Characterization of the expression patterns, transcriptional regulation, antimicrobial mechanisms and immune activities of SpHyastatin from Scylla paramamosain [PDF]
拟穴青蟹(Scyllaparamamosain),简称青蟹,是我国东南沿海重要的经济养殖蟹类。迄今已有报道抗菌肽在青蟹抵抗海洋环境中病原微生物的入侵感染方面具有重要作用。抗菌肽广泛存在于自然界的生物中,是动物先天性免疫系统中的重要组分。自1996年甲壳类抗菌肽首次在岸蟹(Carcinusmaenas)中报道以来,已有几种抗菌肽在蟹类血淋巴系统和生殖系统中被发现,它们是蟹类重要的免疫因子。因此,青蟹中新抗菌肽的揭示对于深入阐明其免疫机制及其在复杂的环境中健康生存具有重要的科学意义和应用价值 ...
单忠国
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【目的】应用生物信息学方法探讨脂多糖(LPS)诱导小鼠急性肺损伤(ALI)的相关基因,为阐明ALI 的发病机制提供新思路。【方法】从NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(GeneExpressionOm? nibus)下载基因芯片数据集GSE2411、GSE17355和GSE18341,使用在线分析工具GEO2R筛选出正常肺组织与急 性肺损伤组织的差异表达基因。筛选出的差异表达基因利用在线数据库DAVID进行功能注释(GO)和通路分析 (KEGG ...
李金河, 刘友坦, 梁青春
doaj
[Exploring the Role of DKK1 in the Occurrence of Lung Adenocarcinoma Based on the Analysis of Bioinformatics]. [PDF]
Lu R, Li Y, Xieyidai A, Yu T, Feng Y.
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Studies on the small neuropeptide: RPCH and ENK, their function of reproductive regulation in the mud crab, Scylla paramamosain (Estampador, 1949) [PDF]
拟穴青蟹(Scyllaparamamosain)是我国东南沿海重要的经济蟹类。本文以拟穴青蟹为研究对象,采用动物生理学、分子生物学、生物信息学等方法和手段,研究了3种小分子神经肽即红色素聚集激素(Redpigmentconcentratinghormone,RPCH)、亮氨酸-脑啡肽(Leucineenkephalin,Leu-ENK)和甲硫氨酸-脑啡肽(Methionineenkephalin,Met-ENK)的结构、特征和生殖调控功能。主要结果如下: (1 ...
曾慧
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[Bioinformatics analysis of primary biliary cholangitis key genes and molecular mechanisms]. [PDF]
Chen QL, Qiao F, Lu WT, Shi HL, Zhou CX.
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Study on the Roles of Long Noncoding RNA HCAL in Hepatocellular Carcinoma [PDF]
【背景】 原发性肝癌是最常见的恶性肿瘤之一,是我国发病率和死亡率均排名第二的恶性肿瘤。原发性肝癌中,大部分为肝细胞肝癌(简称肝癌)。虽然肝癌的诊断及手术切除、放化疗等治疗手段取得了很大的进步,但肝癌患者总体的生存率仍不理想。近年来,对肝癌的分子生物学机制进行了多方面的研究,并证实肝癌的发生发展伴随着一系列分子表达的失调及信号通路的异常。因此,从分子水平深入探讨肝癌发生发展及转移的机制,对寻找早期诊断、预测预后的生物标志物和治疗的分子靶点具有重要的临床意义。 长链非编码RNA ...
谢程融
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肾透明细胞癌Caki-1细胞系差异表达基因的生物信息学分析 [PDF]
目的比较肾透明细胞癌Caki-1细胞系与正常肾上皮细胞系ASE-5063中的差异表达基因(DEGs),寻找潜在的肾透明细胞癌特异性分子标志物。方法利用GEO数据库自带的GEO2R在线分析工具分析基因芯片GSE78179,将筛选出的DEGs分别导入Metascape、STRING以及Cytoscape进行综合分析并筛选出核心基因。最后使用Fun Rich等软件对筛选出的核心基因进行GO和KEGG富集分析。结果共筛选出562个DEGs,其中上调基因345个,下调基因217个 ...
朱合欢 +5 more
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Construction of endogenous RNA regulatory network for colorectal cancer based on bioinformatics. [PDF]
Li Y, Yuan F, Lin Z, Pan Y.
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Research on DNA Sequential Pattern Mining Methods and their Applications [PDF]
生物信息学是指由生命科学与数学、计算机科学等交汇融合所形成的一门交叉学科,旨在掌握负责生命现象的形成模式与演化规律。随着生物信息学相关技术的发展,各类生物数据以惊人的速度不断增长。此外,生物数据有其自身的特点,并承载着生命演化等信息。因此,如何对庞大的生物数据进行分析,并发现有价值的具有生物学意义的信息是当前研究的一个重点课题。 数据挖掘,作为一种十分有效的数据分析手段,已经被广泛应用到当今社会的各个领域。将序列模式挖掘技术应用在DNA序列数据分析处理上已经成为生物信息学研究中的一个热点 ...
李晟
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Proteomic Response of Prorocentrum donghaiense to Phosphorus Depletion and Resupplement [PDF]
磷(Phosphorus,P)是海洋浮游植物生长的限制因子,影响海洋初级生产力。东海原甲藻(Prorocentrumdonghaiense,P.donghaiense)是引起我国近海有害藻华的主要甲藻。目前有关磷对甲藻生长影响的研究已有很多报道,但主要集中在生理生态层面,对甲藻在磷限制条件下及其补充响应的分子机理方面了解较少。 本论文以P.donghaiense为研究对象,运用基于质谱的定量蛋白质组学技术—串联质谱标记(Tandemmasstag,TMT),并结合相应的转录组数据,比较研究了P ...
袁春娟
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