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肾透明细胞癌Caki-1细胞系差异表达基因的生物信息学分析 [PDF]
, 2018 目的比较肾透明细胞癌Caki-1细胞系与正常肾上皮细胞系ASE-5063中的差异表达基因(DEGs),寻找潜在的肾透明细胞癌特异性分子标志物。方法利用GEO数据库自带的GEO2R在线分析工具分析基因芯片GSE78179,将筛选出的DEGs分别导入Metascape、STRING以及Cytoscape进行综合分析并筛选出核心基因。最后使用Fun Rich等软件对筛选出的核心基因进行GO和KEGG富集分析。结果共筛选出562个DEGs,其中上调基因345个,下调基因217个 ...
朱合欢 +5 more
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Integrative Conservation, Volume 4, Issue 3, Page 430-441, September 2025.Our study identifies southern China, including mountainous regions and islands, as key areas rich in phylogenetic diversity, and phylogenetic endemism of lizards that are currently under‐protected. Current protected areas however do not adequately cover regions that are critical for preserving the evolutionary history of lizards.
Tao Liang (梁涛) +8 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2022 目的 非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌死亡的最主要原因，本研究通过获取NSCLC组织和正常组织的mRNA和microRNA表达数据集，分析影响NSCLC预后的基因及其可能的致癌机制。方法 从GEO数据库中获取5个mRNA数据集和1个miRNA数据集，利用limma软件包从mRNA数据集中筛选差异表达基因（DEGs），进一步利用ClueGO插件分析其通路富集信息，并利用GEPIA软件分析DEGs与肿瘤分期和预后的相关性。然后通过ENCORI、GENEMANIA和STRING数据库预测相互作用的miRNA ...
孙珊珊, 冯虎, 毕莎杉
doaj
Morphological Observation and Transcriptome Analysis During True-vivipary Development in Mangrove Kandelia obovata [PDF]
, 2017 植物界中的胎生现象是指有性生殖产生的后代在母体上不经休眠或短暂休眠即萌发，以潮间带红树植物最为显著。虽然在形态结构、生理生化、生态适应等水平对红树植物的胎生现象已有所研究，但其涉及的分子机制仍未被阐明。本论文以我国广泛分布并具有重要生态学价值的显胎生红树代表物种秋茄(Kandeliaobovata)为研究材料，对从胚珠受精到胚轴掉落的一系列发育过程进行形态观察，确定具有转变性意义的阶段及组织，并对其中7个关键组织(受精后的胚胎、胚胎突出种皮前后的子叶及下胚轴 ...
周晓旋
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Effectes of perfluorooctanoic acid exposure on mouse embryonic osteoblast precursor cells and its molecular mechanisms [PDF]
ObjectiveTo explore the biological mechanism of bone loss caused by perfluorooctanoic acid (PFOA) through transcriptomic analysis, and to provide new insights into regulating perfluoroalkyl substances (PFAS) applications and the prevention of hazards ...
JIN Yu'e +5 more
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Integrative Conservation, Volume 4, Issue 3, Page 277-286, September 2025.This study provides an innovation to address the challenge in accessibility to samples and genetic markers in Snow leopard conservation genetic studies. We performed next‐generation sequencing (NGS) on 19 fecal samples obtained from the eastern Qinghai‐Tibet Plateau, and successfully assembled 17 complete mitogenome sequences (~16,720 bp) and ...
Chen Cheng +7 more
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Shuitu Baochi Xuebao, 2007 以南湖水体中的水、表层沉积物、生物膜和悬浮物为研究对象,对美国EPA规定的16种优控PAHs中13种PAHs的分布与富集特征进行了研究。结果表明,表层沉积物中检出12种PAHs,生物膜和水相中均检出11种PAHs,而悬浮物中只检出7种PAHs;生物膜和悬浮物富集PAHs的能力相近,比表层沉积物的富集能力大一个数量级;相关分析表明,生物膜和悬浮物富集PAHs的能力归因于其有机质（TOC）的含量高于表层沉积物中有机质的含量。根据菲/蒽比值和PAHs环数相对丰度对南湖表层沉积物中PAHs的来源进行了分析 ...
王晓丽 +5 more
doaj
基于多数据集分析骨髓增生异常综合征相关的原发性免疫缺陷核心基因
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2023 目的 利用生物信息学方法探索骨髓增生异常综合征(MDS)发生发展机制，为筛选早期MDS辅助诊断指标提供理论依据。方法 选择来源于Gene Expression Omnibus数据库的人类MDS基因芯片或高通量转录组测序数据，利用R语言及相关包对数据集进行差异表达分析，采用STRING结合CytoHubba分析差异表达基因互作网络关系，并获取degree值前10的核心基因；利用GSEA对数据集进行通路富集，从而获取与显著富集通路相关的核心基因并评价其诊断效能。结果 本研究以正常组为对照 ...
连晓强, 张稳, 张栋栋, 穆红
doaj
Comparative transcriptomics analysis between the fifth larvae and females of Angiostrongylus cantonensis and the expression pattern analysis of AC-14-3-3 [PDF]
, 2016 广州管圆线虫（Angiostrongyluscantonensis）是一种非常重要的人畜共患病病原寄生虫，近年来已在更广的宿主和地理分布范围内发现了该寄生虫感染的存在。然而，在公共数据库中可获得的相关资源信息非常有限，这极大地限制了人们对该寄生虫在入侵宿主、寄生生活和免疫逃避等方面机制的深入研究，也严重影响了在该病诊断、治疗和抗虫疫苗研制等领域的发展。 广州管圆线虫第五期幼虫（L5）既是可以在人和小鼠等偶然宿主脑内长期存活并引起嗜酸性脑膜脑炎的时期，又是在天然宿主体内可以突破血脑屏障进入肺动脉的时期 ...
余良
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Expression and biological characteristics of long non-coding RNA AL365181.2 in cholangiocarcinoma [PDF]
Objective To investigate the expression level of long non-coding RNA (lncRNA) AL365181.2 in cholangiocarcinoma (CHOL) and its effect on the functional characteristics of CHOL cells.
WANG Qinlei, SUN Zhaowei, GUO Jingyun, LI Haoran, FENG Yujie, ZHANG Bingyuan
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