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Biodiversity Soup II: A bulk‐sample metabarcoding pipeline emphasizing error reduction
Methods in Ecology and Evolution, Volume 12, Issue 7, Page 1252-1264, July 2021., 2021 Abstract Despite widespread recognition of its great promise to aid decision‐making in environmental management, the applied use of metabarcoding requires improvements to reduce the multiple errors that arise during PCR amplification, sequencing and library generation.
Chunyan Yang +7 more
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野生动物学报, 2022 以上海动物园圈养豚鹿(Axis porcinus)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA,利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序,并用MISA检索SSR标记。结果表明:单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布,其中双碱基重复占比最高,在双碱基重复中以AC/GT重复为主。本研究成功开发出7个SSR标记,这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2～5个,在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421,平均期望杂合度(He)为0.513 ...
耿广耀, 由玉岩, 刘群秀
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野生动物学报, 2021 高原鼠兔（Ochotona curzoniae）是青藏高原的关键种，对其分子标记的开发有助于高原鼠兔种群生态等问题的研究。基于简化基因组测序技术获得了高原鼠兔简化基因组序列信息，并开发了微卫星分子标记。结果表明：通过MISA软件分析共检测到7 064个SSR位点，其中单核苷酸和二核苷酸重复基序数量最多，各占4615%和3837%。四核苷酸重复基序的类型最多，达83种；其次是三核苷酸重复基序的类型，为50种。不同类型SSR位点基序的重复次数也不同。通过取SSR与InDel的交集 ...
贺玉姣 1 胡万军 2 都玉蓉 1 王婷 1 杜雷 1 胡书立 1
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中国南方一罕见迟发性脊椎骨骺发育不良大家系的表型和基因型的相关性研究
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2022 目的揭示一罕见遗传性矮小症家系的分子发病机制，阐明患者表型和基因型的相关性，为今后的产前、植入前基因诊断奠定基础。方法在临床初诊、系谱分析的基础上，首先采用高通量测序技术对先证者及其家庭核心成员的DNA样品进行全外显子组测序。通过生信分析找出候选基因，在确定候选基因及其新变异后，采用PCR、Sanger测序、RT-PCR、q-PCR等方法对该新变异的致病性进行系列鉴定。结果通过全外测序、Sanger测序验证和生物信息分析，确定TRAPPC2基因及其携带的 c.94 del ...
黄颖 +4 more
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Journal of Advanced Nursing, Volume 76, Issue 8, Page 2191-2197, August 2020., 2020 Abstract Aim To determine the effectiveness of a hydrophobic dressing (Cutimed Sorbact®) against a silver dressing (Aquacel® Ag Extra) in the level of colonization of chronic venous leg ulcers. The secondary endpoints are health‐related quality of life, level of pain, and time to complete healing.
Juan C. Morilla‐Herrera +9 more
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Use of surrogate species to cost‐effectively prioritize conservation actions
Conservation Biology, Volume 34, Issue 3, Page 600-610, June 2020., 2020 Abstract Conservation efforts often focus on umbrella species whose distributions overlap with many other flora and fauna. However, because biodiversity is affected by different threats that are spatially variable, focusing only on the geographic range overlap of species may not be sufficient in allocating the necessary actions needed to efficiently ...
Michelle Ward +5 more
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Journal of Diabetes, Volume 12, Issue 3, Page 224-236, March 2020., 2020 Highlights Diabetic conditions induce compositional dysbiosis of the gut microbiota and impair gut barrier integrity. Diabetic conditions markedly downregulate the abundance of Faecalibacterium prausnitzii in the gut. Under diabetic conditions, microbial anti‐inflammatory molecules from Faecalibacterium prausnitzii restore the gut barrier and ZO‐1 ...
Jihao Xu +7 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2022 目的本研究通过第二代高通量测序（NGS）检测配对骨肉瘤转移灶和原发灶标本，分析骨肉瘤原发灶与转移灶的基因图谱差异，以期发现促进骨肉瘤发生和转移的相关分子及可能机制。方法12例转移患者的原发灶与转移病灶肿瘤组织样本，使用第二代高通量测序（NGS）进行检测，其中9对panel检测（678个基因）以及3对全外显子检测（WES），分析比较骨肉瘤原发灶与转移灶的基因图谱差异：基因拷贝数变异通过EXCAVATOR检测；DNA层面的融合突变通过Lumpy检测；RNA层面的融合突变通过Defuse + STAR ...
许明贤 +4 more
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野生动物学报, 2021 罗氏鼢鼠（Myospalax rothschildi）是陕西南部农区主要害鼠，研究其与当地环境的相互作用对鼠害防控有重要意义。肠道微生物对宿主行为及生理的调控机制是近年来啮齿类动物防控研究新方向。本研究通过Illumina 高通量测序技术，对雌性罗氏鼢鼠的盲肠样品进行 16S rRNA V3V4区的高通量测序，分析性别及食物因素对罗氏鼢鼠肠道细菌多样性的影响。结果显示，雌性罗氏鼢鼠的肠道内容物中的细菌隶属10门9纲11目13属。肠道革兰氏阳性厚壁菌门（Firmicutes）和革兰氏阴性菌类的变形菌门 ...
陈晓宁 封托 侯祥 安晓雷 王京 常罡
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基于 NLC 调制的 MMC 多子模块工况模拟测试电路及其控制方法 [PDF]
全球能源互联网, 2020 模块化多电平转换器（MMC）由大量子模块构成，子模块的可靠性对MMC系统的安全可靠运行有着重要影响。特定工况下的可靠性评估表现是子模块设计指标之一，搭建较完整的MMC系统对子模块进行可靠性测试和验证成本高且效率低，因此提出了一种针对多个MMC子模块的工况模拟测试电路及其相应的控制方法。通过设计负载电流控制策略以及增加辅助桥臂、反串子模块及其控制策略，可以使待测子模块的流入电流、电容电压以及开关序列与实际MMC系统中一致。该电路能够同时对多个子模块进行测试，极大地减小了测试电路对直流源电压的要求 ...
杨云霄, 马柯
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