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以湖北武汉和四川宜宾人工增殖放流的胭脂鱼子一代酒精浸泡鳍条样本为材料,提取完整基因组DNA,选用人工合成的生物素标记(AAAG)7探针,采用FIASCO(fast isolation by AFLP of sequences containing repeats)磁珠富集法构建胭脂鱼(Myxocyprinus asiaticus)微卫星富集文库。以MseI-N引物组和设计合成的微卫星核心序列引物(AAAG)5,用双引物PCR法筛选含有微卫星的阳性克隆,从54个阳性克隆中共获得22个微卫星序列 ...
熊美华 +5 more
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为了开发物种特异性微卫星标记,本文采用一种改良的快速微卫星分离法(FIASCO)从长江江豚(Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis)的基因组中筛选得到72条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型、非完美型及复合型序列所占的比例分别为58.3%、22.2%和19.5%。选择其中30条序列设计PCR扩增引物,并用12个随机选择的长江江豚样品进行多态性筛选。初步结果表明其中14对引物的扩增产物稳定并且具有多态性;在每个座位上获得2-13个等位基因 ...
廖小林, 郑劲松, 王丁, 童金苟
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微卫星是进行群体遗传和遗传图谱等研究的极好分子标记。草鱼是我国最重要的经济鱼类之一;但是该种中没有克隆微卫星的报道。我们利用已经公开发表的一批鲤鱼微卫星引物在草鱼中进行异种Pcr扩增尝试;结果发现有5对引物(6个座位)能成功扩增并且有较高多念性;等位基因数在3到7个之间。这些通过异种扩增得到的草鱼微卫星经家系分析证实符合孟德尔遗传规律 ...
廖小林 +3 more
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Isolation of microsatellite markers and population genetic analysis
大黄鱼与银鲫分别是我国海水与淡水重要的经济鱼类。本研究依据研究对象不同分为两大部分。在大黄鱼的研究中,我们首先利用FIASCO 方法分离出微卫星标记,找到15个高度多态的特异性引物。选其中12个微卫星标记,以及4对AFLP选择性引物用于官井洋大黄鱼的一个自然群体和三个养殖群体的研究。所有结果经分析说明养殖行为已经造成了野生以及养殖大黄鱼多态性的下降以及一定程度的遗传分化。 在银鲫方面,我们使用数据挖掘和FIASCO法从银鲫中开发微卫星标记。利用这些引物对本实验室所保种的(A,D,L和F ...
郭葳
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通过FIASCO法(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)筛选宽口光唇鱼Acrossocheilus monticola(Günter)基因组微卫星位点,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AC)8、(CT)8、(GGT)8、(GATA)8和(GATT)7首次成功构建宽口光唇鱼基因组微卫星富集文库。从文库中共筛选495个克隆测序,成功设计163对微卫星引物,经PCR扩增检测,获得了18个多态性微卫星标记。利用这18对多态性引物 ...
谭德清 +4 more
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遗传多样性和亲缘关系的研究对于野生动物种群的健康维持和长久繁衍具有重要意义。为评估三江源国家公园长江源园区藏原羚(Procapra picticaudata)种群的遗传多样性,共采集24个藏原羚集群的149份新鲜粪便样本,利用MB066、HDZ8和HDZ496等8个微卫星位点进行基因分型,最终识别出105个藏原羚个体,并利用性别鉴定引物确定其中有雌性77只,雄性28只。结果表明:8个微卫星位点的平均等位基因数为21.125,平均多态信息含量(PIC)为0.708,观测杂合度(Ho)为0.219~0 ...
李其琴 +4 more
doaj +2 more sources
小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物,过去不合理的森林采伐已导致其生存受到一定威胁,亟需对其种群的遗传变化,特别是遗传多样性和近交衰退等种群遗传信息开展进一步评价,增强保护与管理的针对性。利用微卫星分子标记对黑龙江省南部4个小飞鼠种群进行遗传多样性分析。结果显示:8个微卫星位点检测出种群平均等位基因数为12.9(12.0 ~ 14.4)个,有效等位基因数为8.6(8.1 ~ 8.8)个,观测杂合度为0.887(0.832 ~ 0.925),期望杂合度为0.872(0.865 ~
田新民 +3 more
doaj
目的:鉴定武汉白鱀豚馆及铜陵淡水豚国家级自然保护区两个豢养长江江豚繁殖群体中出生的6头幼豚的生物学父亲。方法:选择8对江豚物种特异性微卫星引物对两个待鉴定群体的14个DNA样品进行了荧光标记PCR扩增,将纯化后的扩增产物在ABI3130遗传分析仪上进行基因分型,并根据GeneScanRox500内标确定不同等位基因的大小,随后对待鉴定对象进行等位基因分析,并计算主要多态性参数。结果:所采用的8个微卫星座位在待鉴定的两个江豚群体中均表现出多态性。在母本已知的条件下,利用其中6个微卫星座位的等位基因数据 ...
郑劲松 +6 more
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羽毛是鸟类研究、监测和管理中常用的非损伤性材料,可从中提取DNA和激素进行遗传和生理分析。然而,作为高度角化的组织,羽翈中的DNA和激素含量极低,提取较为困难。本研究开发一种能够从羽翈中同时提取总DNA和糖皮质激素的方法,命名为DH-CoEx。以丹顶鹤(Grus japonensis)、绿孔雀(Pavo muticus)为代表的大型鸟类廓羽、尾上覆羽和以栗鹀(Emberiza rutila)、小鹀(E.pusilla)为代表的小型鸟类飞羽、绒羽进行测试和评估。结果显示:DH ...
于梦佳 +9 more
doaj

