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野生动物学报, 2010 利用15个微卫星标记对麋鹿、黇鹿、梅花鹿、黄麂、马鹿5种鹿类动物群体DNA多态性进行测定,共检测到95个等位基因,平均等位基因数和群体有效等位基因数分别为6..3333±2.7946个和4.7089±1.8355个,平均期望杂合度为0.5790±0.1025,平均多态信息含量为0.4483±0.1050。群体间的平均遗传分化为29.4 ...
李文斌, 闻亮, 郑维平, 徐永山
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, 2007 利用55对微卫星引物对珠江和海南长臀基因组DNA进行了扩增,有23对能扩增出清晰条带,其中有11对在珠江长臀中表现多态性,9对在海南长臀中表现多态。这些多态性位点的等位基因数在2~4之间,平均等位基因数2.91个。结果显示:珠江长臀的平均观测杂合度(Ho)是0.45,平均期望杂合度(He)是0.46,平均多态信息含量(PIC)为0.377;海南长臀的平均观测杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别是0.58、0.53,平均多态信息含量(PIC)为0.426。两群体间的遗传相似度为0.875、
龙翠华 +4 more
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, 2012 报道了一种简便高效克隆微卫星序列的方法。这一方法的实施步骤包括小片段基因组文库构建、三螺旋捕获、磁珠分离和PCR扫描。草鱼AG重复文库的冗余率为7.2%,富集效率为60.25倍,PCR扫描的准确率达100%,采用这一方法克隆到的AG重复序列中完美型、非完美型和混合型的比例分别为66.87%、17.17%和15.96%,不间断重复序列长度大于30 bp的微卫星座位占51%。34个微卫星座位中有25个表现出多态性,PIC值0.50—0.91,进一步分析表明AG重复序列的多态信息含量(PIC ...
连灏 +7 more
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野生动物学报, 2018 为探索东北地区野猪种群的遗传资源特征,本研究通过收集长白山北部林区5个地点的140份粪便样本,结合世界粮农组织(FAO)推荐的9个微卫星标记,使用Microsatellite Toolkit、GENEALEx软件计算相关遗传参数,评估各野猪局域种群的遗传多样性。研究结果表明,9个微卫星标记检测到的等位基因数目为6～15个,且PIC值为0.625～0.888,均为高度多态性位点。种群平均表观杂合度为0.760～0.813,平均期望杂合度为0.687～0.766,平均有效等位基因数为3.368～5.144个,
葛宝庆 胡素贤 孙铁铎 张崇颖 姜广顺
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野生动物学报, 2022 为有效保护浙江长兴尹家边扬子鳄保护区扬子鳄(Alligator sinensis)种群,丰富野放扬子鳄的遗传多样性,利用13个微卫星标记分析了该种群的遗传多样性,比较核心区和野放区种群的遗传多样性差异。结果显示:保护区扬子鳄种群共检测到31个等位基因,其中含2个稀有等位基因。野放区种群的平均有效等位基因数量(1.82)、平均观测杂合度(0.49)、平均期望杂合度(0.43)、平均多态信息含量(0.34)和平均香农信息指数(0.64)均低于核心区(1.89、0.52、0.46、0.37和0.70 ...
方黎明 +8 more
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野生动物学报, 2017 对虎皮鹦鹉(Melopsittacus undulatus)全基因组中微卫星分布特征进行了分析,查找到l～6个碱基重复类型的微卫星序列共90 346个,约占整个基因组总长度的序列(1.1 Gb)的0.41%,分布频率为82.9/Mb。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为50 349个,占总数的55.7%; 其次是二、四、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的16.3%,13.7%,10.8%,2.9%,0.5%。单碱基微卫星中A重复类型数量最多,二碱基中AT最多,三碱基中AAT ...
黄 杰 原宝东 杨承忠
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野生动物学报, 2022 绿孔雀(Pavo muticus)是备受关注的濒危物种。我国南方曾广泛分布的云南亚种(P.m.imperator)目前收缩到中部、南部和西部的局部地区,近年来陆续开展了野外种群调查,但遗传多样性的分析和评估尚未开展。本研究利用从玉溪市新平和峨山交界处采集的野外绿孔雀自然脱落的羽毛,采用11对微卫星标记分析遗传多样性和结构,并与国内主要圈养种群(建群者来自瑞丽地区和其他未确定的地点)进行比较。结果表明:该野生种群的遗传多样性较低,受到近交的影响,遗传多样性进一步丢失的风险较高。遗传结构上 ...
刘思霞 +8 more
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野生动物学报, 2022 小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物(Rodentia),在森林种子传播和维持生态系统平衡等方面发挥着重要的生态学作用。过去不合理的森林采伐,已导致其生存受到一定威胁,为了给小飞鼠东北亚种(P.v.arsenjevi)群体遗传学研究与管理提供重要的分子标记,从鼯鼠科(Pteromyidae)的小飞鼠指名亚种(P.v.volans)、北美飞鼠(Glaucomys sabrinus)、海南小飞鼠(Hylopetes phayrei)、赤颊林飞鼠(H.sagitta)和松鼠科 ...
田新民 杨孟平 宋雅祺 刘小慧 廉明栋 陈 红
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野生动物学报, 2022 利用12个微卫星位点复合扩增构建马来穿山甲(Manis javanica)个体识别体系,评估其种群遗传多样性和遗传结构。结果显示:重构的个体识别体系累积无关个体基因型匹配概率(P(ID))和同胞个体基因型匹配概率(P(ID)sibs)分别为6.48×10-16和9.65×10-6,具有较高的鉴别力和灵敏度。在135只马来穿山甲个体上共检测出155个等位基因,多态信息含量(PIC)为0.733,平均等位基因数(Na)为12.91,平均观测杂合度(Ho)为0.631,平均期望杂合度(He)为0.756 ...
李嘉昊 +5 more
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, 2003 利用连续两代人工雌核发育操作 ,构建了极具观赏价值的红白锦鲤人工雌核发育系。应用 6对微卫星引物进行遗传标记研究 ,检测分析了该雌核发育系内个体间的遗传同质性及其基因座位的纯合度。实验结果显示 ,11尾经人工挑选具有相同表形、极具观赏价值的F1代性成熟个体的微卫星扩增图谱呈现出高度的一致性。同时 ,随机挑选的人工雌核发育F2代个体在所检测的基因座位均呈现纯合 ,扩增图谱呈现了高度的一致 ...
刘静霞,周莉,魏丽华,桂建芳
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