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Isolation of microsatellites from large yellow croaker (Pseudos ciaena crocea) with PCR [PDF]
, 2005 构建大黄鱼部分基因组DNA文库。以M13通用引物和根据微卫星核心序列所设计的引物,用PCR法直接对文库进行扩增,获得15个PCR阳性克隆,对阳性克隆测序。测序结果说明,6个阳性克隆中含有微卫星核心序列,用Primer 3引物设计软件对侧翼序列进行微卫星引物设计。用6对引物扩增大黄鱼基因组,PCR结果经6%聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,其中2对引物能得到稳定的扩增。A partial large yellow croaker(Pseudosciaena crocea )genomic library was ...
曾红, 林能锋, 许斌福
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Molecular Phylogeny of 9 Sciaenid Fishes in East China Sea and Genetic Structure of Large yellow croaker Stocks [PDF]
, 2014 石首鱼科（Sciaenidae）隶属鲈形目，在全世界范围内共有70个属300余种，是鲈形目中属种最多的科之一。我国沿海石首鱼类种属众多，共有17个属30多种。石首鱼科的绝大多数种类肉味鲜美、经济价值高，是海洋渔业和海水养殖的重要对象。石首科鱼类是我国海洋经济鱼类中产量最大的类群之一，其中大黄鱼（Larimichthyscrocea）曾占据着中国“四大海产”的“半壁江山”，是中国重要的海洋经济鱼类。 本研究以我国常见石首鱼的系统发育关系为切入点，分析大黄鱼SSR在亲缘物种中的通用性，进而利用EPIC标记 ...
江丽华
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Screening of SNP Loci of Growth-related Candidate Gene and Genetic Diversity of Five Populations Based On Microsatellite Markers in Fujian Oyster, Crassostrea angulata [PDF]
, 2015 福建牡蛎(Crassostreaangulata，C.angulata)又名葡萄牙牡蛎，具有重要的经济价值和生态价值，但由于长期未经选育以及人工育苗的应用，导致牡蛎养殖出现经济性状衰退及死亡率逐年增高等现象，亟需加强种质资源保护，开展遗传改良研究。本研究利用单核苷酸多态性分子标记（singlenucleotidepolymorphism，SNP）对福建牡蛎生长相关的5个候选基因，即胰岛素相关多肽（insulinrelatedpeptides，IRPs）、ɑ-淀粉酶（ɑ-Amylase，ɑ-AMY ...
楚瑞敏
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国内虹鳟代表性养殖群体的高通量SNP芯片检测及遗传分析 [PDF]
, 2018 本研究旨在对国内虹鳟(Oncorhynchus mykiss)代表性养殖群体开展全基因组水平的遗传评估。利用57K单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,检测了来自不同地域的6个虹鳟养殖群体样本共计48尾,包括黑龙江虹鳟、黑龙江金鳟、四川虹鳟、四川金鳟、北京虹鳟和北京金鳟,共获得有效SNP位点50201个,在中国虹鳟中的多态比例达到97.7%,表明该芯片虽然基于美国和挪威虹鳟群体设计,但对中国群体同样具有良好的适用性。各群体最小等位基因频率均值为0 ...
Gao Guangtu +8 more
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野生动物学报, 2022 绿孔雀(Pavo muticus)是备受关注的濒危物种。我国南方曾广泛分布的云南亚种(P.m.imperator)目前收缩到中部、南部和西部的局部地区,近年来陆续开展了野外种群调查,但遗传多样性的分析和评估尚未开展。本研究利用从玉溪市新平和峨山交界处采集的野外绿孔雀自然脱落的羽毛,采用11对微卫星标记分析遗传多样性和结构,并与国内主要圈养种群(建群者来自瑞丽地区和其他未确定的地点)进行比较。结果表明:该野生种群的遗传多样性较低,受到近交的影响,遗传多样性进一步丢失的风险较高。遗传结构上 ...
刘思霞 +8 more
doaj
野生动物学报, 2022 小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物(Rodentia),在森林种子传播和维持生态系统平衡等方面发挥着重要的生态学作用。过去不合理的森林采伐,已导致其生存受到一定威胁,为了给小飞鼠东北亚种(P.v.arsenjevi)群体遗传学研究与管理提供重要的分子标记,从鼯鼠科(Pteromyidae)的小飞鼠指名亚种(P.v.volans)、北美飞鼠(Glaucomys sabrinus)、海南小飞鼠(Hylopetes phayrei)、赤颊林飞鼠(H.sagitta)和松鼠科 ...
田新民 杨孟平 宋雅祺 刘小慧 廉明栋 陈 红
doaj
Preliminary study on population genetic diversity of the little egret (Egretta garzetta) with microsatellite loci [PDF]
, 2012 白鹭（Egrettagarzetta）是在全球分布广泛的湿地鸟类，曾被列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》名单附录III（2003）。为对其遗传多样性等种群遗传学特征进行研究，本研究筛选获得用于白鹭种群遗传学研究的12个多态性微卫星位点，建立了白鹭羽毛的微卫星分型技术体系。在此基础之上，本文初步研究了中国沿海三个白鹭繁殖种群（广西防城港的巫头村、福建厦门猫屿、浙江舟山馒头山）2010年的种群遗传多样性和遗传结构。 微卫星筛选主要利用跨种扩增的方法，从黄嘴白鹭和棕颈鹭的已知位点中选择高多态性的位点进行扩增，
管昊
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野生动物学报, 2017 对虎皮鹦鹉(Melopsittacus undulatus)全基因组中微卫星分布特征进行了分析,查找到l～6个碱基重复类型的微卫星序列共90 346个,约占整个基因组总长度的序列(1.1 Gb)的0.41%,分布频率为82.9/Mb。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为50 349个,占总数的55.7%; 其次是二、四、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的16.3%,13.7%,10.8%,2.9%,0.5%。单碱基微卫星中A重复类型数量最多,二碱基中AT最多,三碱基中AAT ...
黄 杰 原宝东 杨承忠
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野生动物学报, 2022 利用12个微卫星位点复合扩增构建马来穿山甲(Manis javanica)个体识别体系,评估其种群遗传多样性和遗传结构。结果显示:重构的个体识别体系累积无关个体基因型匹配概率(P(ID))和同胞个体基因型匹配概率(P(ID)sibs)分别为6.48×10-16和9.65×10-6,具有较高的鉴别力和灵敏度。在135只马来穿山甲个体上共检测出155个等位基因,多态信息含量(PIC)为0.733,平均等位基因数(Na)为12.91,平均观测杂合度(Ho)为0.631,平均期望杂合度(He)为0.756 ...
李嘉昊 +5 more
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Genetic Diversity Analysis of Five Populations of Paphia undulata [PDF]
, 2016 采用形态特征和微卫星分子标记对采自菲律宾(PH)、泰国(TH)、福建云霄(YX)、海南儋州(HN)和广西北海(BH)的5个地理群体的波纹巴非蛤(Paphia undulata)进行遗传多样性分析.形态差异分析结果显示,国外群体和国内群体形态差异明显:2个国外群体(PH和TH)形态接近,聚为一支;国内支系中,YX和HN群体的形态较近,先聚为一支,而BH群体的外部形态与前两者差异较大.Hardy-Weinberg平衡检验检测到所有群体在5个位点上均出现不同程度地偏离平衡.5个群体间遗传分化指数(FST,0 ...
张鹏飞 +5 more
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