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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2003 组织芯片技术为进行多种肿瘤的多指标 （DNA、mRNA、蛋白指标 ）高通量原位分析提供了时间、空间和资源的可行性并最大程度上保证实验条件的一致 ,可广泛应用于肿瘤候选基因及其临床特性的确定、肿瘤预后的判断、肿瘤免疫治疗效果的评价以及肿瘤的分子诊断、肿瘤治疗靶点的筛选 ,显著加速基因组学和蛋白组学成果在肿瘤临床中的应用。
杨军 +4 more
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SELDI在筛选从慢性活动性肝炎到早期肝硬化两阶段血清标记物中的应用
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2010 目的比较慢性活动性肝炎患者和早期肝硬化患者血清蛋白标记物并建立相关筛选模型。方法用表面加强激光解析/电离飞行时间质谱技术（SELDI-TOF-MS）及CM10蛋白芯片对28例慢性活动性肝炎患者、26例早期肝硬化患者血清样本进行分析,将获得的血清蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析,建立慢性活动性肝炎与早期肝硬化患者的比较筛选模型。结果慢性活动性肝炎组与早期肝硬化组共有26个差异有统计学意义的蛋白峰;建立诊断模型的灵敏度92%（24/26）,特异度86%（24/28）,准确率为89%（48/54 ...
邓敬桓 +6 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2013 目的探讨基质金属蛋白酶9（Martix Metalloproteinase 9,MMP-9）和PTEN在胶质瘤中的表达状况,并探讨它们之间的相关性及临床意义。方法应用组织芯片技术和免疫组织化学EnVision法检测67例胶质瘤、8例正常脑组织中MMP-9、PETN的表达。结果 MMP-9蛋白在胶质瘤组织和正常脑组织中的表达差异没有统计学意义（P>0.05）,随着胶质瘤恶性程度的增加,MMP-9蛋白表达增加 ...
李秋阳 +6 more
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卵巢癌患者术前、术后、复发及化疗过程中血清蛋白质差异表达研究
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2012 目的探讨卵巢癌患者术前、术后复发及化疗过程中血清蛋白质的变化。方法采用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）联合CM10蛋白质芯片技术,对就诊于我院并进行手术治疗及术后化疗的9例卵巢癌患者进行跟踪随访收集到的37份血清标本进行检测。结果共获得显著差异表达的蛋白峰7个。1.在卵巢癌术前、术后自身对照研究中,卵巢癌术前组蛋白峰平均强度/卵巢癌术后组蛋白峰平均强度≥2的蛋白峰有1个（1452.58Da）,说明该蛋白峰在卵巢癌术前组中高表达。卵巢癌术前组蛋白峰平均强度 ...
赵晋, 汤泓, 李红霞
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2019 【目的】利用生物信息学的方法，对GEO和TCGA两个基因组学数据库进行分析，探究与前列腺癌相关的差异基因及相关的调控网络。【方法】综合GEO数据库的前列腺癌基因表达芯片数据（GSE46602、GSE55945）和TCGA数据库的RNA-seq数据，利用GEO2R及R语言的edgeR包进行基因差异分析，获得共同的显著差异基因，结合R语言的clusterProfiler包进行GO功能分析及KEGG通路分析，同时利用string网站进行蛋白互作网络分析，筛选出前列腺癌中调节蛋白表达量的关键基因 ...
李志标
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2006 目的筛选与精子发生相关的基因。方法将不同发育阶段的小鼠睾丸组织cDNA探针与Affymetrix全基因组芯片进行杂交,通过杂交信号的比较,筛选出差异表达的基因。利用网络信息资源对该基因进行生物学信息分析。RT-PCR分析该基因在小鼠不同发育阶段睾丸及小鼠不同组织中的表达。结果通过4、91、8、35、54、日龄和6月龄小鼠睾丸的芯片信号比较筛选出一个差异表达杂交点（GenBank登录号:NM-026234）,生物信息学分析发现该基因全长3 979 bp,含有1 272 bp的完整ORF ...
唐爱发 +7 more
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谷胱甘肽还原酶影响结肠癌代谢及预后：一项基于蛋白组学与微阵列芯片分析的研究
Zhongguo shiyan zhenduanxue目的 探讨谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase, GSR)对结肠恶性肿瘤代谢的影响及其对结肠癌患者的预后价值。方法 通过蛋白组学差异分析获得结肠癌组织和正常结肠上皮组织的差异蛋白，并通过富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)分析鉴定代谢通路中的关键蛋白，进行生存分析和临床信息相关性分析。收集120例结肠癌患者手术病理标本制作组织微阵列芯片，进行免疫组织化学染色。结果 蛋白组学差异分析共鉴定出1 209个差异表达蛋白。KEGG富集分析显示，差异蛋白显著富集于代谢通路 ...
吴惧 +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2017 随着高通量测序、基因芯片等技术的兴起以及生物信息学的应用,大量的基因组转录本被揭示,从此众多的研究成果不断涌现,为揭示基因中的奥秘提供了新思路。研究发现[1],人类93%的基因组DNA可转录成RNA,编码蛋白的基因仅仅为人类基因组的2%[2],而其余98%则为不具有或具有极低蛋白质编码功能的非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）。成百上千个非编码RNAs被转录,并且被认为是具有不同大小、结构和生物功能的功能性RNA ...
孙延文, 印璞, 于庭
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2023 目的 基于微阵列数据分析筛选中国人冠心病(CHD)的关键基因和信号通路，以期为临床探究潜在的发病机制与治疗靶点。方法 以CHD为检索关键词从基因表达图谱(GEO)数据库下载GSE71226微阵列芯片数据进行进一步分析，利用R Studio软件中“limma”包筛选冠心病患者与正常健康人群的差异基因并对其进行可视化处理，利用R Studio软件中“clusterProfiler”包和“org.Hs.eg.db”包对差异基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析 ...
王星 +5 more
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siRNAs干扰EBNA1下调EBV阳性鼻咽癌细胞内ALOX12的表达
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2010 【目的】 利用RNA干扰技术抑制C666-1细胞中EB病毒核抗原1(EBNA1)的表达,探索氧化应激与抗氧化相关基因的表达变化65377; 【方法】 采用蛋白质印迹证实了能有效抑制EBNA1表达的干扰序列,使用甲基噻唑基四唑(MTT)方法检测C666-1细胞的存活率,利用实时定量PCR芯片技术探索了氧化应激与抗氧化相关基因的转录谱变化,并通过反转录聚合酶链反应(RT-PCR)和蛋白质印迹进行了验证65377;【结果】 EBNA1-1414和EBNA1-1437干扰序列转染C666-1细胞48 h后 ...
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