基于蛋白质组学技术探讨7-羟乙基白杨素防治高原脑水肿的作用靶点 [PDF]
浙江大学学报. 医学版目的 研究7-羟乙基白杨素（7-HEC）治疗大鼠高原脑水肿的作用靶点及机制。 方法 54只雄性Wistar大鼠随机分为正常对照组、模型对照组和7-HEC组，每组18只。后两组于实验第4天置于模拟7000
张 冬梅 +5 more
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[Tandem mass tag-based quantitative proteomics analysis of plasma and plasma exosomes in Parkinson's disease]. [PDF]
Se Pu, 2023 外泌体是一类可由各种细胞在生理和病理条件下释放的细胞外囊泡,其携带了多种生物活性分子,是疾病标志物的良好载体。目前,帕金森病(Parkinson’s disease, PD)的诊断主要依靠临床表现,缺乏客观的疾病诊断标志物。因此,新型外周血特异性标志物的开发将有助于PD的早期筛查与诊疗。在本研究中,选取PD患者与正常对照人群的血浆及血浆外泌体作为研究对象,采用基于串联质量标记(tandem mass tag, TMT)的液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术对其进行定量蛋白质组学分析 ...
Zhao Y +5 more
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[Advances in high-throughput proteomic analysis]. [PDF]
Se Pu, 2021 基于质谱的蛋白质组学技术已经日趋成熟,可以对细胞和组织中的成千上万种蛋白质进行全面的定性和定量分析,逐步实现“深度覆盖”。随着生物医学日益增长的大队列蛋白质组学分析需求,如何在保持较为理想的覆盖深度下实现短时间、快速的“高通量”蛋白质组学分析已成为当前亟需解决的关键问题之一。常规的蛋白质组学分析流程通常包括样品前处理、色谱分离、质谱检测和数据分析。该文从以上4个方面展开介绍近10年以来高通量蛋白质组学分析技术取得的一系列研究进展,主要包括:(1)基于高通量、自动化移液工作站的蛋白质组样品前处理方法;(2)
Wu Q, Sui X, Tian R.
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[Applications of high performance liquid chromatography-mass spectrometry in proteomics]. [PDF]
Se Pu蛋白质组学研究在生物医学领域发挥了重要作用,然而研究面临的主要难点在于其研究对象的复杂性和多样性。随着质谱技术的快速发展,高效液相色谱-质谱(HPLC-MS)分离分析复杂生物样品已经成为蛋白质组学研究的基础工具。蛋白质组学的研究从肽段分离,延伸到蛋白质和蛋白质复合物的分离,随着分析物的分子质量不断增大,其结构和组成复杂性也持续增加,分子特性也发生改变。面对不同的蛋白质组学研究对象,选择不同的分离模式、分离条件以及固定相参数是进行深度蛋白质组学研究的关键。本文综述了实验室常用的液相色谱分离模式 ...
Liu W, Weng LX, Gao MX, Zhang XM.
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[Isolation and proteomics analysis of cerebrospinal fluid exosome subtypes]. [PDF]
Se Pu外泌体是一类尺寸为30~200 nm、携带有蛋白质等生物活性物质的细胞外小囊泡,能够分为具有不同功能的亚群,对外泌体异质性的了解有助于研究其在生理和病理中的作用机制。脑脊液来源的外泌体作为疾病的生物标志物具有巨大潜力,但是相关蛋白质组学的研究报道较少,且缺乏对脑脊液外泌体亚群的研究。本研究发展了串联体积排阻色谱法用于分离脑脊液外泌体亚群,并结合纳升级液相色谱-捕集离子淌度飞行时间质谱联用技术(nanoLC-TIMS-TOF-MS),对创伤性脑损伤患者的外泌体亚群进行了蛋白质组学分析。结果表明 ...
Chen XF +6 more
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[Isolation and proteomic analysis of bacterial outer membrane vesicle subpopulations]. [PDF]
Se Pu外膜囊泡(OMVs)是革兰氏阴性细菌分泌的20~400 nm的具膜囊泡状小体,在毒性物质传递和免疫逃逸等过程中发挥重要功能。尽管许多研究已经揭示了OMVs的关键作用,但是OMVs自身存在的异质性限制了我们对其蛋白质组成和功能的深入研究。因此,对OMVs异质性亚群的组成及其生物学功能开展研究具有重要意义。本研究采用超速离心结合密度梯度离心,对大肠杆菌DH5α和铜绿假单胞菌PAO1分泌的OMVs进行了系统的分离和表征,并结合定量蛋白质组学技术对其进行了全面分析。首先 ...
Yu PJ, Zou X, Wu Y, Li ST, Xiao H.
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[High-resolution Differential Proteomic Analysis of Mouse Secondary Oocytes and First Polar Bodies]. [PDF]
Sichuan Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban目的 通过高分辨率单细胞蛋白质组学技术对小鼠次级卵母细胞与第一极体的蛋白质组差异进行分析，筛选出调控胚胎发育的关键特征蛋白，为优化卵母细胞体外成熟体系提供分子依据。 方法 采用高分辨率单细胞质谱仪（timsTOF HT）对5组配对样本（次级卵母细胞与第一极体）进行蛋白质组检测，通过定量分析结合生物信息学方法完成差异蛋白筛选及功能富集分析。 结果 该技术实现单样本3 000余种蛋白质的检测灵敏度，并成功鉴定出277种次级卵母细胞特异性表达蛋白。基因集富集分析（Gene Set Enrichment ...
Fan X, Zhou L.
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[Vacuum ultraviolet laser dissociation and proteomic analysis of halogenated peptides]. [PDF]
Se Pu化学修饰在蛋白质组学定量和相互作用分析等研究领域应用广泛。本工作发展了一种针对复杂组织提取蛋白质酶解样品的多肽溴化、碘化光化学修饰新方法,实现了酪氨酸、组氨酸、色氨酸位点的高效溴化和酪氨酸、组氨酸位点的高效碘化修饰。进一步采用193 nm真空紫外激光解离(UVPD)串联质谱技术对光化学溴化和碘化标记后的鼠肝酶解肽样品进行了序列、修饰位点和光解离机制分析。由于Br和I原子对193 nm紫外光子的强吸收特性,193 nm UVPD可引起卤化位点的C-Br/C-I键断裂并产生多肽自由基离子 ...
Luo P, Xue JY, Liu ZY, Wang FJ.
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[Efficient capture and proteomics analysis of urinary extracellular vesicles by affinity purification]. [PDF]
Se Pu目前,液体活检因其创伤小、易获取且操作简便的优点,已成为癌症诊断中传统组织活检的替代方法。尿液来源的细胞外囊泡(extracellular vesicles, EVs)已被确定为癌症生物标志物的重要来源。EVs是由细胞分泌的磷脂双分子层囊泡,内含蛋白质、DNA及RNA等成分,且由于双层磷脂膜的保护,EVs内的蛋白质可免受体液中酶的降解。然而,在蛋白质组学分析中,低产率使得从生物体液中分离EVs仍是一个挑战。在本研究中,我们采用亲和磁珠EVlent对尿液中的EVs进行富集 ...
Zhang GY, Zhan Z, Tao WG, Zhang H.
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[Enriching plasma exosomes for proteomic analysis using a phosphatidylserine-imprinted polymer]. [PDF]
Se Pu外泌体是肿瘤标志物的重要来源,血浆作为最常用的临床体液之一,其组成较为复杂且存在大量高丰度蛋白质的干扰,如何有效地从血浆中分离外泌体是临床研究的重要挑战之一。本研究将磷脂酰丝氨酸分子印迹聚合物(PS-MIP)用于血浆外泌体的富集,PS-MIP能够特异性识别外泌体质膜上的磷脂酰丝氨酸,从而实现外泌体的高选择性富集。该方法被用于3例健康志愿者和3例胰腺癌患者的血浆蛋白质组学分析和潜在肿瘤标志物的筛选,在健康对照组中的血浆外泌体中鉴定到了1052种蛋白质和4545条肽段 ...
Cheng XH +4 more
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