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三疣梭子蟹十足目虹彩病毒
Haiyang yu huzhao为建立十足目虹彩病毒1 (decapod iridescent virus 1, DIV1)的SYBR Green Ⅰ 荧光定量PCR检测方法，根据DIV1的 MCP和ATPase基因序列，设计并筛选出引物，以制备的DIV1阳性质粒标准品为模板构建标准曲线，建立DIV1的 SYBR Green I qPCR方法，并对该方法进行临床初步应用。结果显示，建立的qPCR方法阈值循环数(cycle threshold value, Ct)与标准品拷贝数的对数线性关系良好，标准曲线相关系数(R2)为0.999 ...
赵 丹阳 +4 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2023 目的探讨光学基因组图谱技术（OGM）在复杂染色体重排中的应用。方法收集2022年1月到2023年6月期间，在中山大学附属第六医院生殖医学中心进行辅助生殖助孕的染色体复杂重排患者5例，对患者进行OGM检测，纳米孔三代测序和胚胎植入前遗传学检测（PGT），并与核型分析、染色体微阵列分析技术（CMA）/基因组拷贝数变异测序（CNV-Seq）的结果分析对比。结果相互易位合并插入，相互易位合并倒位，三联易位均能被OGM成功检测，且与纳米孔测序和CMA/CNV-Seq结果相符。OGM成功定位断裂点位置 ...
何姝婧 +6 more
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建立RT-ARMS-qPCR系统定量测定含A1555G突变的线粒体DNA拷贝数
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2009 目的建立RT-ARMS-qPCR（real time-amplification refractory mutation system-quantitative PCR）系统定量测定含线粒体DNA（mitochondrial DNA,mtDNA）A1555G位点突变的片段的拷贝数,为阐明线粒体耳聋临床表型多样性的分子生物学基础奠定基础。方法根据ARMS的基本原理设计引物,在引物3’端插入错配碱基AC建立RT-ARMS-qPCR系统,优化定量PCR体系,并进行方法学评价 ...
程祖建 +4 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2022 目的本研究通过第二代高通量测序（NGS）检测配对骨肉瘤转移灶和原发灶标本，分析骨肉瘤原发灶与转移灶的基因图谱差异，以期发现促进骨肉瘤发生和转移的相关分子及可能机制。方法12例转移患者的原发灶与转移病灶肿瘤组织样本，使用第二代高通量测序（NGS）进行检测，其中9对panel检测（678个基因）以及3对全外显子检测（WES），分析比较骨肉瘤原发灶与转移灶的基因图谱差异：基因拷贝数变异通过EXCAVATOR检测；DNA层面的融合突变通过Lumpy检测；RNA层面的融合突变通过Defuse + STAR ...
许明贤 +4 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2019 【目的】研究圆锥动脉干异常胎儿的拷贝数变异（CNV）情况。【方法】运用染色体微阵列分析方法检测圆锥动脉干异常胎儿的CNV，根据CNV的临床意义，将病例分为非良性组（病理性CNV+临床意义未明CNV）和良性组（无CNV+良性CNV），并分析不同临床意义CNV与胎儿超声特征及预后的关系。【结果】研究期间128例染色体正常圆锥动脉干异常胎儿被纳入研究。其CNV检出率为14.1%（18/128），其中包括病理性CNV为5.5%（7/128）、临床意义未明CNV（VOUS）为4.7%（6/128 ...
林美芳 +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2019 目的探讨常规HPV检测采用RNA优势于DNA检测的临床意义。方法选取湖南省肿瘤医院检验科于2016年1月-2016年12月收治的因宫颈疾病行宫颈活检的200例患者资料。根据病理活检结果将其分为4组,测定各组患者宫颈口及宫颈管脱落的上皮细胞HPV E6/E7 mRNA与HPV DNA的含量并统计阳性例数,探究其用于诊断宫颈癌的的价值及意义。结果与对照组相比,低级别组,高级别组,浸润癌组HPV E6/E7 mRNA与HPV DNA的阳性例数与拷贝数明显升高,差异具有统计学意义 ...
马莉, 陈建国, 吴白平
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Haiyang yu huzhao为更好地保护和开发光唇鱼(Acrossocheilus fasciatus)资源，进行了光唇鱼卵原干细胞提取、冻存和移植研究。结果显示，光唇鱼卵原干细胞呈椭圆形，长径和短径分别为(16.52±0.87) µm、(10.66±0.87) µm。低温冻存光唇鱼卵巢时以10%的DMSO作为保护剂效果最好，从冻存卵巢中提取卵原干细胞的效率可达新鲜卵巢的42.22%±1.02%。以孵化出膜3日龄斑马鱼仔鱼为受体，将提取的光唇鱼卵原干细胞用PKH26荧光染料标记后移植入受体鱼腹腔。荧光显微镜观察显示，移植后1~5 ...
王 宏艳 +7 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2023 目的探讨10q24.3缺失导致全面性发育迟缓患儿的诊断方法。方法通过回顾性分析1例全面性发育迟缓患儿的临床资料以及患儿和患儿父母家系低深度全基因组拷贝数变异测序（CNVseq）和家系全外显子组测序（WES）的检测结果。结果患儿为10月龄男性，四大能区均有发育落后，并伴有特殊面容（眼距增宽、斜视、鼻梁低平、前额凸出、腭裂、高腭弓等），四肢肌张力低下等表现，CNVseq和WES基因检测发现患儿存在10q24.3新发杂合缺失，该区间包含基底细胞痣综合征基因SUFU和低镁血症 ...
段远辉, 曹洁, 欧跃徐, 李洁玲
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人TIM-1和TIM-3 mRNA实时SYBR Green Ⅰ定量RT-PCR检测方法的建立
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2012 目的建立实时SYBR Green I定量RT-PCR检测人TIM-1和TIM-3mRNA的方法。方法从人外周血单个核细胞提取的总RNA中逆转录扩增人TIM-1和TIM-3的cDNA,将将纯化的人TIM-1和TIM-3的扩增产物分别与pMD18-T Simple载体进行连接,转化宿主菌DH5α,提取重组质粒DNA,PCR鉴定并测序分析。纯化质粒并检测260nm吸光值,确定重组质粒原液的拷贝浓度并以此制备荧光定量PCR梯度浓度标准品,进行实时荧光定量PCR实验。结果建立了TIM-1和TIM ...
陈治中 +3 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2019 【目的】采用二代测序（NGS）检测黏膜黑色素瘤中的295个基因突变情况，分析黏膜黑色素瘤患者的基因突变谱及突变特点，探索潜在治疗靶点。【方法】组织标本来自2017年9月至2018年9月在中山大学肿瘤防治中心生物治疗科就诊的黏膜黑色素瘤患者，于我院分子诊断科行NGS检测295个基因变异。【结果】黑色素瘤主要驱动基因突变频率分别为BRAF20%（5/25），KIT20%（5/25），NRAS12%（3/25），NF18%（2/25）。最常见的基因突变为MYC拷贝数增加（36%，9/25 ...
黄复雪 +5 more
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