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水貂酪氨酸酶( TYR )基因克隆、SNPs筛查及其皮肤组织mRNA差异表达分析
, 2021旨在克隆和分析水貂酪氨酸酶（tyrosinase，TYR）基因编码区，揭示该基因编码区SNPs及其皮肤组织mRNA差异表达规律与水貂毛色表型的关系。本研究采集7月龄雄性金州黑水貂、名威银蓝水貂和红眼白水貂共计301个样本的血液，利用聚合酶链式反应（PCR）方法对水貂TYR基因5个外显子进行分段克隆，并拼接获得其完整编码区序列（coding sequence，CDS）；采用PCR产物直接测序技术筛查3种毛色水貂外显子1、4和5中的SNPs；采集9只7月龄雄性水貂（黑、灰与白色被毛各3只）背中部皮肤组织 ...
宋兴超 +13 more
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, 2021
GATA家族是经典的转录因子家族，因其能特异性的与核苷酸序列T/A(GATA)A/G结合而得名。前期研究在单环刺螠(Urechis unicinctus)中筛选到GATA家族成员GATA B2与硫代谢关键酶硫醌氧化还原酶(Sulfide quinone oxidoreductase, sqr)启动子高转录活性区相互作用。为了进一步研究其是否参与硫化物代谢过程，本文鉴定了单环刺螠GATA B2基因(UuGATA B2)，并分析其在成体各组织和硫化物暴露后的表达特征。结果显示：单环刺螠GATA ...
张婷婷 +7 more
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GATA家族是经典的转录因子家族，因其能特异性的与核苷酸序列T/A(GATA)A/G结合而得名。前期研究在单环刺螠(Urechis unicinctus)中筛选到GATA家族成员GATA B2与硫代谢关键酶硫醌氧化还原酶(Sulfide quinone oxidoreductase, sqr)启动子高转录活性区相互作用。为了进一步研究其是否参与硫化物代谢过程，本文鉴定了单环刺螠GATA B2基因(UuGATA B2)，并分析其在成体各组织和硫化物暴露后的表达特征。结果显示：单环刺螠GATA ...
张婷婷 +7 more
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, 2021
旨在克隆获得牦牛StAR基因编码序列（CDS）并进行生物信息学分析，探究其mRNA组织表达特性。本研究以屠宰场采集的成年母牦牛心、肝、脾、肺、肾、卵巢、输卵管、子宫组织（n=5），不同年龄（胎牛、1岁、2岁）牦牛的卵巢（n=3），不同发情周期（卵泡期、黄体期）的牦牛卵巢（n=3），黄体期黄牛的卵巢（n=3）及实验室冻存的牦牛颗粒细胞为研究材料。以牦牛黄体期卵巢cDNA为模板，用逆转录PCR克隆StAR基因，并使用MEGA7.0和ExPASy-ProtParam等软件分析其生物信息学特性 ...
刘宇 +11 more
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旨在克隆获得牦牛StAR基因编码序列（CDS）并进行生物信息学分析，探究其mRNA组织表达特性。本研究以屠宰场采集的成年母牦牛心、肝、脾、肺、肾、卵巢、输卵管、子宫组织（n=5），不同年龄（胎牛、1岁、2岁）牦牛的卵巢（n=3），不同发情周期（卵泡期、黄体期）的牦牛卵巢（n=3），黄体期黄牛的卵巢（n=3）及实验室冻存的牦牛颗粒细胞为研究材料。以牦牛黄体期卵巢cDNA为模板，用逆转录PCR克隆StAR基因，并使用MEGA7.0和ExPASy-ProtParam等软件分析其生物信息学特性 ...
刘宇 +11 more
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, 2021
以西藏大花红景天为研究材料，利用生物信息学和实时荧光定量PCR技术对RcUDPGTs基因家族中18个成员的序列和表达模式进行分析，并构建RcUDPGT(JX228125.1)的诱饵载体以筛选拟南芥酵母文库中互作蛋白。结果表明，RcUDPGTs基因核苷酸序列长度为1 400 bp左右，编码452~498个氨基酸。一级结构中N端序列保守性较低，C端的保守性较高，均含有尿苷二磷酸葡萄糖结合结构域(PSPG盒)。蛋白质三级结构均呈现一定相似性，具有UDP糖供体识别中心，且含有多个可磷酸化位点。qRT ...
王宏鹏 +9 more
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以西藏大花红景天为研究材料，利用生物信息学和实时荧光定量PCR技术对RcUDPGTs基因家族中18个成员的序列和表达模式进行分析，并构建RcUDPGT(JX228125.1)的诱饵载体以筛选拟南芥酵母文库中互作蛋白。结果表明，RcUDPGTs基因核苷酸序列长度为1 400 bp左右，编码452~498个氨基酸。一级结构中N端序列保守性较低，C端的保守性较高，均含有尿苷二磷酸葡萄糖结合结构域(PSPG盒)。蛋白质三级结构均呈现一定相似性，具有UDP糖供体识别中心，且含有多个可磷酸化位点。qRT ...
王宏鹏 +9 more
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黄条鰤( Seriola aureovittata ) MyHC 基因克隆及其在早期发育阶段表达研究
, 2020为解析肌球蛋白重链（MyHC）基因在黄条鰤（Seriola aureovittata）生长发育过程中作用机制，本研究采用RACE技术，克隆了黄条鰤MyHC基因全长cDNA序列，采用荧光定量PCR（qRT-PCR）方法对MyHC在黄条鰤不同组织、胚胎发育过程以及仔稚幼鱼发育过程中的表达特征进行了研究。结果表明：黄条鰤MyHC基因全长为6143bp，开放阅读框为5811bp，编码了1936个氨基酸，由3个保守结构域组成即MYSc-class II、Myosin tail1和SH3 ...
史宝 +13 more
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, 2020
旨在获取水禽StAR基因的结构和组织表达规律，初步了解其对水禽睾丸发育的影响。本研究选取山麻鸭和狮头鹅的下丘脑和睾丸组织为材料，克隆StAR基因，并采用实时荧光定量PCR方法检测该基因在山麻鸭和狮头鹅不同组织中的表达规律，并进一步比较该基因在不同时期鹅睾丸组织中的表达差异。本试验克隆获得鸭StAR基因3个转录本（dSTAR-A、dSTAR-B和dSTAR-C），dSTAR-A和dSTAR-B编码序列相同，编码283个氨基酸，而dSTAR-C编码238个氨基酸；获得鹅STAR基因两个转录本（gSTAR ...
欧阳宏佳 +9 more
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旨在获取水禽StAR基因的结构和组织表达规律，初步了解其对水禽睾丸发育的影响。本研究选取山麻鸭和狮头鹅的下丘脑和睾丸组织为材料，克隆StAR基因，并采用实时荧光定量PCR方法检测该基因在山麻鸭和狮头鹅不同组织中的表达规律，并进一步比较该基因在不同时期鹅睾丸组织中的表达差异。本试验克隆获得鸭StAR基因3个转录本（dSTAR-A、dSTAR-B和dSTAR-C），dSTAR-A和dSTAR-B编码序列相同，编码283个氨基酸，而dSTAR-C编码238个氨基酸；获得鹅STAR基因两个转录本（gSTAR ...
欧阳宏佳 +9 more
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, 2020
为进一步了解WNT4在三角帆蚌性别决定过程中的作用，通过RACE（Rapid-amplification of cDNA ends）技术克隆获得了三角帆蚌WNT4基因的全长cDNA，共1 560 bp，其中5'-UTR 396 bp、3'-UTR 24 bp，开放阅读框（ORF）为1 140 bp，可以编码379个氨基酸，且该序列含有WNT家族特有结构域。对WNT4的氨基酸序列进行同源性分析后，发现该基因在物种间的进化关系和结构功能具保守性。通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR ...
刘斐斐 +11 more
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为进一步了解WNT4在三角帆蚌性别决定过程中的作用，通过RACE（Rapid-amplification of cDNA ends）技术克隆获得了三角帆蚌WNT4基因的全长cDNA，共1 560 bp，其中5'-UTR 396 bp、3'-UTR 24 bp，开放阅读框（ORF）为1 140 bp，可以编码379个氨基酸，且该序列含有WNT家族特有结构域。对WNT4的氨基酸序列进行同源性分析后，发现该基因在物种间的进化关系和结构功能具保守性。通过实时荧光定量PCR（qRT-PCR ...
刘斐斐 +11 more
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, 2020
通过现代分子生物学技术，从三角帆蚌（Hyriopsis cumingii）中克隆了细胞周期蛋白B（cyclin B）基因的cDNA，得到长度为1 024 bp的序列信息，包括768 bp的ORF，197 bp的3'-UTR，编码255个Aa。进一步分析表明，三角帆蚌cyclin B基因与牡蛎、扇贝具有较高的相似性，其氨基酸序列中具有1个典型的周期蛋白框（cyclin-box），并存在2个周期蛋白依赖性蛋白激酶（CDK）的作用位点。通过RT-qPCR研究显示：三角帆蚌cyclin B基因在性腺中的表达最高，
刘佳敏 +9 more
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通过现代分子生物学技术，从三角帆蚌（Hyriopsis cumingii）中克隆了细胞周期蛋白B（cyclin B）基因的cDNA，得到长度为1 024 bp的序列信息，包括768 bp的ORF，197 bp的3'-UTR，编码255个Aa。进一步分析表明，三角帆蚌cyclin B基因与牡蛎、扇贝具有较高的相似性，其氨基酸序列中具有1个典型的周期蛋白框（cyclin-box），并存在2个周期蛋白依赖性蛋白激酶（CDK）的作用位点。通过RT-qPCR研究显示：三角帆蚌cyclin B基因在性腺中的表达最高，
刘佳敏 +9 more
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, 2020
本研究对编码牡蛎疱疹病毒(Ostreid herpesvirus 1,OsHV-1)囊膜蛋白的orf111基因进行了生物信息学分析、克隆和表达。首先，通过特异性PCR扩增得到orf111基因全长序列，并对其编码囊膜蛋白的理化性质、高级结构、跨膜区和抗原决定簇等进行生物信息学分析。结果显示，orf111编码一种稳定的疏水性蛋白，具有5个跨膜结构域和9个抗原决定簇，同时，氨基酸序列中还包含1个高度保守的精氨酰-甘氨酰-天冬氨酸(Arg-Gly-Asp,RGD)结构域。随后，构建了pET28a ...
张淑敏 +11 more
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本研究对编码牡蛎疱疹病毒(Ostreid herpesvirus 1,OsHV-1)囊膜蛋白的orf111基因进行了生物信息学分析、克隆和表达。首先，通过特异性PCR扩增得到orf111基因全长序列，并对其编码囊膜蛋白的理化性质、高级结构、跨膜区和抗原决定簇等进行生物信息学分析。结果显示，orf111编码一种稳定的疏水性蛋白，具有5个跨膜结构域和9个抗原决定簇，同时，氨基酸序列中还包含1个高度保守的精氨酰-甘氨酰-天冬氨酸(Arg-Gly-Asp,RGD)结构域。随后，构建了pET28a ...
张淑敏 +11 more
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, 2019
目的本研究通过对大豆水通道蛋白基因GmTIP1-1的克隆及其在不同胁迫处理下的差异表达分析，探究水通道蛋白在大豆耐受非生物胁迫中的作用机制。 方法从大豆品种‘天隆1号’中克隆出GmTIP1-1的CDS序列，采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行分析。采用实时荧光定量PCR检测在不同逆境处理下GmTIP1-1在大豆根、茎、叶等组织的表达情况。利用基因枪轰击法对GmTIP1-1蛋白全长及不同跨膜结构域进行亚细胞定位分析。通过酵母双杂试验确定GmTIP1-1蛋白的互作蛋白 ...
李双飞 +15 more
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目的本研究通过对大豆水通道蛋白基因GmTIP1-1的克隆及其在不同胁迫处理下的差异表达分析，探究水通道蛋白在大豆耐受非生物胁迫中的作用机制。 方法从大豆品种‘天隆1号’中克隆出GmTIP1-1的CDS序列，采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行分析。采用实时荧光定量PCR检测在不同逆境处理下GmTIP1-1在大豆根、茎、叶等组织的表达情况。利用基因枪轰击法对GmTIP1-1蛋白全长及不同跨膜结构域进行亚细胞定位分析。通过酵母双杂试验确定GmTIP1-1蛋白的互作蛋白 ...
李双飞 +15 more
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