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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2013 目的对低水平乙型肝炎病毒表面抗原进行病毒S区基因分析。方法利用套式PCR法（Nested PCR）特异性扩增乙型肝炎病毒DNA的S区,对PCR扩增产物直接进行DNA序列分析,测序结果经Genotyping软件分型并与美国GeneBank中基因序列进行BLAST比对。结果 37例低水平乙型肝炎病毒表面抗原标本中,成功扩增并测序32份,其余5份扩增产物因不满足测序要求无法进行S区序列分析,32份成功测序标本经Genotyping分型,B型20例,C型12例,分别与GeneBank中收录的AF100309 ...
计玉仙 +8 more
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四川大学学报. 自然科学版, 1999 对利用基因启动子探针型载体ｐＳＵＰＶ２，从枯草杆菌ＡＳ１．３９８中克隆３个稳定的具有强启动功能的ＤＮＡ片段，进行限制酶切分析发现，ｐＢＳＵ２２和ｐＢＳＵ４３中的插入片段小于０．２ｋｂ，ｐＢＳＵ４４中的插入片段为３ｋｂ．测序结果表明，３个插入片段中都有较为典型的原核生物基因启动子序列，其中ｐＢＳＵ２２和ｐＢＳＵ４３的插入序列几乎完全相同．同源性分析结果表明，这３个基因启动子序列与枯草杆菌全基因组序列中的两个未知功能的基因启动子序列，其同源性高达７０％以上．
黄庆, 胥成浩, 张义正
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2001 报告中山医科大学寄生虫学教研室医学昆虫学室近5 年来有关蚊虫细胞色素P450 基因(CYP450)系列研究 结果, 包括:①通过简并引物PCR 分别从致倦库蚊、白纹伊蚊及中华按蚊中获得3 个、2 个、2 个CYP4 家族成员基因片段;通 过简并引物PCR 及RT-PCR 从白纹伊蚊中获得16 个CYP6 家族成员基因片段;②利用cDNA 末端快速扩增(RACE)法获得 了白纹伊蚊CYP 6 家族3 个新的全长cDNA 序列及7 个超过其全长一半以上的cDNA 序列。GenBank ...
黄炯烈 +4 more
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野生动物学报, 2015 世界现存15种鹤,该研究采集了7种鹤的样本,获得21条鹤类COI条码序列(695 bp),从GenBank数据库下载41条COI序列,最终获得62条长为620 bp的COI序列用于分析。分析获得25个单倍型,其中包括5个新发现单倍型。共发现143个变异位点,皆为简约信息位点,非同义突变位点7个。根据COI条码片段推算出长为206个氨基酸的蛋白质序列,发现5个非同义氨基酸突变位点,皆为中性氨基酸突变。15种鹤科鸟类25个COI条码单倍型的一致性为87.1%～100.0%,分歧为0.0%～14.6 ...
符 渊 白素英 田秀华
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, 2011 柱状黄杆菌(Flavobacterium columnare)是世界范围内危害淡水鱼类的柱形病的病原。目前对该病原菌遗传操作系统的研究进展较慢,而寻找高效稳定的启动子来调控外源基因在细菌体内的表达,有可能促进该细菌遗传操作系统的构建。本研究获得了柱状黄杆菌乙酰辅酶A合成酶基因(acetyl-coenzyme A synthetase gene,acs)的编码序列及其上游调控序列,该基因全长2 323 bp,编码635个氨基酸。通过序列分析,发现在该基因起始密码子ATG的上游存在核糖体结合位点 ...
聂品, 姚卫建, 邹红, 张金
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2013 【目的】 分析预测申克孢子丝菌ｃＤＮＡ中编号为Ｌｏｃｕｓ＿１６８＿Ｃｏｎｔｉｇ＿１序列编码的基因及蛋白质结构、功能特征，并进行分子克隆。 【方法】 利用ＮＣＢＩ及Ｅｘｐａｓｙ网站提供的ＢＬＡＳＴｘ、ＳｉｇｎａｌＩＰ、ＩｎｔｅｒＰｒｏ Ｓｃａｎ等生物信息学软件分析其序列，判断其是否为全长编码序列、同源序列名称，并分析其结构、定位及功能等；将其中的全长编码区利用ＰＣＲ方法进行扩增后克隆到ｐＥＴ－３０ａ（＋）载体，测序验证。 【结果】 该序列是亚精胺合成酶（ＳＰＤＳ）的同源基因，全长序列为１０６２ ｂｐ ...
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海洋喇叭虫rRNA基因18S -ITS1序列及其系统发育分析(英文)
, 2004 海洋喇叭虫Maristentordinoferus 1996年在关岛(Guam)的珊瑚暗礁上被发现 ,至今尚未阐明其确切的系统发育地位。克隆到的海洋喇叭虫的 18S ITS1 5 8SrDNA序列包括 2 2 2bp的 18S序列 ,77bp的ITS1序列和 2 2bp的 5 8S序列。比较分析了纤毛虫主要类群的ITS1序列后得出 :短的ITS1序列可能是异毛类纤毛虫的特征。根据 18S序列 ,利用邻接法构建 ,最大简约法和最大似然法构建系统发育树。其拓扑结构显示海洋喇叭虫属于异毛纲纤毛虫 ...
傅诚杰,缪炜,LOBBAN Chris,沈韫芬
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野生动物学报, 2018 对分离自国内虎源的犬瘟热病毒进行细胞培养及PCR鉴定,并对H蛋白进行序列及遗传演化分析。结果显示:本分离株经传代培养后可以引起Vero细胞脱落和死亡,且扩增出580 bp的特异性目的片段。H蛋白作为犬瘟热病毒表面膜蛋白,在病毒感染过程中担负着重要的作用,H蛋白识别并吸附于细胞表面受体,决定病毒细胞嗜性,进而决定病毒的宿主特异性。对本研究中H蛋白进行分析发现:全长共1 824个碱基,共计编码608个氨基酸,H蛋白具有9个N-糖基化位点,具有549Y的特点。在Genbank中进行Blast分析表明 ...
单 芬 吴其锐 邹洁建 花福有 陈 武
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, 2012 [[abstract]]由於人類基因體計畫(Human Genome Project)提供了完整的人類基因序列，使用基因體序列資訊來分析基因功能之相關研究，已經在世界各地展開。利用基因序列資料能夠進行基因功能研究，而基因的結構可以分成幾個部份，在這些部份中，對基因表現來說最重要的部份是啟動子(promoter)。本論文提出一個在未知序列中，預測分析啟動子區域的方法。此方法以調控序列的位置權重矩陣(position weight matrix)為基礎，統計調控因子對序列結合強度與位置的相關性，再加上G ...
陳士農;Chen, Shih-Nung
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2014 目的鉴定一个广东省结直肠癌患者人群中发现的HLA新等位基因并检测分析其核苷酸序列。方法采用Qiagen试剂盒提取样本DNA,聚合酶链式反应-直接测序分型技术（PCR-SBT）获得HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1的核苷酸序列及HLA高分辨率分型结果,并分析其与HLA-A*33:03:01基因序列的异同。结果发现1个与HLA-A*33:03:01核苷酸序列高度相似的新等位基因,与已知HLA-A*33:03:01相比,该等位基因在外显子3的碱基位置492出现T→A点突变 ...
肖灿军 +7 more
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