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脊尾白虾( Exopalaemon carinicauda )回交家系遗传变异的微卫星分析
, 2017为解析脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)回交家系的遗传变异规律，本研究利用自行开发的25个微卫星标记对本实验室构建的A、B、C 3个回交家系的遗传结构特征进行了分析。结果显示，回交家系A、B、C的平均等位基因数(Na)分别为2.21、2.18、2.09，观测杂合度(Ho)分别为0.3805、0.3703、0.2489，期望杂合度(He)分别为0.3629、0.3998、0.2503，多态信息含量(PIC)分别为0.3257、0.3391、0.2585 ...
刘九美 +11 more
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单环刺螠( Urechis unicinctus )微卫星标记开发及5个地理种群遗传结构分析
, 2017采用高通量测序法从单环刺螠基因组中开发微卫星标记，并通过一个秦皇岛单环刺螠野生群体对其进行多态性评价，利用获得的多态性引物对秦皇岛、烟台、潍坊、青岛、大连5个不同海区的野生单环刺螠群体进行了遗传多样性及遗传结构分析。结果表明：本实验设计的50个微卫星标记能稳定扩增的有38个，其中22个微卫星位点在5个群体中均表现为高多态性，等位基因数（Na）介于24-44之间，多态信息含量（PIC）介于0.921-0.967之间。5个群体总的平均有效等位基因数（Ne）范围为6.629-8.850，平均观测杂合度（Ho ...
常城 +17 more
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脊尾白虾( Exopalaemon carinicauda )近交系3个家系33个微卫星座位的遗传分析
, 2017本研究以人工控制条件下采用兄妹交配方式建立的脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)近交系为实验材料，利用33个微卫星座位对近交系3个家系进行了遗传检测。统计各家系的等位基因组成，计算等位基因数(N)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、平均基因纯合率等遗传参数，利用基因频率计算家系间的遗传距离，并进行聚类分析。结果显示，33个微卫星基因座上共检测到72个等位基因，总群体平均N、H、PIC分别为2.758、0.294、0.272；3个家系的平均N、H、PIC分别为2.258、0 ...
王日芳 +9 more
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基于de novo高通量测序的曼氏无针乌贼( Sepiella japonica )ESTs中微卫星位点筛选与特征分析
, 2017对均一化转录组测序获得的47604个曼氏无针乌贼的微卫星序列进行分析，结果表明，乌贼转录组中微卫星位点丰富，每1402nt的EST中就有一段不小于12nt长度的微卫星序列。单碱基重复是EST微卫星序列的主要形式（38.69%），其次依次为三碱基（31.14%）、二碱基（26.35%）、四碱基（3.29%）、五碱基（0.38%）、六碱基（0.14%）重复，短序列类型占微卫星总量的96.18%。同碱基类型的微卫星序列组成又存在差异，AC（54.51%）和AG（31.22%）是最常见的二碱基重复序列；而AGC（
吕振明 +15 more
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, 2017
肺癌的早期发现和诊断是治疗的关键所在。外周血肿瘤标志物的检测具有无创伤、可重复、费用低等优点是肺癌诊断和随访的理想手段。微卫星 DNA（microsatellite，MS）是指以少数几个核苷酸为单位多次串联重复的 DNA 序列。微卫星异常主要表现为微卫星不稳定性（microsatellite instability，MSI）和杂合性丢失（loss of heterozygosity，LOH）。微小 RNA（microRNA，miRNA）是一种非编码蛋白的 RNA，参与转录后水平基因的表达调控。近年来 ...
沈诚, 周坤, 李双江, 车国卫
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肺癌的早期发现和诊断是治疗的关键所在。外周血肿瘤标志物的检测具有无创伤、可重复、费用低等优点是肺癌诊断和随访的理想手段。微卫星 DNA（microsatellite，MS）是指以少数几个核苷酸为单位多次串联重复的 DNA 序列。微卫星异常主要表现为微卫星不稳定性（microsatellite instability，MSI）和杂合性丢失（loss of heterozygosity，LOH）。微小 RNA（microRNA，miRNA）是一种非编码蛋白的 RNA，参与转录后水平基因的表达调控。近年来 ...
沈诚, 周坤, 李双江, 车国卫
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长牡蛎（Crassostrea gigas）壳宽快速生长选育群体遗传多样性及遗传结构的微卫星标记分析
, 2016为了监测长牡蛎（Crassostrea gigas）在选育过程中的遗传变异、分析选育对其遗传结构的影响,本研究以选育目标为壳宽快速生长的长牡蛎为实验材料,利用微卫星（Simple Sequence Repeats）标记技术,对长牡蛎基础群体（P0）和连续两代选育群体（F1和F2）进行遗传多样性评估。结果发现,所有微卫星位点在3个群体中都表现出了较高的多态性,P0、F1和F2代群体的平均等位基因数分别为16.5、12.2和12.8;P0、F1和F2代群体多态性信息含量（Pic）的平均数值分别为0.9068、
张荣良 +5 more
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凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）微卫星多重PCR体系的建立及其在家系亲权鉴定中的应用
, 2016为了在遗传分析研究中提高效率并节约成本,本研究从已报道的凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）微卫星位点中选取多态性较高的位点,基于各位点的扩增片段大小及退火温度等因素进行微卫星位点的组合。通过不断优化位点组合、反应体系及反应程序,成功建立了1个五重、2个四重和1个三重PCR反应体系,并将其应用于11个凡纳滨对虾家系的亲权鉴定。结果显示,四组多重PCR体系中的16个微卫星位点在11个凡纳滨对虾家系中的平均等位基因数（Na）为6,平均多态信息含量（PIC）为0.5813,平均观测杂合度 ...
李东宇 +6 more
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尼罗罗非鱼（♀）×萨罗罗非鱼（♂）杂交F 2 与F 3 群体遗传特征的微卫星分析
, 2016利用罗非鱼第二代遗传连锁图谱中微卫星标记对尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）（♀）×萨罗罗非鱼（Sarotherodon melanotheron）（♂）杂交后代F_2、F_3群体遗传特征进行了初步比较分析。结果显示,28对引物中有22对引物能有效扩增,未观察到杂交后代F_2、F_3中有多倍体个体现象。筛选出7个在尼萨罗非鱼杂交后代F_2、F_3群体中存在差异的位点。杂交F_2群体平均等位基因（Na）为2.71,平均多态信息含量（PIC）为0.466,平均观测杂合度（Ho）为0 ...
魏继海 赵金良 吴俊伟 罗明坤 叶卫 符云 陈辉崇
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梭鱼(Liza haematocheila) 4个野生地理群体遗传多样性的微卫星分析
, 2016利用14对微卫星引物,对采捕于辽宁葫芦岛、山东青岛、江苏连云港以及浙江舟山附近海域的梭鱼（Liza haematocheila）4个野生地理群体进行群体遗传多样性分析。结果显示,14对微卫星引物均能扩增出清晰的条带且具有一定的多态性,4个野生群体的多态性百分率分别为92.86%、92.87%、100.00%和85.71%。4个群体共扩增出61个等位基因,4个群体的等位基因数为3.786-4.000,有效等位基因数为2.673-2.899,观测杂合度为0.359-0.389,期望杂合度为0.503-0 ...
毛守康 +9 more
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, 2016
为了解虾虎鱼科（Gobiidae）鱼类基因组遗传结构特征,本研究自主开发矛尾复虾虎鱼（Synechogobius hasta）微卫星序列153条,结合从Gen Bank中筛选出的虾虎鱼科微卫星序列535条,合计686条微卫星序列,隶属于19种虾虎鱼,序列总长度为295062 bp,包含473个微卫星位点,微卫星位点累计长度为33370 bp。统计微卫星重复类型,发现在所有微卫星重复类型中以二碱基重复出现次数最多,位点数为361个,占总微卫星的76.32%,其中,重复拷贝类别最多的是AC（340个 ...
白翠翠, 柳淑芳, 庄志猛
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为了解虾虎鱼科（Gobiidae）鱼类基因组遗传结构特征,本研究自主开发矛尾复虾虎鱼（Synechogobius hasta）微卫星序列153条,结合从Gen Bank中筛选出的虾虎鱼科微卫星序列535条,合计686条微卫星序列,隶属于19种虾虎鱼,序列总长度为295062 bp,包含473个微卫星位点,微卫星位点累计长度为33370 bp。统计微卫星重复类型,发现在所有微卫星重复类型中以二碱基重复出现次数最多,位点数为361个,占总微卫星的76.32%,其中,重复拷贝类别最多的是AC（340个 ...
白翠翠, 柳淑芳, 庄志猛
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