Evaluating surrogates of genetic diversity for conservation planning
Conservation Biology, Volume 35, Issue 2, Page 634-642, April 2021., 2021 Abstract Protected‐area systems should conserve intraspecific genetic diversity. Because genetic data require resources to obtain, several approaches have been proposed for generating plans for protected‐area systems (prioritizations) when genetic data are not available. Yet such surrogate‐based approaches remain poorly tested.
Jeffrey O. Hanson +9 more
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Regulation of Plasmodium yoelii Oocyst Development by Strain- and Stage-specific Small Subunit rRNA [PDF]
, 2015 疟疾是一种由疟原虫引起的，通过雌性按蚊作为媒介传播的全球性急性寄生虫病。疟原虫的一个独特的特点是在其生活史的不同发育阶段，有转录不同、结构发育期特异性的核糖体RNA（rRNA）起不同的作用；A型基因的转录主要在无性阶段，而S型基因主要在有性阶段或者是蚊期阶段特异表达。然而，至今还没有明确的功能性证据证明不同的rRNA在疟原虫发育的不同阶段能起到特异的作用。我们实验获得了一个具有卵囊发育缺陷表型的约氏疟原虫虫株，缺陷表型表现为卵囊发育较小、迟缓、并且不能发育为有感染力的子孢子 ...
齐艳伟
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, 2018 为开发常见鲑鳟养殖物种通用的遗传分析工具,本研究利用Affymetrix虹鳟（Oncorhynchus mykiss） 57K高通量单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）芯片,对国内代表性鲑鳟养殖群体开展了分型检测,包括山女鳟（Oncorhynchus masou masou）、银鲑（Oncorhynchus kisutch）、美洲红点鲑（Salvelinus fontinalis）、白斑红点鲑（Salvelinus leucomaenis） 4个物种 ...
张瀚元 +7 more
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SSR Polymorphism of Alligator sinesis and Conservation Strategy of Genetic Diversity [PDF]
, 2004 作者简介: 黄 磊( 1978- ) , 硕士研究生, 研究方向: 动物分子遗传 通讯作者。E-mail:wangyqnj@ jlonline. com[中文文摘]扬子鳄 (Alligatorsinensis)是中国特有的珍稀保护动物 ,为保护这一濒危物种 ,我国于 80年代初在安徽宣州先后建立了扬子鳄繁殖研究中心和国家级扬子鳄自然保护区 ,现饲养种群存鳄数量已达 10 0 0 0余头。为了揭示扬子鳄种群的遗传结构 ,共采集了 3 9个个体的样品 ,其中包括 6件剥制标本 ,按代系不同 ,分为野生群、
Eggleston, P +3 more
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Isolation of microsatellite markers, construction of genetic linkage maps and QTL mapping of growth-related traits in small abalone, Haliotis diversicolor [PDF]
, 2011 本研究采用磁珠富集法，用14个探针构建了杂色鲍微卫星富集文库。从文库中随机选取768个阳性克隆进行测序，拼接得到729个重叠群，其中656个重叠群包含微卫星序列。利用微卫星两侧保守区域设计了583对微卫星引物，从中筛选出退火温度在50-64℃，PCR产物稳定扩增、条带清晰的微卫星标记308个。随机选取其中的11个微卫星标记用于标记质量评估，这11个微卫星标记的PIC值在0.7276到0.9163之间，具有高度多态性。 利用开发的308个微卫星标记，以养殖个体♀和野生个体♂杂交F1家系为作图群体 ...
战欣
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Isolation, characterization and application of microsatellite markers in Mud crab, Scylla paramamosain [PDF]
, 2009 摘要 本研究以拟穴青蟹（Scyllaparamamosain）为研究对象，探讨了青蟹微卫星标记的筛选和评价及微卫星标记在青蟹种群遗传学研究和亲缘关系鉴定中的应用。 1.拟穴青蟹微卫星标记的筛选和表征 本研究采用改进的FIASCO法构建了拟穴青蟹微卫星富集文库获得1500多个单克隆菌落，随机挑取600个克隆测序，得到502个序列。使用ClastalX比对除去重复序列后，得到383条独特序列，其中阳性克隆有363条，阳性率为94.78%。对其中257个序列成功设计了271对引物 ...
许晓军
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Study on the Population Genetics of Pseudosciaena crocea and Phylogenetic Perspective in Sciaenidae with Microsatellites [PDF]
, 2008 大黄鱼（Pseudosciaenacrocea）是我国重要的海水养殖鱼类，研究其不同群体的遗传结构对促进大黄鱼资源的保护和开发具有重要意义。本文通过建立大黄鱼小片段基因组文库，应用PCR技术快速筛选含(CA)n及(GA)n微卫星序列的克隆，共得到32个含微卫星序列的阳性克隆，选择核心序列重复次数较多的14个序列登录GenBank。应用所得微卫星序列的侧翼区设计引物，对大黄鱼样品进行扩增，得到8对（PC1C4，PC4H12，PC5E11，PC7A2，PC7H4，PC8F5，PC10F10，PC10G6 ...
林能锋
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, 2019 运用微卫星标记技术,选用8对微卫星引物对厦门市5个凡纳滨对虾亲虾群体(ZA1、HN、ZA2、ZP、DS)进行遗传多样性分析。结果显示,8对微卫星引物在5个凡纳滨对虾亲虾群体中共检测到75个等位基因,各群体的平均等位基因数(Na)为3. 875～7. 000、平均有效等位基因数(Ne)为2. 632～3. 719、平均PIC值范围在0. 498～0. 624。平均观测杂合度(Ho)为0. 410～0. 562、平均期望杂合度(He)为0. 589～0. 687。各群体的平均近交系数(Fis)为0. 147～
李天骄 +6 more
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Genetic diversity of amphioxus in China Seas and strain breeding in the laboratory [PDF]
, 2013 头索动物文昌鱼进化地位特殊，具有脊索动物门祖先的原始特征，是进行脊椎动物起源和演化、胚胎发育和比较基因组学研究的重要材料，具有重要的科研价值，同时文昌鱼还是一种有养殖前景的经济物种。目前对文昌鱼的研究主要集中在进化和发育生物学方面，对其分类学、遗传多样性和育种方面的研究则相对滞后。 将材料运用于科学研究之前，首先必须对其进行正确的物种鉴定。本文根据形态特征鉴定了采集于粤东海域的短刀侧殖文昌鱼，并测定了其线粒体基因组全序列，结合已报道的其它8种文昌鱼线粒体基因组数据，对文昌鱼属的分类进行了探讨 ...
李伟业
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Population genetic structure of Japanese anchovy (Engraulis japonicus) and Japanese Spanish mackerel (Scomberomorus niphonius) in China offshore [PDF]
, 2011 鳀和蓝点马鲛是中国近海生态系统的关键种和重要的渔业经济种。目前我们对两个物种在中国近海的种群组成、基因流限制等种群遗传学属性的了解仍然不够清晰。因此，我们采集了覆盖鳀和蓝点马鲛在中国近海主要产卵场的产卵群体样品，选用微卫星为分子标记，对这个两个物种的种群遗传结构进行了进一步的分析，以期对其能有更好的理解。 首先使用“微卫星富集文库”法，分别开发了鳀和蓝点马鲛的微卫星标记。结果共获得鳀微卫星标记41个，其等位基因数的分布范围为6-36，平均为20.10；表观杂合度的分布范围为0.180-0.949 ...
林琳
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