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野生动物学报为探究低、中、高3个不同海拔梯度下喜马拉雅旱獭（Marmota himalayana）基因表达是否存在差异，筛选该物种与高原低氧及强紫外辐射环境适应的相关候选基因，采用Illumina HiSeq 2500高通量测序平台对喜马拉雅旱獭肝脏组织进行无参转录组学分析，通过对质控后测序数据与参考基因组的比较分析，筛选差异表达基因后进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果显示：乐都样品（低海拔组，LD）、玉树样品（高海拔组，YS）喜马拉雅旱獭肝脏组织中差异表达基因差异较大，刚察样品（中海拔组，GC ...
赵坤钰, 李优, 南新营, 李耀东
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利用Illumina测序技术分析圈养成年滇金丝猴肠道菌群多样性
野生动物学报, 2019 选取中国科学院昆明灵长类研究中心的4只成年健康滇金丝猴和1只成年亚健康滇金丝猴，基于高通量测序技术分析其肠道细菌群落的组成和多样性，探讨健康状况对成年滇金丝猴肠道微生物的影响，揭示其肠道微生态特征。结果表明：在门水平上，健康滇金丝猴的主要菌群有厚壁菌门（Firmicutes，78.41%）、拟杆菌门（Bacteroidetes，18.97%）；在属水平上，主要菌群有瘤胃球菌属（Ruminococcus，6.29%）、未分类的毛螺菌科（unidentified Lachnospiraceae，420 ...
金洁 1 张飞燕 1 谢丽分 1 刘超 1 张庆宇 1 邬继文 1 吕龙宝 1 +1 more
doaj
野生动物学报研究不同生活环境下棘胸蛙（Quasipaa spinosa）肠道微生物的差异，利用16S rRNA高通量测序技术，对中国东部（浙江）、中部（广东和江西）和西部（广西和贵州）3个地理种群的棘胸蛙进行肠道菌群的多样性和功能分析。测序结果显示：东部、中部和西部地区共有OTU 530个，各地区特有OTU分别为48、123、118个。西部地区棘胸蛙肠道菌群的物种丰富度和多样性最高，3个地理种群棘胸蛙的优势菌门均为拟杆菌门（Bacteroidetes）、变形菌门（Proteobacteria）和厚壁菌门 ...
李晗 +7 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban目的探究低氧暴露对小鼠脾脏组织碳代谢通路的调控机制。方法将C57BL/6小鼠分别在海拔400 m和4 200 m饲养，每组5只，30 d后无菌取出脾脏组织，通过转录组测序，蛋白质组学和非靶向代谢组学分析差异表达基因、差异蛋白以及差异代谢物，利用GO和KEGG富集分析，挖掘关键通路，并通过RT-qPCR和Western blot对通路中关键基因和蛋白进行验证。结果转录组测序发现，低氧暴露下有4 213个基因出现显著性差异表达，其中1 947个基因表达上调，2 266个基因表达下调 ...
陈晓晨 +5 more
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野生动物学报为优化穿山甲的分子鉴定方法，采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列，评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明：K2P模型和p-distance模型基于颠换（TV）计算的遗传距离具有最优的物种分辨率；Cyt b基因全序列有较好的物种鉴别能力，其中，第301 ~ 400号和第851 ~ 950号的2个碱基序位片段组合时具有最高的物种分辨率，是鉴别9种穿山甲的最佳理论区段。现有的方法中推荐使用Kocher等的引物 ...
韩松霖 +6 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban目的应用纳米孔长读长测序技术，深入分析正常肝实质细胞和肝癌细胞在低氧环境下的特异性转录组变化，以期阐明肿瘤细胞在低氧条件下生存与转移的内在机制，从而为肿瘤的精准靶向治疗开辟新的视角与策略。方法实验选取正常肝实质细胞系THLE-3与肝癌细胞系Hep3B作为研究对象，分别置于常氧与低氧条件下培养48 h后，提取其总RNA。随后，采用纳米孔测序技术，对这两种细胞系在不同氧浓度下的转录组进行高通量、高精度的测序分析。结果本研究成功构建了基于纳米孔三代测序技术的低氧转录本数据集，展现了前所未有的测序精度。通过GO（
高力, 沈晟齐, 高平
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野生动物学报为研究梅花鹿（Cervus nippon）DLX5基因的结构和功能，进一步探究其与梅花鹿茸角骨化机制间的关系，采用RT-PCR技术对梅花鹿DLX5基因进行克隆，获得包含全部编码区的cDNA序列，对该基因的氨基酸序列进行生物信息学分析并构建系统进化树，通过KEGG富集分析其信号通路，运用实时荧光定量RT-PCR检测该基因在鹿茸生长不同时期的表达情况。结果表明：梅花鹿DLX5基因编码区长为870 bp，共编码289个氨基酸。DLX5蛋白为可溶性的不稳定蛋白，有2个保守结构域，主要定位于细胞核 ...
王鹏 +5 more
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儿童生存质量测定量表PedsQL4.0中文版 的信度和效度分析
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2008 【目的】 考察儿童生存质量自评式测定量表PedsQL4.0中文版的信度和效度?【方法】 采用国际通用的量表翻译改造程序,将英文版的儿童生存质量测定量表PedsQL4.0翻译改造成中文?在广州市区用PedsQL4.0中文版调查普通儿童和白血病患儿共335人,其中正常儿童291人,白血病儿童44人?分析量表的可行性?内部一致性?内容效度?区分效度?结构效度等?【结果】 350名被调查儿童中335名完成了问卷,答卷的条目缺失率低于1%;量表各个方面的Cronbach′s α系数介于0.74 ～ 0.82之间 ...
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野生动物学报, 2016 东北林蛙(Rana dybowskii)主要分布在我国东北部,季节性的低温环境使东北林蛙具有高效的抗冻策略,形成高浓度的葡萄糖保护剂是重要的抗冻机制之一。GLUT1是机体细胞中分布最广泛葡萄糖转运蛋白。本实验采用高通量测序技术获得东北林蛙GLUT1 mRNA片段,通过实时荧光定量PCR技术分析低温胁迫下(-1℃)东北林蛙随胁迫时间延长,其肝脏、骨骼肌、心脏、脂肪、皮肤组织中GLUT1转录水平的表达变化。结果发现,肝脏和心脏的GLUT1在低温胁迫24 h达到峰值,分别为对照组的9.17倍和5倍 ...
郭柏宏 肖向红 巩珊珊 张晶钰 柴龙会
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