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甲型肝炎病毒和戊型肝炎病毒双重荧光定量PCR方法的建立及应用
目的建立甲型肝炎病毒(HAV)和戊型肝炎病毒(HEV)的双重荧光定量PCR检测方法并应用于临床样本的检测。方法根据参考文献分别选取HAV以及HEV基因组的保守区域设计合成特异性引物和探针,从而建立并优化双重荧光定量PCR反应体系,之后评价反应体系的特异性、敏感性和稳定性。结果本研究建立的HAV和HEV双重荧光定量PCR技术应用于检测HAV核酸时检测极限可以达到1个拷贝/反应,对同一样品重复测定5次获得的Ct值的变异系数(CV)最大为1.5%,同时该体系检测HEV的最低检测极限也达到10个拷贝/反应 ...
张磊, 鲁淑婷, 李玉龙, 黄洲风
doaj
为了对熊源性成分进行有效鉴定,本研究根据熊科动物线粒体DNA(mtDNA)序列,使用分子生物学软件Primer Express 3.0设计了一套特异性引物、探针,用以建立Taqman探针荧光PCR检测熊源性成分的方法。结果显示,所建立方法特异性强,15份熊属动物组织样品均出现特异性扩增曲线,20份阴性对照动物样品均未出现扩增曲线; 方法灵敏度高,最低可以检测到10个拷贝数量级的重组质粒DNA,对熊胆粉稀释106倍后,仍可扩增出熊DNA; 方法稳定性好,对相同的样品在不同时间进行2次重复检测 ...
邵建宏 罗宝正 薄清如 赵福振 帖丽莎 徐海聂 廖秀云 彭玉芬 陈 敬
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建立实时荧光定量PCR检测新型隐球菌CAP10基因及其初步应用
目的建立FQ-PCR(real-time Fluorescent Quantitative PCR)系统定量检测新型隐球菌CAP10基因,为将其应用于新型隐球菌感染的诊断和疗效判断奠定基础。方法根据新型隐球菌5种血清型(A、B、C、D、AD)中同源序列设计引物和探针,PCR扩增CAP10基因片段,并将其克隆到pGEM-T Easy载体上,构建质粒标准品;建立FQ-PCR体系,优化反应条件,建立标准曲线,进行特异性、敏感性、重复性实验。结果FQ-PCR系统用于检测CAP10基因片段,敏感性为1拷贝数/μl,
林旎 +7 more
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SYBR GreenⅠ实时RT-PCR定量检测前列腺癌患者外周血DD3mRNA
目的建立一种新的方法定量检测前列腺癌(PC)患者外周血DD3 mRNA方法扩增LNCaP细胞株阳性表达的DD3mRNA,并以其扩增产物为外标准,通过优选引物及优化PCR的各项参数,建立了SYBR Green实时RT-PCR定量检测PC患者外周血DD3 mRNA的方法,并以此方法检测了健康男性志愿者、良性前列腺炎(BPH)患者和PC患者外周血DD3 mRNA。结果所建立的SYBR Green实时RT-PCR方法最少可检测到10拷贝的核酸,在每反应108-103copies/ml范围内 ...
张黎明 +4 more
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目的 基于二代测序平台,本研究开发了一种新型染色体异常检测技术—CNV-plus,旨在探究该技术的检测性能及优势,为临床中拷贝数的高精度和全面检测提供新方法。方法 使用CNV-plus对共173例流产组织样本进行染色体拷贝数检测,并通过CNV-seq和STR两种方法的验证和补充,对比分析检测结果的可检出变异类型、检测一致性及检测精度。结果 CNV-plus技术与CNV-seq对CNV有100%的检测一致性,且检测精度更高,排除母源污染后,CNV-plus与STR对三倍体有100%的检测一致性。与CNV ...
庄燕燕 +8 more
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Examining the genetic diversity of Dendrobium officinale from different geographical origins is crucial for advancing the understanding of the origin and evolutionary divergence of this species, and provides a valuable theoretical basis for the ...
周宇(ZHOU Yu) +4 more
doaj +1 more source
通过向25年老龄苹果园土壤中施入不同浓度(T1,0.02‰;T2,0.1‰;T3,0.5‰)的棉隆,利用微生物平板培养、荧光定量PCR(qPCR)、微生物碳源利用(biolog-ECO)、末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)、生物多样性指数Biodap等方法研究不同浓度棉隆熏蒸下土壤可培养微生物(细菌、真菌)数量、群落结构及其多样性指数随时间变化的演变趋势,并进行平邑甜茶盆栽验证,以期为减轻苹果连作障碍筛选棉隆浓度提供理论依据。结果表明:0.1 ...
徐少卓 +6 more
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【目的】探讨染色体微阵列分析技术(CMA)在全基因组水平分析持续性左上腔静脉(PLSVC)胎儿遗传性病因的临床应用价值。【方法】2014年1月至2016年12月在中山大学附属第一医院行胎儿系统超声筛查提示持续性左上腔静脉且在我院产前诊断中心接受常规染色体核型分析和CMA检测的81例胎儿纳入研究,比较持续性左上腔静脉胎儿核型分析和CMA检测染色体异常的检出率差异。根据是否合并其他超声异常,分为单纯组及合并异常组,比较单纯组与合并异常组染色体异常检出率差异。【结果】核型分析的异常率为18.5%(15/81),
杜柳 +5 more
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在本团队前期研究中,通过宏病毒组学测序与生物信息学分析,从一例死亡华南虎(Panthera tigris amoyensis)组织病料中鉴定出一株新型虎源猫杯状病毒(Feline calicivirus isolated from tiger,TCaV),命名为LYH1224株。为实现对该病毒的快速检测,基于TCaV LYH1224株基因组序列设计特异性引物,经反应体系与条件优化,构建了TCaV绝对荧光定量PCR检测方法,并开展了敏感性、特异性和重复性评估。同时,利用该方法对本实验室保存的大型猫科 ...
梅隐 +9 more
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目的为了提升胎儿股骨短小(FL)的遗传学病因诊断水平,探讨全外显子组测序(WES)与染色体异常检测联合应用在产前诊断中的价值。方法选取2023年11月至2025年5月于中山大学孙逸仙纪念医院深汕中心医院产前诊断与医学遗传中心就诊的27例孕中晚期股骨短小胎儿[FL<同孕周第5百分位数或<-2标准差(SD)]为研究对象,采集羊水或脐血样本并行染色体核型分析(19例)、染色体微阵列分析(CMA)或低深度全基因组测序(CNV-seq)(27例),并开展家系三重全外显子组测序(Trio-WES)(27例 ...
陈曼绮 +7 more
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