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许氏平鲉（Sebastes schlegeli）微卫星标记开发及野生、养殖群体遗传多样性分析
, 2015对许氏平鲉进行简化基因组测序,设计微卫星引物200对,可稳定扩增的引物190对,占95%。利用一个荣成野生群体对24个多态性较高的微卫星标记进行了评价,每个位点的等位基因数( N a )为2-21个,观测杂合度( H o )为0.0417-0.9167,期望杂合度( H e )为0.0278-0.9722,多态信息含量(PIC)为0.1948-0.9496,结果显示有20个微卫星位点为中高度多态。利用这些引物对荣成野生群体和烟台养殖群体的遗传多样性进行了比较分析,野生和养殖群体的平均等位基因数( N a
韩承慧 +5 more
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基于Solexa高通量测序的唐古特红景天(Rhodiola algida)微卫星信息分析
, 2014利用所获得的Solexa高通量唐古特红景天转录组拼接EST序列进行微卫星位点的挖掘分析,期望为红景天属SSR标记的开发提供生物信息学依据。在得到的6552条EST序列中,三碱基最多,占总EST序列的41.50%;单核苷酸和二核苷酸重复类型的SSR含量相似,分别为27.76%和24.76%;二至六碱基微卫星分布密度与其对应的SSR含量成正比。在单核苷酸重复类型中,T和A重复类型最多,分别为总SSR的14.91%、12.70%,而G和C重复类型则很少;在二核苷酸重复类型中,AG重复类型最多,占总SSR的5 ...
雷淑芸 +5 more
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特有植物短丝木犀( Osmanthus serrulatus )转录组微卫星特征分析
, 2016利用MISA软件对短丝木犀花和叶芽转录组测序得到的92 798条独立基因(unigenes)进行SSR位点查找和分析，共搜索到11 881个SSR位点，除单碱基重复外，SSR出现频率为4.64%，分布密度为1/15.02 kb。二碱基和三碱基重复为短丝木犀SSR主要重复单元类型，分布占SSR总数的66.35%和30.42%。其中AG/CT和AAG/CTT分别为二碱基和三碱基重复单元的优势重复基元，分别占各自重复单元的63.21%、30.38%。短丝木犀SSR多为重复长度小于20 bp的短序列 ...
陈林, 李龙娜, 杨国栋, 戴亚平
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基于微卫星标记的大口黑鲈（ Micropterus salmoides ）原种和养殖群体遗传多样性和结构分析
, 2020苏胜彦 +8 more
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