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Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
目的 通过高分辨率单细胞蛋白质组学技术对小鼠次级卵母细胞与第一极体的蛋白质组差异进行分析，筛选出调控胚胎发育的关键特征蛋白，为优化卵母细胞体外成熟体系提供分子依据。 方法 采用高分辨率单细胞质谱仪（timsTOF HT）对5组配对样本（次级卵母细胞与第一极体）进行蛋白质组检测，通过定量分析结合生物信息学方法完成差异蛋白筛选及功能富集分析。 结果 该技术实现单样本3 000余种蛋白质的检测灵敏度，并成功鉴定出277种次级卵母细胞特异性表达蛋白。基因集富集分析（Gene Set Enrichment ...
晓丹 Xiaodan 范 FAN +1 more
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目的 通过高分辨率单细胞蛋白质组学技术对小鼠次级卵母细胞与第一极体的蛋白质组差异进行分析，筛选出调控胚胎发育的关键特征蛋白，为优化卵母细胞体外成熟体系提供分子依据。 方法 采用高分辨率单细胞质谱仪（timsTOF HT）对5组配对样本（次级卵母细胞与第一极体）进行蛋白质组检测，通过定量分析结合生物信息学方法完成差异蛋白筛选及功能富集分析。 结果 该技术实现单样本3 000余种蛋白质的检测灵敏度，并成功鉴定出277种次级卵母细胞特异性表达蛋白。基因集富集分析（Gene Set Enrichment ...
晓丹 Xiaodan 范 FAN +1 more
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基于生物信息学分析探究维奈克拉对急性髓系白血病的治疗敏感性及耐药机制
Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi目的 探究维奈克拉对急性髓系白血病（AML）的抑癌作用及耐药机制。 方法 从Beat AML数据库下载BCL-2抑制剂维奈克拉药敏试验的AML患者基因组、转录组及临床信息数据，对其与药敏试验结果进行相关性分析。通过对转录组数据进行差异分析，筛选出与维奈克拉治疗敏感性相关的差异基因并使用GEO数据库转录组结果及体外实验进行验证。同时应用KEGG、GSEA以及KnockTF转录因子富集分析及公共数据库进一步探讨影响药物敏感性的关键基因。 结果 过滤得到52例进行维奈克拉药敏试验的患者数据。分析结果表明 ...
阳. Y. 杨 Yang +7 more
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Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
背景与目的 肺癌是目前世界上发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一。然而，肺癌进展的确切机制仍不清楚。肿瘤坏死因子受体相关因子（tumor necrosis factor receptor associated factor, TRAF）家族成员是胞质接头蛋白，既行使接头蛋白的功能又具有泛素连接酶活性，可调控多种受体信号途径，进而激活核因子κB（nuclear factor kappa-B, NF-κB）、有丝分裂原活化蛋白激酶（mitogen-activated protein kinase, MAPK ...
Yixuan Wang +8 more
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背景与目的 肺癌是目前世界上发病率和死亡率较高的恶性肿瘤之一。然而，肺癌进展的确切机制仍不清楚。肿瘤坏死因子受体相关因子（tumor necrosis factor receptor associated factor, TRAF）家族成员是胞质接头蛋白，既行使接头蛋白的功能又具有泛素连接酶活性，可调控多种受体信号途径，进而激活核因子κB（nuclear factor kappa-B, NF-κB）、有丝分裂原活化蛋白激酶（mitogen-activated protein kinase, MAPK ...
Yixuan Wang +8 more
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Se pu = Chinese journal of chromatography
外泌体是由细胞分泌的纳米级囊泡,其中富含脂质、蛋白质、核酸等多种生物功能分子。外泌体在生物体内的信息传递、疾病机理研究及诊断等方面扮演着类似“物联网、互联网”的关键角色。然而,受限于外泌体来源、尺寸、内含物以及功能的异质性,外泌体分离分析仍然面临诸多挑战。传统外泌体分离分析方法包括超速离心、尺寸排阻和免疫共沉淀等,但这些方法普遍存在产量低、纯度低等问题限制了其进一步的临床应用。微流控技术因其微型化、高通量、自动化和集成化等特点为复杂生物样本的高效分离分析提供了强有力的工具。基于此 ...
Yuhang Xing +3 more
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外泌体是由细胞分泌的纳米级囊泡,其中富含脂质、蛋白质、核酸等多种生物功能分子。外泌体在生物体内的信息传递、疾病机理研究及诊断等方面扮演着类似“物联网、互联网”的关键角色。然而,受限于外泌体来源、尺寸、内含物以及功能的异质性,外泌体分离分析仍然面临诸多挑战。传统外泌体分离分析方法包括超速离心、尺寸排阻和免疫共沉淀等,但这些方法普遍存在产量低、纯度低等问题限制了其进一步的临床应用。微流控技术因其微型化、高通量、自动化和集成化等特点为复杂生物样本的高效分离分析提供了强有力的工具。基于此 ...
Yuhang Xing +3 more
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自主研发的藏四味清肺合剂雾化对香烟烟雾诱导的COPD小鼠气道炎症的影响及网络药理学分析
Zhong nan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Central South University. Medical sciences目的 慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease，COPD)发病率和病死率高，严重危害患者的生活质量，造成了严重的经济及公共卫生负担，以COPD为首的慢性呼吸系统疾病已被世界卫生组织列为全球四大慢性病。藏四味清肺合剂(Zangsiwei Qingfei Mixture，ZSWQF)是本研究团队自主研发的全新藏药处方合剂，用以治疗慢性呼吸系统疾病。本研究旨在探讨ZSWQF雾化吸入对香烟烟雾诱导的COPD小鼠气道炎症的影响及其潜在作用机制。 方法 ...
Meizhi Li +6 more
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Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
目的 借助生物信息学技术探究骨质疏松中铁死亡的基因靶点并利用体外实验验证骨质疏松中铁死亡关键基因，探讨铁死亡在骨质疏松中的作用机制。 方法 在基因芯片公共数据库中筛选骨质疏松相关基因数据集GSE35958并进行数据矫正分析；在FerrDb数据库中筛选铁死亡相关基因，并与数据集GSE35958差异表达基因取交集得到骨质疏松中铁死亡相关差异表达基因，然后进行差异表达基因的基因本体（GO）与京都基因和基因组数据库（KEGG）富集分析；分析差异表达基因的Spearman相关系数，并绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络，
Yushuang Xia +6 more
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目的 借助生物信息学技术探究骨质疏松中铁死亡的基因靶点并利用体外实验验证骨质疏松中铁死亡关键基因，探讨铁死亡在骨质疏松中的作用机制。 方法 在基因芯片公共数据库中筛选骨质疏松相关基因数据集GSE35958并进行数据矫正分析；在FerrDb数据库中筛选铁死亡相关基因，并与数据集GSE35958差异表达基因取交集得到骨质疏松中铁死亡相关差异表达基因，然后进行差异表达基因的基因本体（GO）与京都基因和基因组数据库（KEGG）富集分析；分析差异表达基因的Spearman相关系数，并绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络，
Yushuang Xia +6 more
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NIP7促进泛素缀合酶E2 C表达介导甲状腺未分化癌细胞增殖及肿瘤生长
Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences目的 探讨核仁前rRNA加工蛋白NIP7（NIP7）在维持甲状腺未分化癌（ATC）恶性表型中的作用及分子机制。 方法 利用基因表达谱芯片（GSE33630）、蛋白质组学数据集（IPX0008941000）和Dependency Map数据库分别分析NIP7在ATC组织中的表达及细胞上的基因敲除效应。通过蛋白质印迹法检测NIP7在正常甲状腺细胞、甲状腺乳头状癌细胞和ATC细胞上的表达及定位。在ATC细胞上转染小干扰RNA并用定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）和蛋白质印迹法检测NIP7的沉默效率 ...
荧荧 Yingying 龚 GONG +4 more
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Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
目的 基于网络药理学、分子对接及实验验证，探究红景天苷改善高原认知功能的靶点及分子机制研究。 方法 通过SwissTargetPrediction平台筛选红景天苷相关靶点，利用Genecards数据库检索高原认知功能靶点，利用VENNY 2.1平台对红景天苷和高原认知作用靶点取交集制作韦恩图，使用STRING11.5 数据库构建蛋白互作网络图筛选关键靶点。利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG 通路富集分析，并通过Cytoscape3.7.2 软件进行成分-靶点-通路网络构建 ...
Yuemei Sun +6 more
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目的 基于网络药理学、分子对接及实验验证，探究红景天苷改善高原认知功能的靶点及分子机制研究。 方法 通过SwissTargetPrediction平台筛选红景天苷相关靶点，利用Genecards数据库检索高原认知功能靶点，利用VENNY 2.1平台对红景天苷和高原认知作用靶点取交集制作韦恩图，使用STRING11.5 数据库构建蛋白互作网络图筛选关键靶点。利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG 通路富集分析，并通过Cytoscape3.7.2 软件进行成分-靶点-通路网络构建 ...
Yuemei Sun +6 more
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