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转突变型A53Tα-突触核蛋白基因的帕金森模型小鼠中脑的全基因组甲基化测序分析 [PDF]
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2020 【目的】研究帕金森氏病（PD）致病基因SNCA在A53T位置突变后对转基因小鼠中脑多巴胺，神经元DNA甲基化修饰的影响。【方法】分别取转突变的人源α-突触核蛋白（hα-syn）即hA53Tα-syn基因小鼠和对照组小鼠的中脑组织，采用重亚硫酸盐测序法（BS-seq）分别对12月龄的转基因小鼠和非转基因（nTg）小鼠进行全基因组甲基化分析，随后筛选出差异甲基化区域（DMR）用于GO富集分析。【结果】通过对比分析，我们总计发现481个DMR，其中高甲基化与低甲基化DMR分别有257和224个 ...
吴婷, 刘琳, 黎昭, 林贤
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2023 目的 基于生物信息学技术鉴定糖尿病肾病(DKD)新的诊断标志物。方法 在基因综合表达数据库(GEO)中筛选DKD与正常肾小球组织中的差异表达基因(DEGs),并通过加权基因共表达网络(WGCNA)筛选关键基因模块，获得关键DEGs。进行基因本体论功能(GO)以及基因组百科全书通路(KEGG)富集分析，以及蛋白互作(PPI)分析获取核心基因。绘制核心基因的受试者操作特征(ROC)曲线，筛选出诊断效能较好的基因作为诊断标志物，并进行基因集富集分析(GSEA)以及免疫浸润分析。结果 共鉴定出87个DEGs ...
安敏 +4 more
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Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2018 青海省宗教发展历史悠久，宗教旅游资源丰富，宗教场所的空间分布特征对青海省区域旅游格局有重要影响.对青海省宗教场所旅游资源进行了统计，分别从空间分布模式、差异性、密度等方面采用最邻近指数、地理集中指数、洛伦茨曲线、核密度方法对其空间格局特征进行了定量分析，并利用空间回归分析法探讨了其分布与海拔、坡度、交通、水系等因素的关系.结果表明：青海省宗教场所旅游资源呈“东多西少”的集聚分布态势，空间差异显著，旅游资源集中在青海省11%地区；空间分布密度呈由东向西辐射（型）的分布趋势；空间回归分析结果显示，在地势平坦、
ZHULitao(朱利涛) +3 more
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Deciphering the suppressive effects of CBX8 on prostate cancer cell invasion [PDF]
, 2023 Objective·To elucidate the regulatory mechanisms of the chromobox protein homolog 8 (CBX8) in prostate cancer metastasis from transcriptome and epigenetic modification perspectives.Methods·The correlation between the expression of CBX proteins and ...
LAO Yimin +3 more
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肾透明细胞癌差异表达基因的筛选及其核心基因相应miRNA和lncRNA预测分析 [PDF]
, 2018 【目的】筛选肾透明细胞癌(ccRCC)中差异表达基因并其相关miRNA和lncRNA,寻找可作为ccRCC诊断及治疗的生物标志物。【方法】通过从TCGA数据库和GEO数据库筛选ccRCC差异表达基因并取交集,对差异表达基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,使用MCODE软件筛选出差异表达基因中的核心基因,并利用mirDIP数据库和STARBASE数据库对核心基因上游的miRNA和lncRNA进行预测。【结果】共筛选出427个差异表达基因,这些差异表达基因在GO功能分析上主要与催化活性 ...
朱合欢 +5 more
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Zhongguo cuzhong zazhi, 2023 目的 通过对人脑胚胎发育中期的血管组成细胞进行分析，探索围产期卒中性别差异的可能原因。 方法 对公开发表的性别相关全基因组关联分析（genome-wide association study，GWAS）结果和血管单细胞转录组进行联合分析，确定性别差异相关的细胞类型。通过基因差异表达分析和功能富集分析，确定性别对细胞功能的影响，分析围产期卒中性别差异产生的潜在原因。 结果 经过判定，在胚胎发育中期血管单细胞转录组数据集的7例样本中，有4例男性和3例女性。典型的周细胞（P=0.018 ...
刘阳, 程丝, 吕天节, 王誉博, 王孟, 许喆, 石延枫, 李子孝, 王拥军
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Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2003 用XRF法对珠江口12根沉积柱中V,Ni和Co含量进行了分析.V,Ni和Co含量分别在48.97×10-6~180.66×10-6,22.12×10-6~72.67×10-6和9.34×10-6~94.42×10-6之间.3种重金属在河口西部和伶仃洋最大混浊带区域含量高,Co同时在河口北部和香港大屿山西岸沉积物中富集.V,Co和Ni在沉积柱中的垂直分布可分为4种类型:均匀分布型、上部富集型、下部富集型和斜"之"字型,它们是各自沉积环境、污染历史以及人类疏浚河口活动的综合反映.相关分析和因子分析显示 ...
PENGXiao-tong(彭晓彤) +4 more
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Quantitative proteomic study of cell cycle of Prorocentrum donghaiense during the blooming period [PDF]
, 2016 东海原甲藻（Prorocentrumdonghaiense）是中国近海主要有害藻华种，几乎每年都会引发大规模的有害藻华，对海洋生态系统、海洋生物资源和水产养殖造成了严重威胁，并且影响公众健康。尽管目前对东海原甲藻藻华形成的海洋学和生态学机制开展了大量研究，但对现场藻华形成过程中东海原甲藻细胞生长调控的分子机制知之甚少。 本论文以现场东海原甲藻藻华为研究对象，运用基于质谱的定量蛋白质组学技术—iTRAQ（isobarictagsforrelativeandabsolutequantitation）技术 ...
刘九玲
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comparative analysis of Litopenaeus vannanmei by transcriptome sequencing and characterization of two immune-relevant genes [PDF]
, 2015 南美白对虾是目前对虾养殖的主要品种，具有巨大的经济价值。然而，病害的发生严重危害其养殖业的发展，研究对虾的先天免疫反应能够给对虾养殖中病害的防治提供重要的理论基础。 转录组测序能够分析某一生理条件下细胞内所有mRNA的表达水平，本研究通过二代测序技术首次比较分析了对WSSV（whitespotsyndromevirus）抗性差异的两种南美白对虾群体的转录组，它们的基因表达水平存在明显差异，具有750个明显差异表达的基因，普通对虾及抗病对虾群体在病毒感染前后分别有479和132个差异表达基因 ...
徐景祥
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Detoxification and Antioxidant Defence of Marine Medaka(Ozyzias melastigma) Liver against Hexavalent Chromium Exposure [PDF]
, 2016 近年来，随着工业化进程的深入和沿海城市化的发展，工农业和城市生活污水的排入，导致近海海域铬污染问题日益严重，对海洋生物生存和人类健康造成了危害。海洋青鳉鱼(Oryziasmelastigma)因其对水质、环境变化敏感，被广泛应用于海洋污染物的毒理学研究中，是一种新兴的海洋生态毒理学模式生物。为探究海洋鱼类对六价铬暴露的抗氧化防御、解毒机制，本论文以海洋青鳉鱼成鱼肝脏、幼鱼为材料，进行了初步探讨。得到以下结果： （1）以3月龄海洋青鳉鱼成鱼进行Cr6+暴露试验，试验组Cr6+浓度设置为2.6lmg/L、5.
万磊
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