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蛋白质组学和代谢组学在微生物代谢工程中的应用

open access: yes, 2019
构建微生物细胞工厂是化学品、生物能源以及药物分子可持续生产的可行性策略。然而,微生物的代谢复杂、调控严谨,制约着目标产物高效合成。蛋白质组学和代谢组学可以从系统生物学角度分析酶和代谢物组分,从而理解复杂的生物系统,为微生物代谢工程改造提供重要线索。该文介绍了蛋白质组学和代谢组学在微生物代谢工程中的应用,包括基因组尺度代谢模型构建、菌株生物合成优化、指导菌株耐受性改造、限速步骤预测、植物次级代谢途径挖掘,从而为微生物合成天然产物提供新的基因或途径。在此基础上 ...
高教琪, 禹伟, 周雍进
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四种底栖螺类饥饿代谢的研究

open access: yes, 2005
研究了四种常见优势底栖螺类的饥饿代谢(R,mgO2/ind.d)与温度(T,℃)、体重(Wd,mg dry-wt或Ww,mg wet-wt)的关系,并计算出三者间的复合关系,分别是:铜锈环棱螺,R=0.044Wd0.537e0.061T;长角涵螺,R=0.0004Ww0.9405·e0.0735T;纹沼螺,R=0.004Wd1.072e0.091T;短沟蜷,R=0.023Wd0.777e0 ...
闫云君,梁彦龄
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生理体液法分析肝硬化及肝癌患者的血清氨基酸变化

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2012
氨基酸代谢与人的健康和疾病状态有直接关系,早在70、80年代,就有学者把血、尿样本中氨基酸的变化应用于临床疾病研究。如McGregor[1]等在膀胱癌患者中检测尿液氨基酸,与正常人对比,探讨了其诊断价值。肝脏是机体物质代谢的中枢器官,许多物质合成、分解和转化等代谢过程在肝脏中进行。基于此,我们分析了肝硬化及肝癌患者血清中氨基酸的变化,探讨肝硬化及肝癌患者的氨基酸代谢模式。
马亚楠, 刘树业
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丙型肝炎病毒自发清除者的血清代谢组学研究

open access: yes, 2013
丙型肝炎病毒自发清除者的血清代谢组学研
吴瑞红   +9 more
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气相色谱-质谱联用的代谢组学用于转基因水稻的研究

open access: yes, 2012
本论文以我国最主要的粮食作物水稻为研究对象,从代谢角度出发,围绕植物领域的热点问题--转基因和逆境胁迫进行深入研究。 建立并表征了基于衍生化GC-MS的谷物全组分代谢组学分析方法。优化了代谢物提取体系,为开展全面的水稻代谢组学研究奠定了基础。 开展组织培养与基因插入引起的水稻代谢表型变异研究。GC-MS代谢轮廓方法结合单变量和多变量分析,发现:转基因后,氨基酸、有机酸、糖等发生了显著变化,与插入突变相比,组织培养过程伴随的体细胞变异对表型影响更大。PCA显示回交会使后代的表型趋近于轮回亲本 ...
周佳
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胆汁酸代谢异常在1型与2型糖尿病中的差异机制研究进展

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue
糖尿病是以高血糖为特征的代谢性疾病,主要分为1型糖尿病(T1DM)和2型糖尿病(T2DM)。胆汁酸(BAs)是肝脏合成的胆固醇衍生物,参与调控糖脂代谢、免疫及肠道菌群稳态。T1DM与T2DM患者普遍存在BAs谱异常及相关信号通路(如FXR-FGF19、TGR5-GLP-1)功能减弱,提示BAs代谢紊乱在糖尿病发生发展中起重要作用。本文从BAs的产生、代谢、对糖脂代谢、肠道微生态及对上述通路的调控展开综述,重点阐明BAs代谢对糖尿病的作用机制进展,以期为深入认识糖尿病的发病机制 ...
高云雅, 李阳阳, 刘煜
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基于UPLC-Q/TOF-MS的间变性星形细胞瘤发病机制的系统代谢组学研究

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2019
目的挖掘间变性星形细胞瘤(AA)患者系统代谢组学差异模式,探讨AA发病机制及潜在诊断标志物。方法招募AA患者(n=12)及健康受试者(Healthy Control,HC;n=15),采集外周血清并进行基于超高效液相色谱四极杆时间飞行质谱(UPLC-Q/TOF-MS)联用的代谢组学检测。多元协变量与生物信息学分析探索差异代谢物及代谢通路。结果所建立的主成分分析及基于正交的偏最小二乘法判别分析模型(OPLS-DA)表明AA与HC之间代谢模式差异显著 ...
李香兰, 韩亮, 李淼, 黄哲浩
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一种从体液代谢组轮廓筛选糖尿病标记物的方法

open access: yes, 2011
本发明公开了一种从体液代谢组轮廓筛选糖尿病标记物的方法。采用气相色谱质谱联用仪对体液代谢物进行分析得到代谢组轮廓,建立双重交叉验证筛选模型分析糖尿病人和健康人的代谢组轮廓,筛选糖尿病特异性标记物。双重交叉验证筛选模型在外层交叉验证中将代谢组轮廓分为模型集和测试集,在内层交叉验证中将模型集分为训练集和验证集,外层和内层中分别建立偏最小二乘判别分析(PLSDA)模型,内层中进行建模过程和初步的模型优化,外层中对模型的分类预测能力进行考察并确立最终的模型参数,使用最终的筛选模型可以得到代谢组轮廓中的标记物 ...
许国旺, 李响, 路鑫
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代谢物排出的途径

open access: yesHuli yanjiu, 1995
代谢物排出的途径蓄积在血液中的代谢产物渐渐地被排出体外。人类主要通过泌尿系统,即专门的排泄器官将代谢产物排出体外。然而,部分代谢产物也通过其它器官排出。二氧化碳通过肺排出,而且呼出的气体中含有水气,每天约有400克水通过肺排出。大量水以汗的形式经皮肤...
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基于ADME性质的天然产物-药物相互作用和天然产物代谢激活研究

open access: yes, 2011
草药的安全性评价已经日益受到重视。本论文详细综述了定量预测天然产物对代谢酶 抑制所造成靶器官暴露量增加而诱发的天然产物-药物(尤其是治疗窗窄的药物)相互作用, 以及早期评价天然产物代谢激活而引起毒性的重要性。紧紧围绕这个主题,选取了天然产 物那可丁、紫堇灵和吴茱萸碱作为模式化合物,开展了一系列天然产物抑制CYP 酶活性 和CYP 酶介导的代谢激活研究,取得了如下研究成果: 首先从CYP 酶抑制的角度对临床上出现的那可丁-华法令相互作用进行深入的机制研 究。结果表明:那可丁不仅对CYP3A4 ...
房中则
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