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茎瘤芥是十字花科芸薹属植物的变种.本研究在前期的转录组测序和数字基因表达谱(DGE)测序的基础上进一步对榨菜的根组织进行了测序和分析.通过高通量RNA-Seq测序我们获得了高质量的数字基因表达谱数据超过一千万条,其中有约71%能比对到参考基因序列上.我们将根组织的数字基因表达谱数据与榨菜瘤茎膨大过程中的3个时期的数字基因表达谱数据进行了比较,获得了共有的(3组差异表达基因的交集)差异表达基因共3594个,对这些差异表达基因的表达趋势可以分为8个簇.同时对这些差异基因进行代谢途径的功能注释 ...
孙全 +5 more
doaj
本硕士学位论文主要报道了两种功能化磁性纳米粒子的制备,以及用其分别对中药材进行体外代谢和活性成分富集分离的一系列有意义的结果。 本学位论文主要内容如下: 第一章为肝微粒体功能化的磁性生物反应器用于中药材的体外代谢分析。将大鼠肝微粒体固定在磁性纳米材料表面,构建了一个反应活性好,可以重复利用的肝微粒体功能化的磁性生物反应器(LMMNPs);然后用其对中药材白芷进行体外代谢研究。首先,将白芷中的两种主要活性物质--欧前胡素和异欧前胡素分别与LMMNPs进行孵育代谢,利用HPLC ...
石海利
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谷胱甘肽还原酶影响结肠癌代谢及预后:一项基于蛋白组学与微阵列芯片分析的研究
目的 探讨谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase, GSR)对结肠恶性肿瘤代谢的影响及其对结肠癌患者的预后价值。方法 通过蛋白组学差异分析获得结肠癌组织和正常结肠上皮组织的差异蛋白,并通过富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)分析鉴定代谢通路中的关键蛋白,进行生存分析和临床信息相关性分析。收集120例结肠癌患者手术病理标本制作组织微阵列芯片,进行免疫组织化学染色。结果 蛋白组学差异分析共鉴定出1 209个差异表达蛋白。KEGG富集分析显示,差异蛋白显著富集于代谢通路 ...
吴惧 +4 more
doaj
本发明公开了一种水稻代谢轮廓分析及代谢差异研究的方法,采用液相色谱-质谱联用技术对水稻种子提取物进行分析得到水稻代谢轮廓谱,然后用多变量统计方法研究转基因水稻和非转基因水稻的代谢轮廓数据的整体差异,并发现对代谢表型差异有重要贡献的化合物,为转基因水稻的非预期效应和安全性评价提供依据。本发明的分析方法简单,快速,重复性好,适合于实际样品的批量分析 ...
赵春霞 +5 more
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为探究鹿源彭氏变形杆菌(Proteus penneri)致病及耐药机制,利用二代测序技术对从云南野生动物园病死梅花鹿(Cervus nippon)肺组织中分离鉴定出的1株彭氏变形杆菌F2d株进行基因组测序,将获得的F2d株基因组序列注释到毒力因子、耐药基因和代谢通路等数据库中。毒力因子数据库注释结果显示,菌株含黏附、营养代谢、运动和免疫调节等类型毒力因子;耐药基因数据库注释结果显示,F2d株对β-内酰胺类、四环素类、黏菌素类和磺胺类等多种抗生素耐药,并且携带多种抗生素外排机制编码基因 ...
孙嘉良 +4 more
doaj
老年男性高尿酸血症与血清脂联素、瘦素水平及其比值的相关性研究
目的研究老年男性血清脂联素、瘦素水平及其比值与血尿酸水平的相关性。方法选择122名年龄≥65岁的老年男性,以血清尿酸≥420μmol/l诊断为高尿酸血症,高尿酸组52人,尿酸正常组70人。采用放免法测定血清脂联素、瘦素水平,计算脂联素/瘦素比值(A/L)。结果老年男性高尿酸血症表现为高瘦素低脂联素,脂联素/瘦素比值下降;老年男性血尿酸水平与空腹血瘦素水平显著负相关,与空腹血脂联素水平及A/L比值显著负相关。结论血瘦素水平升高,脂联素水平下降是老年男性发生高尿酸血症的机制之一 ...
王熠华, 陶婷, 赵咏桔
doaj
快速发展的代谢组学面临着诸多机遇和挑战。本论文针对目前代谢组学研究数据分析中出现的多类别和类别界限模糊、过拟合、复杂实验数据分析等问题,发展了各具特点的多变量数据处理新方法,并用于采用气相色谱质谱(包括全二维气相色谱质谱)技术的代谢组学研究。主要结果如下: ⒈ 建立了基于GC-MS 和GC×GC-TOFMS 的复杂样品代谢组学分析方法,系统研究了各自的分析条件或样品预处理方法并对其最优化,为复杂体系代谢表型差异的研究和差异性代谢物的发现等奠定了数据采集基础。 ⒉ 建立了基于模糊c 均值聚类(FCM ...
李响
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谷胱甘肽还原酶影响结肠癌代谢及预后:一项基于蛋白组学与微阵列芯片分析的研究 附视频
目的 探讨谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase, GSR)对结肠恶性肿瘤代谢的影响及其对结肠癌患者的预后价值。方法 通过蛋白组学差异分析获得结肠癌组织和正常结肠上皮组织的差异蛋白,并通过富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)分析鉴定代谢通路中的关键蛋白,进行生存分析和临床信息相关性分析。收集120例结肠癌患者手术病理标本制作组织微阵列芯片,进行免疫组织化学染色。结果 蛋白组学差异分析共鉴定出1 209个差异表达蛋白。KEGG富集分析显示,差异蛋白显著富集于代谢通路 ...
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