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ProtCool 2.0: um gerador de protocolo para ancoragem e simulações de dinâmica molecular em complexos proteína-ligante em versão web

Anais Estendidos do XXIII Simpósio Brasileiro de Computação Aplicada à Saúde (SBCAS 2023), 2023
A pandemia de COVID-19 deixou evidente a alta demanda por sistemas computacionais que agilizem a indicação de novos fármacos. Nesse sentido, compreender o comportamento dinâmico de complexos biomoleculares é algo fundamental.
M. Souza, L. M. Magny, F. C. Guedes, C. Silveira   +3 more
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DINÂMICA MOLECULAR DE GRAFENO BICAMADA 9X4Y TURBOSTRÁTICO EM ÁGUA

Revista Gestão e Conhecimento, 2022
O grafeno formado por bicamadas pode-se dispor em folhas alinhadas em ziguezague ou armchair, com diferentes propriedades. Este trabalho apresentou o estudo da dinâmica molecular de uma configuração de grafeno disposto em armchair, desenvolvida para o ...
Keli Cristina Barbosa Dos Reis, A. B. Lima, R. R. Faria, Lourival Rodrigues de Souza, Odonírio Abrahão Júnior   +4 more
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Relaciones de estructura-función en la P-glicoproteína humana (ABCB1): Perspectivas de las simulaciones de dinámica molecular

Magna Scientia UCEVA, 2022
La glicoproteína P (P-gp) es una proteína transmembrana que pertenece a la superfamilia de transportadores del cassette de unión a ATP, y es una bomba de eflujo xenobiótico que limita la acumulación intracelular de fármacos mediante el bombeo de ...
Liadys Mora Lagares, Yunierkis Pérez Castillo, Nikola Minovski, Marjana Noviˇc   +3 more
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(Ro)vibrational Spectroscopic Constants, Lifetime and QTAIM Evaluation of Fullerene Dimers Stability

Molecules, 2023
The iconic caged shape of fullerenes gives rise to a series of unique chemical and physical properties; hence a deeper understanding of the attractive and repulsive forces between two buckyballs can bring detrimental information about the structural ...
Rodrigo A. Lemos Silva, Mateus R. Barbosa, Caio R. Martins, Daniel F. Scalabrini Machado, Luciano Ribeiro, Heibbe C. B. de Oliveira, Demétrio A. da Silva Filho   +6 more
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Interações não covalentes entre SI-PPCs e biomoléculas: um estudo por simulações de dinâmica molecular

, 2021
Varios estudos com complexos polinucleares de platina (II) inertes para substituicao (SI-PPC) tem sido sintetizados nos ultimos anos devido a forma de ligacao ao DNA apresentada por esses compostos.
Nathália M. P. Rosa
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Theoretical study of the interaction of fullerenes with the emerging contaminant carbamazepine for detection in aqueous environments

Scientific Reports, 2022
The global increase in drug consumption exposes the growing need to develop new systems for the detection, capture, and treatment of bioactive molecules.
Rodrigo A. Lemos Silva, Daniel F. Scalabrini Machado, Heibbe C. B. de Oliveira, Luciano Ribeiro, Demétrio A. da Silva Filho   +4 more
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Differential Effect of Solution Conditions on the Conformation of the Actinoporins Sticholysin II and Equinatoxin II

Anais da Academia Brasileira de Ciências, 2014
Actinoporins are a family of pore-forming proteins with hemolytic activity. The structural basis for such activity appears to depend on their correct folding.
EDSON V.F. FAUTH, EDUARDO M. CILLI, RODRIGO LIGABUE-BRAUN, HUGO VERLI   +3 more
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Structure-Guided Computational Approaches to Unravel Druggable Proteomic Landscape of Mycobacterium leprae

Frontiers in Molecular Biosciences, 2021
Leprosy, caused by Mycobacterium leprae (M. leprae), is treated with a multidrug regimen comprising Dapsone, Rifampicin, and Clofazimine. These drugs exhibit bacteriostatic, bactericidal and anti-inflammatory properties, respectively, and control the ...
Sundeep Chaitanya Vedithi, Sony Malhotra, Marta Acebrón-García-de-Eulate, Modestas Matusevicius, Pedro Henrique Monteiro Torres, Tom L. Blundell   +5 more
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Determinação das características estruturais e mecânicas da liga de alta entropia Hf-Nb-Ta-Zr

Vetor, 2021
Neste artigo, os comportamentos estrutural e mecânico da liga equiatômica de alta entropia Hf-Nb-Ta-Zr foram estudados mediante simulações computacionais de dinâmica molecular.
Jhonatan Silva Andrade, Ivan Napoleão Bastos, Luis César Rodríguez Aliaga   +2 more
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Dinâmica molecular: teoria e aplicações em planejamento de fármacos

Eclética Química, 2018
Molecular dynamics (MD) is a powerful computational tool used for rational drug design in medicinal chemistry. MD is an extension of Molecular Mechanics, where the dynamic behavior of a molecular system is simulated through numerical integration of the ...
Adriana Mieco Namba, Vinícius Barreto da Silva, Carlos Henrique Tomich de Paula da Silva   +2 more
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