因组DNA的得率与质量。秦岭大熊猫群体Ho为0.281 ~0.938,平均为0.596,He为0.391 ~ 0.793,平均为0.560, Ho >
刘晨阳   +8 more
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基于微卫星标记的雪豹种群结构及遗传多样性

open access: yes野生动物学报
掌握雪豹(Panthera uncia)的遗传多样性信息对其保护和管理有重要意义。对104只雪豹个体的组织样品提取DNA,结合文献中提供的70个雪豹基因分型数据,利用9个微卫星多态性位点进行遗传多样性研究。结果显示:当样本量从70个增加到174个时,雪豹种群有分化为2个种群的趋势,即西北部群和中部群;共检测到45个等位基因(Na),中部、西北部2个种群平均每个位点Na分别为4.556和4.667,平均期望杂合度(He)分别为0.574和0.591,平均观测杂合度(Ho)分别为0.517和0.498 ...
周颖娜, 李金霖, 马跃, 王震
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羽翈中DNA和糖皮质激素共提取技术的研究

open access: yes野生动物学报
羽毛是鸟类研究、监测和管理中常用的非损伤性材料,可从中提取DNA和激素进行遗传和生理分析。然而,作为高度角化的组织,羽翈中的DNA和激素含量极低,提取较为困难。本研究开发一种能够从羽翈中同时提取总DNA和糖皮质激素的方法,命名为DH-CoEx。以丹顶鹤(Grus japonensis)、绿孔雀(Pavo muticus)为代表的大型鸟类廓羽、尾上覆羽和以栗鹀(Emberiza rutila)、小鹀(E.pusilla)为代表的小型鸟类飞羽、绒羽进行测试和评估。结果显示:DH ...
于梦佳   +9 more
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普通鸬鹚基因组微卫星分布规律研究

open access: yes野生动物学报, 2020
本研究对普通鸬鹚全基因组微卫星分布规律进行分析,结果表明:普通鸬鹚基因组中微卫星总个数为135 498个,总长度为2 304 711 bp。6种重复类型中,单碱基重复数量最多,为102 005个,占重复类型总数目的75.3%,其次是四、二、三、五、六碱基重复类型,分别占到总数的7.8%、6.9%、6.5%、3.0%、0.5% 。不同的拷贝类型在微卫星中重复拷贝类别数量有所差别,单碱基微卫星中A重复类型数量最多,所占比例为96.67%,其次是二碱基中AC最多、三碱基AAT最多、四碱基AAAC最多 ...
黄杰 1   +3 more
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基于微卫星标记的南白犀亲子鉴定

open access: yes野生动物学报, 2022
为了保证人工繁育的南白犀(Ceratotherium simum simum)种群能够健康长远发展,需要有详细准确的谱系记录,但是往往会存在子代亲生父亲不详的情况。通过亲子鉴定可以帮助确定子代亲生父本,从而获得准确的谱系记录。本研究在110只人工半散放南白犀群体中使用13个微卫星标记,对13个微卫星标记的多态性进行分析,计算非父排除概率和累积非父排除概率,结果显示:双亲已知时,13个位点的累积非父排除概率可达0.99以上,三联体父权分配时置信度可达到严格置信 ...
王予辰, 陈 莹, 王 宇, 金 煜
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中国南方食管鳞癌D5S107和D5S408杂合性丢失与微卫星不稳定性

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2008
【目的】研究中国南方食管癌高发地区(潮汕地区)食管鳞癌5号染色体长臂(5q)部分微卫星标记的杂合性丢失(LOH)和微卫星不稳定(MSI),为食管鳞癌相关抑癌基因的定位提供依据。【方法】采用PCR银染技术,检测58例配对食管鳞状细胞癌标本多个微卫星标记(D5S107;SHGS31088;D5S816;D5S625和D5S408)的杂合性丢失和微卫星不稳定。【结果】SHGS31088,D5S816和D5S625杂合性丢失率和微卫星不稳定都较低;而D5S107和D5S408的杂合性丢失率分别为48.5%和34.
李小东   +7 more
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Noninvasive genetic monitoring of Chinese pangolin (Manis pentadactyla) from Darjeeling district of Northwest Bengal, India 印度西孟加拉邦大吉岭地区中华穿山甲(Manis pentadactyla)的非损伤遗传监测

open access: yesWildlife Letters, Volume 1, Issue 1, Page 15-22, March 2023., 2023
Image of Chinese pangolin from study areas (top left), sampling location map (top right). Median joining network of Chinese pangolin population (size of circles represents the relative frequency of that haplotype present in the population). B) Demographic history of Chinese pangolin population estimated using Bayesian skyline plot.
Prajnashree Priyambada   +11 more
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Evaluating surrogates of genetic diversity for conservation planning

open access: yesConservation Biology, Volume 35, Issue 2, Page 634-642, April 2021., 2021
Abstract Protected‐area systems should conserve intraspecific genetic diversity. Because genetic data require resources to obtain, several approaches have been proposed for generating plans for protected‐area systems (prioritizations) when genetic data are not available. Yet such surrogate‐based approaches remain poorly tested.
Jeffrey O. Hanson   +9 more
wiley   +1 more source

DAM大气模型构建与验证

open access: yesKongjian kexue xuebao, 2023
根据热层物理、经验模型原理和代码分析,研究模型构建方法。进而剖析国内热层大气探测和热层模型构建现状,提出存在的困难和未来的发展思路。以GOST模型为基础,分析模型的工作机制、地磁扰动期大气密度预报误差来源和密切相关的模型系数,推导模型密度对相关模型系数的偏导数矩阵。利用天基实测密度,有针对性地构建磁暴期大气模型(DAM)。并通过独立于建模的实测密度数据,验证DAM模型性能。统计发现,地磁活动指数Ap介于100~132时GOST, MSIS00和DAM模型的相对误差均值依次为64.32%,–176.72%,
刘 卫   +5 more
doaj   +1 more source

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