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野生动物学报, 2017 对虎皮鹦鹉(Melopsittacus undulatus)全基因组中微卫星分布特征进行了分析,查找到l～6个碱基重复类型的微卫星序列共90 346个,约占整个基因组总长度的序列(1.1 Gb)的0.41%,分布频率为82.9/Mb。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为50 349个,占总数的55.7%; 其次是二、四、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的16.3%,13.7%,10.8%,2.9%,0.5%。单碱基微卫星中A重复类型数量最多,二碱基中AT最多,三碱基中AAT ...
黄 杰 原宝东 杨承忠
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, 2012 目的筛选稀有鮈鲫HAN近交系遗传质量检测标记。方法采用鳞片活体移植和同工酶聚丙烯酰胺凝胶电泳法对稀有鮈鲫HAN近交系的遗传纯度进行检测。结果在免疫标记分析中,鳞片同体移植存活率为96.7%以上,野生群体移植存活率为7.4%,而HAN系F22鳞片异体移植的成功率为80%,显著高于野生群体。在生化标记分析中,在HAN系F22中无多态性位点,不同个体的同工酶谱呈现高度一致,在野生群体中有2个多态位点即est2和est3,多态位点的比例为15.56%。结论经过多代近亲交配 ...
曹文宣, 王伟, 王剑伟, 邵燕
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野生动物学报, 2007 为了建立有效的东北马鹿个体识别体系,从12对加拿大马鹿的微卫星引物和6对黑尾鹿的微卫星引物中,筛选出8个具有多态性的微卫星位点。各位点的观察杂合度为0．3314～0．8174,平均杂合度为0．6243;各位点的匹配率为0．0656～0．5130,累计匹配率为1．446×10-6;各位点的识别率为0．4870～0．9344,累计个体识别能力为0．9999。这8个微卫星位点可以准确地进行东北马鹿的个体识别分析。
尹君, 张明海, 谢绪昌
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, 2012 中国水产养殖的成就已被认为是中国对当今世界发展的一个重大贡献.近20年来,基因组学和其他遗传技术的进步显著推动着水产动物分子生物学和遗传育种学基础研究的发展.进入21世纪后,一些主要水产动物的全基因组测序已经完成或接近完成.本文综述了包括基因组技术、体细胞核移植和干细胞技术在内的水产遗传改良技术的一些重要突破性进展,概述了包括生殖、性别、生长、抗病、耐寒和耐低氧这些重要经济性状的分子基础,列出了一系列与这些经济性状相关的候选基因.最后,介绍了几个特别是中国水产动物遗传改良在水产养殖中的应用事例 ...
朱作言, 桂建芳
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Gene structure analysis and differentially splicing between Plasmodium yoelii subspecies [PDF]
, 2016 啮齿类动物约氏疟原虫（Plasmodiumyoelii）是研究宿主-寄生虫相互关系和疟原虫病理分子基础的一种重要的动物模型。尽管约氏疟原虫YM虫株的基本基因组信息已被测定，在最近也有许多啮齿类动物疟原虫的RNA-seq序列信息已见报道，但不同疟原虫品系或者亚种之间可能存在基因编码区及mRNA转录结构上的差异。构建多种疟原虫品系和亚种的cDNA文库将有助于我们对疟原虫遗传模式和转录组结构的认识。 本研究，我们用约氏疟原虫NSM虫株有或无MQ药物压力的红内期原虫样本构建了两个cDNA文库并对其进行深度测序 ...
刘建文
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野生动物学报, 2019 大型猫科动物是顶级捕食者，它的存在依赖该地区的整个生态系统，也可以对整个地区的生态系统直接或间接产生强烈的影响。种群遗传学是保护遗传学的一个重要组成部分，对于野外种群来通过种群遗传学研究能了解种群的遗传多样性，种群大小，遗传结构等诸多信息。微卫星标记方法结合非损伤性取样方法在野生大型猫科动物保护遗传学的研究中有着重要地位，它具有诸多优点，广泛应用于种群遗传多样性、个体识别、亲缘关系鉴定等方面的研究。本文回顾大型猫科动物与微卫星标记方法的应用，虽然目前微卫星标记方法仍然具有一定的局限性，但是随着技术的发展，
王萌 1 朱思雨 2 薛茂盛 3 刘霖 3 任迎丰 3 李立新 3 许青 1 姜广顺 1
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Isolation, characterization and application of microsatellite markers in Mud crab, Scylla paramamosain [PDF]
, 2009 摘要 本研究以拟穴青蟹（Scyllaparamamosain）为研究对象，探讨了青蟹微卫星标记的筛选和评价及微卫星标记在青蟹种群遗传学研究和亲缘关系鉴定中的应用。 1.拟穴青蟹微卫星标记的筛选和表征 本研究采用改进的FIASCO法构建了拟穴青蟹微卫星富集文库获得1500多个单克隆菌落，随机挑取600个克隆测序，得到502个序列。使用ClastalX比对除去重复序列后，得到383条独特序列，其中阳性克隆有363条，阳性率为94.78%。对其中257个序列成功设计了271对引物 ...
许晓军
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, 2019 运用微卫星标记技术,选用8对微卫星引物对厦门市5个凡纳滨对虾亲虾群体(ZA1、HN、ZA2、ZP、DS)进行遗传多样性分析。结果显示,8对微卫星引物在5个凡纳滨对虾亲虾群体中共检测到75个等位基因,各群体的平均等位基因数(Na)为3. 875～7. 000、平均有效等位基因数(Ne)为2. 632～3. 719、平均PIC值范围在0. 498～0. 624。平均观测杂合度(Ho)为0. 410～0. 562、平均期望杂合度(He)为0. 589～0. 687。各群体的平均近交系数(Fis)为0. 147～
李天骄 +6 more
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野生动物学报, 2020 黄颊长臂猿属于IUCN濒危物种，仅分布于老挝、越南和柬埔寨。该物种微卫星的研究尚未报道。本研究，对黄颊长臂猿SSR位点进行筛选，并对南京地区圈养黄颊长臂猿种群进行了遗传多样性分析，统计了等位基因数、有效等位基因数，计算了群体杂合度、多态信息含量（PIC）、亲缘系数等参数。结果显示，共获得黄颊长臂猿11个多态性微卫星位点，等位基因数在2—5之间，多态信息含量为0.175—0.701，观测杂合度（Ho）为0.067—0.8，期望杂合度（He）为0.191—0.770，其个体间亲缘系数普遍偏高 ...
陈蓉吕, 冉程家, 求傅, 兆水
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Study on the Population Genetics of Pseudosciaena crocea and Phylogenetic Perspective in Sciaenidae with Microsatellites [PDF]
, 2008 大黄鱼（Pseudosciaenacrocea）是我国重要的海水养殖鱼类，研究其不同群体的遗传结构对促进大黄鱼资源的保护和开发具有重要意义。本文通过建立大黄鱼小片段基因组文库，应用PCR技术快速筛选含(CA)n及(GA)n微卫星序列的克隆，共得到32个含微卫星序列的阳性克隆，选择核心序列重复次数较多的14个序列登录GenBank。应用所得微卫星序列的侧翼区设计引物，对大黄鱼样品进行扩增，得到8对（PC1C4，PC4H12，PC5E11，PC7A2，PC7H4，PC8F5，PC10F10，PC10G6 ...
林能锋
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