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Evaluating surrogates of genetic diversity for conservation planning

open access: yesConservation Biology, Volume 35, Issue 2, Page 634-642, April 2021., 2021
Abstract Protected‐area systems should conserve intraspecific genetic diversity. Because genetic data require resources to obtain, several approaches have been proposed for generating plans for protected‐area systems (prioritizations) when genetic data are not available. Yet such surrogate‐based approaches remain poorly tested.
Jeffrey O. Hanson   +9 more
wiley   +1 more source

Molecular Phylogeny of 9 Sciaenid Fishes in East China Sea and Genetic Structure of Large yellow croaker Stocks [PDF]

open access: yes, 2014
石首鱼科(Sciaenidae)隶属鲈形目,在全世界范围内共有70个属300余种,是鲈形目中属种最多的科之一。我国沿海石首鱼类种属众多,共有17个属30多种。石首鱼科的绝大多数种类肉味鲜美、经济价值高,是海洋渔业和海水养殖的重要对象。石首科鱼类是我国海洋经济鱼类中产量最大的类群之一,其中大黄鱼(Larimichthyscrocea)曾占据着中国“四大海产”的“半壁江山”,是中国重要的海洋经济鱼类。 本研究以我国常见石首鱼的系统发育关系为切入点,分析大黄鱼SSR在亲缘物种中的通用性,进而利用EPIC标记 ...
江丽华
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国内虹鳟代表性养殖群体的高通量SNP芯片检测及遗传分析 [PDF]

open access: yes, 2018
本研究旨在对国内虹鳟(Oncorhynchus mykiss)代表性养殖群体开展全基因组水平的遗传评估。利用57K单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,检测了来自不同地域的6个虹鳟养殖群体样本共计48尾,包括黑龙江虹鳟、黑龙江金鳟、四川虹鳟、四川金鳟、北京虹鳟和北京金鳟,共获得有效SNP位点50201个,在中国虹鳟中的多态比例达到97.7%,表明该芯片虽然基于美国和挪威虹鳟群体设计,但对中国群体同样具有良好的适用性。各群体最小等位基因频率均值为0 ...
Gao Guangtu   +8 more
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Genetic Diversity Analysis of Five Populations of Paphia undulata [PDF]

open access: yes, 2016
采用形态特征和微卫星分子标记对采自菲律宾(PH)、泰国(TH)、福建云霄(YX)、海南儋州(HN)和广西北海(BH)的5个地理群体的波纹巴非蛤(Paphia undulata)进行遗传多样性分析.形态差异分析结果显示,国外群体和国内群体形态差异明显:2个国外群体(PH和TH)形态接近,聚为一支;国内支系中,YX和HN群体的形态较近,先聚为一支,而BH群体的外部形态与前两者差异较大.Hardy-Weinberg平衡检验检测到所有群体在5个位点上均出现不同程度地偏离平衡.5个群体间遗传分化指数(FST,0 ...
张鹏飞   +5 more
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Molecular systematics and genetics diversity of two lancelets in China Seas [PDF]

open access: yes, 2009
文昌鱼由于其独特的系统进化地位,而被广泛用作研究分子进化、胚胎发育和脊椎动物起源的关键模式生物。从分子水平开展对文昌鱼的研究大多集中在基因/基因家族的演化等方面,对该类动物的起源进化、系统发育和遗传多样性的研究还远远不够深入。 在本研究中,我们测定了厦门分布的日本文昌鱼线粒体基因组全序列,结合本实验室先前测得的白氏文昌鱼mtDNA全序列,与已报道的来自日本和中国其它海区的样本数据进行了比较,进一步确证厦门海域的鳃口文昌鱼属有2个独立的物种 ...
钟婧
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Preliminary study on population genetic diversity of the little egret (Egretta garzetta) with microsatellite loci [PDF]

open access: yes, 2012
白鹭(Egrettagarzetta)是在全球分布广泛的湿地鸟类,曾被列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》名单附录III(2003)。为对其遗传多样性等种群遗传学特征进行研究,本研究筛选获得用于白鹭种群遗传学研究的12个多态性微卫星位点,建立了白鹭羽毛的微卫星分型技术体系。在此基础之上,本文初步研究了中国沿海三个白鹭繁殖种群(广西防城港的巫头村、福建厦门猫屿、浙江舟山馒头山)2010年的种群遗传多样性和遗传结构。 微卫星筛选主要利用跨种扩增的方法,从黄嘴白鹭和棕颈鹭的已知位点中选择高多态性的位点进行扩增,
管昊
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Genetic Diversity and Morphological Difference between Two Varieties of Marsupenaneus japonicus [PDF]

open access: yes, 2012
日本囊对虾(Marsupenaeusjaponicus)是我国重要的经济养殖品种,广泛分布于印度—西太平洋海域,在我国的东海和南海均有分布。Tsioetal(2005)根据头胸甲斑纹的形态特征将日本囊对虾分为2种不同形态变异类型,头胸甲侧面的斑纹延伸至头部腹面的为形态变异类型I,头胸甲侧面的斑纹延伸至头胸甲侧面中部的为形态变异类型Ⅱ。形态变异类型I主要分布在日本海、中国东海和南海北部,而形态变异类型Ⅱ则广泛分布于东南亚、地中海和澳大利亚。本文采集了浙江舟山(ZS)、福建厦门(XM)、广东惠来 ...
何永琴
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Screening of SNP Loci of Growth-related Candidate Gene and Genetic Diversity of Five Populations Based On Microsatellite Markers in Fujian Oyster, Crassostrea angulata [PDF]

open access: yes, 2015
福建牡蛎(Crassostreaangulata,C.angulata)又名葡萄牙牡蛎,具有重要的经济价值和生态价值,但由于长期未经选育以及人工育苗的应用,导致牡蛎养殖出现经济性状衰退及死亡率逐年增高等现象,亟需加强种质资源保护,开展遗传改良研究。本研究利用单核苷酸多态性分子标记(singlenucleotidepolymorphism,SNP)对福建牡蛎生长相关的5个候选基因,即胰岛素相关多肽(insulinrelatedpeptides,IRPs)、ɑ-淀粉酶(ɑ-Amylase,ɑ-AMY ...
楚瑞敏
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基于SCI 发文的中国生态学研究态势文献计量分析 [PDF]

open access: yes, 2010
采用文献计量学的方法,基于《科学引文索引》数据库近十年的检索结果,定量分析中国生态学领域发文的主题、时间、作者、机构、合作国家、被引频次、期刊分布等数据,系统分析中国生态学领域近十年的研究发展态势、研究热点、研究投入主体、国际合作和研究水平等趋势和特征。基于检索得到的3316篇SCI论文数据,研究认为:我国生态学领域的研究发展迅速。研究的热点主要是分子标记、气候变化、生物多样性、土地利用、分类学、物种、草原、荒漠化、模型、多态性等方面。研究主题的关联性随时间有增加的趋势。588个第一作者发文机构中 ...
刘天星, 孔红梅, 邢颖
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Gene structure analysis and differentially splicing between Plasmodium yoelii subspecies [PDF]

open access: yes, 2016
啮齿类动物约氏疟原虫(Plasmodiumyoelii)是研究宿主-寄生虫相互关系和疟原虫病理分子基础的一种重要的动物模型。尽管约氏疟原虫YM虫株的基本基因组信息已被测定,在最近也有许多啮齿类动物疟原虫的RNA-seq序列信息已见报道,但不同疟原虫品系或者亚种之间可能存在基因编码区及mRNA转录结构上的差异。构建多种疟原虫品系和亚种的cDNA文库将有助于我们对疟原虫遗传模式和转录组结构的认识。 本研究,我们用约氏疟原虫NSM虫株有或无MQ药物压力的红内期原虫样本构建了两个cDNA文库并对其进行深度测序 ...
刘建文
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