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自20世纪90年代,开始了中国中缅树鼩(Tupaia belangeri)的生理生态学研究。回顾30年来中国中缅树鼩生理生态学的研究与发展:起源和分类、能量代谢和产热特征、脂肪组织、形态学、组学、化学通讯和行为学等。在科学发展的新时期,除进一步加强有关中缅树鼩对极端环境的生理适应研究外,还需要借助多组学、遥感与红外技术等,加强对动物生理适应的分子水平的机理性探究。结合全球温室效应的环境背景,从地理分布北线、食性、肠道微生物多样性以及实验动物建模等方面对中缅树鼩未来的研究方向进行了展望。
侯东敏, 贾婷, 朱万龙, 王政昆
doaj
New Sparse Methods for Metabonomic Data Analysis [PDF]
代谢组学是一门以代谢物组分析为基础、以高通量检测为手段、以信息建模与系统整合为目标的新的交叉学科,已成为生命科学研究的热点之一。由于代谢组学数据维数高,且涉及多种技术平台,给代谢组学数据分析提出了巨大的挑战。数据稀疏化是解决高维数据分析的一个有效方法,本文就代谢组学数据稀疏化问题进行深入研究,主要内容如下: 一、提出了基于SIS(SureIndependenceScreening)的稀疏偏最小二乘法,即SIS-SPLS。该方法通过对偏最小二乘法迭代过程中方向向量的求解过程中加入SIS过程,实现了稀疏回归。
徐向南
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Stable Isotope N-Phosphoryl Amino Acids Labeling (SIPAL) for Quantitative Metabolomics Using Liquid Chromatography-Mass Spectrometry [PDF]
代谢组学作为系统生物学的重要组成部分对于生命科学基本机制的揭示及重大疾病标志物的发现具有重要的意义。近年来,随着高效分离技术及高分辨、高灵敏度生物质谱技术的发展,代谢组学分析方法和策略有了较大的提高,特别是在稳定同位素化学标记定量方面。然而,由于代谢物的复杂多样性,微量代谢物的化学结构鉴定和定量分析仍然是当今代谢组学研究面临的巨大挑战。发展具有多功能、高效、高灵敏度等特点的代谢组学定性定量试剂与方法具有重要的科学意义和应用价值。 本文基于“核酸与蛋白共起源”小分子化学进化模型--N ...
张姗姗
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[目的] 分析神经梅毒患者的脑脊液代谢物,以确定潜在的诊断标志物。 [方法] 利用液相色谱-质谱联用技术的非靶向代谢组学,分析5例神经梅毒患者和5例梅毒/非神经梅毒患者的脑脊液样本。将原始数据经过质量控制和归一化处理后,进行数据分析(主成分分析、正交偏最小二乘判别分析、层次聚类分析)确定两组间的差异代谢物。 [结果] 神经梅毒患者体内,有6种代谢物显著升高,分别是Pro-leu、nudifloramide、N-oleoyl glycine、DMP 777 ...
贺 媛媛+5 more
doaj +1 more source
Metabolomic Study on the Advanced Pancreatic Cancer Model in Nude Mouse [PDF]
胰腺癌是一种恶性程度极高的消化道类恶性肿瘤,早期无显著病征,病人在确诊时病情基本已处于中晚期,而研究显示,直径小于2cm和1cm的胰腺癌术后5年生存率分别可达30%-60%和超过75%,远高于中晚期术后5年生存率。 本文为课题“基于核磁共振的代谢组学技术发现胰腺癌的生物标志物及早期诊断应用”的一部分。整个课题目的在于通过系统分析动物和人类胰腺癌中晚期模型代谢通道的异同点,然后通过构建动物早期胰腺癌模型,并结合中晚期动物与人类胰腺癌代谢通路的共同点 ...
李志水
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NMR-based Metabonomics’ Data Preprocess Methods and Its Application on Diabetes Mellitus Study [PDF]
自从1999年Nicholson及其同事在核磁共振(NMR)研究的基础上提出代谢组学(Metabonomics)以来,基于NMR的代谢组学得到了迅速地发展。由于机体病理的变化,代谢产物产生了某些相应的变化,利用NMR手段就可以检测到这些代谢产物的变化。对NMR数据采用适当的化学计量学和多元变量分析方法,提取丰富的特征代谢物信息,进行疾病的诊断与病理的分析。同时,数据预处理是代谢组学分析的关键步骤之一,尤其是数据归一化与标准化。如何选择合适的预处理方法已成为代谢组学数据处理研究热点 ...
温锦波
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【目的】探讨妊娠期糖尿病(GDM)患者孕期血脂水平对产后糖脂代谢的影响。【方法】随访确诊为GDM并完成产后复查妇女416例,根据孕期血脂分为孕期血脂正常组(n=82)和孕期血脂异常组(n=334),收集产后4-12周一般人口学资料,检测OGTT血糖、胰岛素水平以及血脂水平,比较两组产后糖脂代谢参数差异。【结果】GDM妇女产后早期糖代谢异常率为38.5%,血脂异常发生率为34.4%;孕期血脂异常组产后总胆固醇、甘油三酯以及低密度脂蛋白胆固醇水平均明显高于孕期血脂正常组,其中孕期高TC血症和高LDL ...
肖黄梦+7 more
doaj
Malignancy-associated metabolic profiling of human glioma cell lines using 1H NMR spectroscopy [PDF]
胶质瘤恶性转化的原因和机制不明,给临床诊疗带来极大困难。越来越多的研究表明肿瘤恶性转化与细胞代谢紊乱密切相关,但胶质瘤恶性转化相关的细胞代谢特点目前尚不清楚。因此,探寻不同恶性程度胶质瘤细胞的代谢轮廓,将有助于开发监测胶质瘤恶性进展的非入侵式生物标志物和靶向代谢通路的治疗策略。本研究收集5种不同病理级别瘤组织来源的人脑胶质瘤细胞系(CHG5/SHG44/U118/U87/U251),其中CHG5和SHG44为WHOII级来源;U118,U87和U251为WHOIV级来源。体外培养后,首先通过侵袭能力 ...
邵巍
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The application of NMR techniques in origin characterization and adulteration identification of honey [PDF]
随着生活条件的不断提升,人们对食品品质的要求越来越高。蜂蜜作为一种天然甜味剂,可以为人体提供丰富的营养成分。而植物来源不同,产地不同的蜂蜜成分存在差异,其中糖类、氨基酸等成分含量上的差异,会带来蜂蜜甜度,气味等性状的不同,而这些通常是蜂蜜等级的标志。此外,近几年掺假蜂蜜在市场上不断出现也给人民群众的健康和生命安全带来威胁。所以,有效地对蜂蜜进行溯源分析和掺假鉴别成为消费者和食品企业的必然要求,这既是国际科学研究的前沿,也是与人类健康和生活密切相关的重要社会问题。然而传统的鉴别方法,过于耗费人力物力 ...
郑馨
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Study on Peak Alignment and Data Normalization for NMR-based Metabonomics [PDF]
代谢组学(metabonomics)是研究生物体受病理/生理刺激或基因改变后,定量分析内源性代谢产物的整体组成及其变化规律的科学。经过十几年的快速发展,代谢组学已成功地应用到病理学、毒理学、药理学、疾病诊断等诸多领域。核磁共振(NMR)由于其独特的优势,已成为代谢组学数据获取的重要手段之一。但由于生物系统及外部环境的复杂性,样本制备及实验操作的差异性,以及数据的高维度,代谢组学的数据分析常常面临巨大挑战。数据预处理可很大程度上抑制干扰,规范数据,有利于模式识别准确性的提高和生物标志物的发现 ...
黄赫
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