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Screening of SNP Loci of Growth-related Candidate Gene and Genetic Diversity of Five Populations Based On Microsatellite Markers in Fujian Oyster, Crassostrea angulata [PDF]
福建牡蛎(Crassostreaangulata,C.angulata)又名葡萄牙牡蛎,具有重要的经济价值和生态价值,但由于长期未经选育以及人工育苗的应用,导致牡蛎养殖出现经济性状衰退及死亡率逐年增高等现象,亟需加强种质资源保护,开展遗传改良研究。本研究利用单核苷酸多态性分子标记(singlenucleotidepolymorphism,SNP)对福建牡蛎生长相关的5个候选基因,即胰岛素相关多肽(insulinrelatedpeptides,IRPs)、ɑ-淀粉酶(ɑ-Amylase,ɑ-AMY ...
楚瑞敏
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Isolation of microsatellite markers, construction of genetic linkage maps and QTL mapping of growth-related traits in small abalone, Haliotis diversicolor [PDF]
本研究采用磁珠富集法,用14个探针构建了杂色鲍微卫星富集文库。从文库中随机选取768个阳性克隆进行测序,拼接得到729个重叠群,其中656个重叠群包含微卫星序列。利用微卫星两侧保守区域设计了583对微卫星引物,从中筛选出退火温度在50-64℃,PCR产物稳定扩增、条带清晰的微卫星标记308个。随机选取其中的11个微卫星标记用于标记质量评估,这11个微卫星标记的PIC值在0.7276到0.9163之间,具有高度多态性。 利用开发的308个微卫星标记,以养殖个体♀和野生个体♂杂交F1家系为作图群体 ...
战欣
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SSR Polymorphism of Alligator sinesis and Conservation Strategy of Genetic Diversity [PDF]
作者简介: 黄 磊( 1978- ) , 硕士研究生, 研究方向: 动物分子遗传 通讯作者。E-mail:wangyqnj@ jlonline. com[中文文摘]扬子鳄 (Alligatorsinensis)是中国特有的珍稀保护动物 ,为保护这一濒危物种 ,我国于 80年代初在安徽宣州先后建立了扬子鳄繁殖研究中心和国家级扬子鳄自然保护区 ,现饲养种群存鳄数量已达 10 0 0 0余头。为了揭示扬子鳄种群的遗传结构 ,共采集了 3 9个个体的样品 ,其中包括 6件剥制标本 ,按代系不同 ,分为野生群、
Eggleston, P +3 more
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微卫星广泛存在于真核生物和原核生物基因组中,是较为理想的分子标记。食蟹猴是生物医学研究领域中重要的灵长类动物模型,而食蟹猴基因组微卫星研究有助于筛选和开发更多的微卫星标记。利用生物信息学软件对食蟹猴全基因组微卫星进行了搜索,共搜索到微卫星总数为1284929个,微卫星序列长度为26044651 bp,占全基因组的0.890%。整个基因组微卫星平均丰度是451.3个/Mb,平均密度9118.7 bp/Mb。不同重复类型微卫星表现为单碱基(56.74%)>四碱基(16.72%)>二碱基(16.67 ...
涂飞云 刘 俊 韩卫杰 黄 挺 黄晓凤
doaj
中国南方食管鳞癌D5S107和D5S408杂合性丢失与微卫星不稳定性
【目的】研究中国南方食管癌高发地区(潮汕地区)食管鳞癌5号染色体长臂(5q)部分微卫星标记的杂合性丢失(LOH)和微卫星不稳定(MSI),为食管鳞癌相关抑癌基因的定位提供依据。【方法】采用PCR银染技术,检测58例配对食管鳞状细胞癌标本多个微卫星标记(D5S107;SHGS31088;D5S816;D5S625和D5S408)的杂合性丢失和微卫星不稳定。【结果】SHGS31088,D5S816和D5S625杂合性丢失率和微卫星不稳定都较低;而D5S107和D5S408的杂合性丢失率分别为48.5%和34.
李小东 +7 more
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高寒区多源降水产品精度与水文模拟效果评估——以雅鲁藏布江流域和拉萨河流域为例
卫星降水产品在缺资料地区开展水文气象研究及径流模拟中发挥着至关重要的作用,然而卫星降水产品的精度可能会影响径流模拟效果。采用多种统计指标和VIC水文模型综合评估5种卫星降水产品(CMORPH-BLD、GSMaP_Gauge、CMFD、MSWEP和PERSIANN-CDR)在雅鲁藏布江流域的精度和拉萨河流域的水文模拟效果。结果表明:(1) CMORPH_BLD和GSMaP_Gauge在少雨季存在低估,CMFD在少雨季与观测值具有很好的一致性。MSWEP和PERSIANN-CDR在多雨季和少雨季存在高估 ...
班春广 +5 more
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Studies on Heat Tolerance in Abalone Based on the Measurement of Heart Rate [PDF]
鲍是海产八珍之首,2015年,我国的鲍产量已经超过13万吨,其中福建省的产量占全国的80%。皱纹盘鲍为温带种,原分布于我国黄、勃海海域,1990年代后期南移福建后,获得了极大发展,由此福建逐步成为我国鲍养殖的主产区。但福建海域的夏季高水温往往导致鲍的高死亡率,这一直困扰着鲍养殖产业的发展。因此,培育耐高温的养殖新品种显得格外重要,而其中建立鲍的耐高温性状的准确测评方法是品种培育的关键。本研究中,我们通过测定阿氏拐点温度(Arrheniusbreakpointtemperature,ABT ...
陈楠
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目的检测微卫星不稳定与卵巢癌的关系。方法收集卵巢癌患者及对照组的血液标本,提取循环血DNA,设计特异性引物,采用PCR-SSCP及测序分析的方法检测卵巢癌患者循环血中微卫星不稳定性与卵巢癌易感性的关系,分析微卫星不稳定性与卵巢癌患者的病理类型、临床病理分期等相关性。结果卵巢癌组中浆液性囊腺癌、粘液性囊腺癌、子宫内膜样癌、库肯勃瘤及其他类型发生微卫星不稳定的频率相比较差异具有显著性 ...
冷维春, 刘俊宝, 陈凤
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由于人类活动干扰及自然环境变化,东北马鹿(Cervus elaphus xanthopygus)的生存面临诸多问题。为掌握东北马鹿遗传多样性现状,进而为马鹿种群的健康状况提供评估依据,利用线粒体Cyt b基因和微卫星2种分子标记对内蒙古大兴安岭南麓高格斯台罕乌拉国家级自然保护区内的东北马鹿进行种群遗传多样性评估。结果表明:246份新鲜马鹿粪便隶属于182只个体;微卫星标记表明平均期望杂合度为(0.729±0.016),平均观测杂合度为(0.768±0.029),线粒体标记表明单倍型多样性为(0.347 ...
李峥, 郭金昊, 刘鑫鑫, 张明海
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The study of Mitochondrial DNA Gene Rearrangement in 4 species of birds(Aves: Falconiformes) [PDF]
线粒体控制区由于进化速率快,被作为分子标记广泛应用于种群遗传学和保护生物学等领域的研究。但最近在许多鸟类的线粒体中都发现控制区存在重复拷贝,并且2个控制区拷贝之间的碱基相似度较高。因此在扩增其中一个控制区基因时可能受到另一个控制区的干扰,而对研究结果产生影响。本研究主要针对隼形目鸟类线粒体DNA(mtDNA)基因组中控制区重复及由此产生的基因重排现象进行研究,初步探讨控制区重复和基因重排产生的过程和机制。 本次实验首次对鹰科中的白头鹞(Circusaeruginosus)、日本松雀鹰 ...
范欢
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