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基于高通量测序技术对贵州山地野猪冬季盲肠细菌多样性分析

open access: yes野生动物学报, 2022
为掌握贵州山地野猪(Sus scrofa)盲肠细菌菌群的结构功能、多样性以及菌群的地区和性别差异,揭示细菌的特异性及其与宿主的相互作用,采用16S rRNA高通量测序技术对12头贵州野猪盲肠细菌菌群进行分析,共获得有效序列59 246条,经优化后以97%相似度聚类得到1 256个OTU。结果表明:(1)不同地区和性别组间菌群多样性总体上差异均不显著,而在具体菌群组成上存在一定的差异菌属。(2)共聚类得到细菌18门278属,优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes ...
彭彩淳   +7 more
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内蒙古赤峰地区东北马鹿(Cervus elaphus xanthopygus)冬季肠道微生物多样性研究

open access: yes野生动物学报, 2020
基于16S rRNA基因测序技术对24份东北马鹿冬季粪便中细菌的结构和多样性进行分析,试图揭示东北马鹿冬季肠道微生态,为该物种保护提供新的见解。结果表明东北马鹿粪便样品中菌群分属于21门33纲74目131科306属,在门水平上,马鹿肠道菌群主要由厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidete)构成,相对丰度分别为79.43%和6.64%;在属水平上,马鹿肠道菌群主要由Ruminococcaceae_UCG-005和Christenseenellaceae_R-7_group构成 ...
郭金昊   +3 more
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宏基因组联合UPLC-Q-TOF-MS/MS探讨地塞米松对大鼠肺炎的作用机制

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2023
目的基于多组学技术,探讨地塞米松(Dex)能否通过调节肠道菌群及代谢物治疗肺炎。方法将18只Sprague-Dawley大鼠随机均分为对照(Control)组、模型(Model)组和地塞米松(Dex)组,每组6只,除Control组外,余下两组持续使用4 mg/kg的脂多糖(LPS)腹腔注射7 d建立大鼠肺炎模型。然后Dex组给予2 mg/kg的Dex灌胃治疗12 d,余下两组均连续灌胃等量的无菌PBS缓冲液12 d。第19 d时收集大鼠的肺组织、血浆、粪便和肠道内容物。苏木精-伊红(H&E ...
李四菊   +5 more
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虎纹蛙肠道微生物结构与功能分析

open access: yes野生动物学报, 2020
利用高通量测序方法对虎纹蛙前肠、中肠和后肠微生物结构和功能进行分析。结果表明,虎纹蛙(Rana rugulosa)肠道核心菌群是厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、梭杆菌门(Fusobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)。Romboutsia属、鲸杆菌属(Cetobacterium)、叶杆菌属(Phyllobacterium)是绝对优势菌属。肠道中存在弧菌(Vibro)、邻单胞菌(Plesiomonas)
刘文舒   +5 more
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中华穿山甲腹泻治疗前后粪便微生物群落组成的差异

open access: yes野生动物学报, 2022
腹泻是导致野生穿山甲在圈养条件下死亡的主要原因之一,为深入掌握引起腹泻的原因和致病机理,对救护收容过程中出现腹泻的2只中华穿山甲(Manis pentadactyla)进行了非抗生素治疗,并利用高通量测序技术比较了治疗前后粪便细菌和真菌群落的多样性和组成变化。结果表明:通过在饲料内添加收敛剂类药物(蒙脱石)和枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)可有效改善腹泻症状,粪便由黄色糊状转为黑色条状。治疗后粪便细菌OTU总数和丰度指数(ACE和Chao 1)均降低,而真菌OTU总数和Chao ...
颉志刚 毛 韵 谢纯刚 许 佳 何海健 蒙海峰 郑荣泉
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不同营养组成食物对花鼠肠道菌群的影响

open access: yes野生动物学报
为探究食物主要营养成分对花鼠(Tamias sibiricus)肠道菌群结构的影响,以人工饲料饲喂花鼠,以野外自由取食为对照,通过粪便采样,以16S rRNA高通量测序分析花鼠肠道菌群组成。依据食物来源和饲料中脂肪、淀粉含量的不同,将被饲喂的花鼠分为野外组、脂肪组、淀粉组和饲料组。结果显示:不同饲喂条件下,花鼠肠道菌群的优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria ...
朱紫薇   +5 more
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高山兀鹫肠道微生物的分离鉴定与耐药性分析

open access: yes野生动物学报, 2021
在青海高原,国家二级保护鸟种,高山兀鹫(Gyps himalayensis)以动物和人类的尸体为食,对维持生态系统平衡至关重要。然而,腐尸中存在诸多有害因素(如兽药残留,病原菌或病毒感染等),对高山兀鹫种群的生存和保护构成威胁。肠道微生物调控宿主的免疫、营养物质代谢及发育等诸多生理过程,因此,也成为野生动物保护领域的研究热点。为了解高山兀鹫肠道微生物的多样性及其耐药情况,本研究采集野生高山兀鹫的新鲜粪便在实验室进行细菌分离培养、16S rRNA基因PCR扩增和序列分析、生化鉴定以及细菌耐药性试验 ...
候建平 郑思思 龙鑫 海佳怡 王稳 朱丽琳
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萎缩性阴道炎阴道菌群的研究

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 1999
目的: 研究萎缩性阴道炎患者的阴道菌群分布情况。方法: 收集萎缩性阴道炎病人 50 例、绝经前健康妇女 30 例 和绝经后阴道萎缩妇女 20例, 进行阴道需氧菌和厌氧菌培养。结果: 50 例萎缩性阴道炎组共分离出需氧菌 65 株,分离率由高 到低前 4位依次是大肠埃希氏菌( 13/50,26%)、表皮葡萄球菌( 9/50, 18%)、粪链球菌( 7/50, 14%)和绿色链球菌( 6/50, 12%) , 分离出厌氧菌 56株, 分离率由高到低前 4 位依次是拟杆菌( 21/50,42%) 、消化链球菌(
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肠道菌群调控抑郁症炎症反应和氧化应激的机制及应用前景

open access: yesChinese Science Bulletin, 2023
Yuanyuan Li, Tianlu Mo, Yongjie Yao
semanticscholar   +1 more source

圈养与野外近人环境猕猴肠道菌群的比较分析

open access: yes野生动物学报
通过对来自北京动物园10只圈养猕猴(Macaca mulatta)和来自河南济源五龙口风景区10只处于野外近人环境中的猕猴的粪便微生物进行鸟枪法测序,分析两种不同环境下猕猴的肠道菌群组成和差异。结果表明:20份样品共检测出9个门、18个纲、22个目、31个科、46个属和226个种。通过分析发现,圈养和野外近人环境群体共享了绝大部分细菌(200种),但是近人环境群体相比于圈养群体,独有更多种类的微生物。圈养猕猴肠道微生物主要由厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes ...
赵欣然, 王晓晨
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