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基于代谢组学的食管鳞癌代谢特征与临床意义研究

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2021
目的比较食管鳞癌患者和健康志愿者的血清代谢谱,寻找食管鳞癌特有的代谢标志物。方法选择一组明确诊断的食管鳞癌患者作为实验组、一组健康志愿者作为对照组,以液相色谱-质谱法(LC-MS)检测其血清轮廓代谢谱,通过单变量分析和多变量(主成分分析及偏最小二乘回归分析法等)比较两组代谢谱并寻找差异性代谢物,通过代谢物质通路的富集分析探讨其可能异常生物学过程。结果入组食管鳞癌患者20例为实验组,健康对照20例为对照组,变异倍数分析和T检验等单因素分析结果得出21种差异性代谢物(P<0.05);选择单变量分析P ...
黄伟钊   +5 more
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万山汞矿区弹琴蛙重金属富集与组织关联分析

open access: yes野生动物学报
为了解万山汞矿区弹琴蛙(Nidirana adenopleura)组织重金属富集特征及其关联,对万山汞矿区典型农田生境内弹琴蛙组织(肝脏、皮肤、股骨、肌肉和趾骨)中铬(Cr)、锰(Mn)、镍(Ni)、铜(Cu)、锌(Zn)、镉(Cd)、铅(Pb)、砷(As)、硒(Se)和汞(Hg)这10种重金属元素的生物富集特征差异进行分析,结合非负矩阵分解分析法识别重金属元素的来源及贡献,并通过灰色关联度分析法分析弹琴蛙组织重金属元素间的关联性。结果表明:重金属元素在万山汞矿区弹琴蛙体内富集程度不同 ...
张晓东   +4 more
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霍乱弧菌新发菌株中vipAvipBclpV对T6SS转录调控

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2022
目的探索霍乱弧菌新发菌株H1的六型分泌系统(T6SS)存在的转录调控机制。方法本研究以转录组测序为基础,分析H1株分别由于vipA敲除(H1ΔvipA),vipB敲除(H1ΔvipB)和clpV敲除(H1ΔclpV)时T6SS基因簇的转录水平,并对其差异基因进行了基因本体论(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集。结果发现H1ΔvipA有22个差异基因(FDR<0.01,|log2FC|≥1),其中有18个属于T6SS基因簇;并且除vipA外,其转录水平均呈上升趋势 ...
吴文轩, 郭扬, 张幸鼎, 赵文婧
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白附子凝集素的亲和纯化及其理化性质的研究

open access: yes四川大学学报. 自然科学版, 1986
用鸡卵类粘蛋白—Sepharose作亲和吸附剂,以线性离子梯度洗脱后,活性部分进一步于Sepharose 6B 凝胶过滤,所得凝集素制品经连续PAGE(pH8.9和pH 4.3)以及Disc—SDS—PAGE鉴定,均呈单一蛋白带,用SDS—PAGE和凝胶渗透色谱测其分子量分别为22,500和24,000.凝胶等电聚焦测其pI为4.6,氨基酸组成分析表明该凝集素富含Asp,而含硫氨基酸甚少,DNS—聚酰胺薄膜层析分析其N—未端氨基酸残基为Ala.紫外吸收光谱表明该凝集素在pH7.5、0.1M PBS下 ...
肖智雄
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谷胱甘肽还原酶影响结肠癌代谢及预后:一项基于蛋白组学与微阵列芯片分析的研究 附视频

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue
目的 探讨谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase, GSR)对结肠恶性肿瘤代谢的影响及其对结肠癌患者的预后价值。方法 通过蛋白组学差异分析获得结肠癌组织和正常结肠上皮组织的差异蛋白,并通过富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)分析鉴定代谢通路中的关键蛋白,进行生存分析和临床信息相关性分析。收集120例结肠癌患者手术病理标本制作组织微阵列芯片,进行免疫组织化学染色。结果 蛋白组学差异分析共鉴定出1 209个差异表达蛋白。KEGG富集分析显示,差异蛋白显著富集于代谢通路 ...
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好氧颗粒污泥长期运行下微生物菌群结构研究

open access: yesGongye shui chuli, 2023
亚洲首座Nereda®好氧颗粒污泥污水处理厂(AGS-WWTP)在浙江省龙游县落地,并取得了良好的成效。好氧颗粒污泥(AGS)在长期运行过程中会形成稳定的粒径和元素组成,微生物群落结构发生演变并趋于平衡。为探究实际污水处理厂长期运行中产生的AGS与一般活性污泥(AS)的差异,通过有机元素分析和胞外聚合物(EPS)分析探究了AGS与AS在成分上的差异,通过高通量测序探究了AGS与AS在微生物群落组成上的不同。结果表明,相比于AS,AGS的有机成分相差不大,但是含有更丰富的EPS ...
徐萍, 占晓建, 李凤祥
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孔雀石绿分子印迹聚合物的合成及吸附性能研究

open access: yes四川大学学报. 自然科学版, 2012
采用本体聚合法制备了孔雀石绿分子印迹聚合物.用紫外光谱、红外光谱研究了印迹聚合物的结合位点和识别机理;用扫描电镜对聚合物进行了表面形态分析;自制分子印迹固相萃取柱,研究聚合物对孔雀石绿的分离富集效果.结果表明,模板分子和功能单体通过氢键或离子键作用形成1:2型配合物;印迹聚合物粒径分布在45~80μm之间,表面富含微孔结构,有利于对孔雀石绿的吸附.实际样品测定表明,印迹聚合物具有较好的分离富集效果,可以满足痕量孔雀石绿的测定.
曹慧, 张小刚, 徐斐, 于劲松
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极端嗜热纤维素分解菌分子特征

open access: yes四川大学学报. 自然科学版, 2005
从云南邦拿掌温泉中采集样品,经过多次富集、筛选,最后分离出6株高温严格厌氧纤维素分解细菌.通过随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,研究了这6株形态、生理、代谢特性相似的高温严格厌氧纤维素分解菌的遗传多样性,并根据实验统计数据作出6株菌的亲缘关系图.同时对产酶活性较高的B7细菌进行16SrDNA序列分析,确定了其系统分类地位.
邱成书   +5 more
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利用Illumina MiSeq测序平台分析健康与腹泻食蟹猴粪样菌群

open access: yes野生动物学报, 2019
本试验通过对比健康与腹泻食蟹猴粪便菌群的差异,初步探讨腹泻对食蟹猴粪便菌群的影响。采集成年腹泻与健康食蟹猴粪样各6份,用细菌16Sr DNA通用引物扩增V3—V4 区,采用Illumina MiSeq测序平台对食蟹猴粪便微生物进行研究。结果表明,Alpha多样性指数分析,健康组与腹泻组的微生物多样性指数(Shannon、Simpson)差异不显著,群落丰富度指数(Chao、Ace)差异显著。PCA主成分分析,健康组与腹泻组粪便菌群具有明显的差异。通过对健康组与腹泻组物种菌群组成分析 ...
张飞燕 1 金洁 1 刘超 1 胡正飞 1 张玉林 1 谢丽分 1 邬继文 1 吕龙宝 1
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基于微阵列技术探究帕金森病相关免疫特征的研究

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue
目的利用公开的帕金森病(Parkinson’s disease,PD)外周血的基因表达谱数据,通过免疫浸润分析其免疫差异,利用差异基因分析、构建蛋白-蛋白相互作用(Protein-protein interaction,PPI)网络,寻找PD新的潜在生物标志物,为探究PD的相关免疫特征提供新的思路。方法本研究所用的基因转录组RNA测序数据(GSE6613和GSE57475)和患者临床性状相关数据均来源于GEO数据库。外周血转录组数据包括50例PD、93例早期帕金森病(Early Parkinson’s ...
何敏   +6 more
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