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Identification of hub genes and transcription factors involved in periodontitis on the basis of multiple microarray analysis. [PDF]
Hua Xi Kou Qiang Yi Xue Za Zhi, 2021 Zeng XL +6 more
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四川大学学报. 自然科学版, 2012 基于Luminex100TM技术平台,结合多重PCR技术,以5'生物素标记引物为信号指示,在H937)RV结核标准株做对照下,对104株结核分枝杆菌分离株的LFP耐药rpoB基因和INH耐药的katG,inhA基因进行检测,并与药敏试验绝对浓度法和测序结果比较.结果表明:液相芯片检出结果与药敏法比较,104株分离株中LFP、INH、多重耐药的检出结果分别为:液态芯片检测73株、50株、48株;药敏检测结果为74株、58株、53株;对比检出率98.6%,86.2%,90.6%.液相基因芯片技术对耐药 ...
王清 +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2017 目的从基因和分子水平探讨头颈部鳞状细胞癌（head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC）的发生机制。方法从GEO数据库下载人HNSCC相关基因芯片数据,使用BRB-Array Tools软件筛选差异表达基因,采用DAVID、ToppGene、STRING、Cytoscape工具进行生物信息学分析。结果 BRB分析共筛选出263条差异表达基因,其中上调基因134个,下调基因共129个,对其进行生物信息学分析发现COL1A1、MMP9、COL1A2、COL3A1 ...
向琳 +4 more
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血管紧张素转换酶、内皮型一氧化氮合酶和载脂蛋白E基因多态性与冠心病的相关性
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2006 [目的]研究血管紧张素转换酶（ACE）基因插入/缺失多态性、内皮型一氧化氮合酶（eNOS）基因G894T多态性和载脂蛋白E（ApoE）基因多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病（冠心病）的关系.[方法]应用基因芯片技术分析133例冠心病患者和122例对照者ACE、eNOS和ApoE基因多态性,对比两组基因型及等位基因频率.[结果]冠心病组ACE DD基因型频率比对照组显著升高,28.6% vs 13.1%,P＜0.01,ACE基因多态性与冠心病危险性相关.两组eNOS和ApoE基因型频率差异无统计学意义（P ...
梁茜 +4 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2012 【目的】 利用microRNA芯片技术分析比较两组不同复发倾向肝癌患者的miRNA表达谱,并在更大样品的基础上进行实验验证?【方法】收集10例原发性肝癌组织标本根据术后复发情况分2组:早期复发组与非早期复发组,运用microRNA芯片技术筛选出差异表达显著的microRNAs?结合文献报道,选择mir-144?mir-502-3p作为其他82例肝癌组织标本qReal-time PCR验证的检测指标?并利用生物信息学方法预测其靶基因?【结果】本研究共筛选获得7个差异表达的microRNAs ...
区应亮, 侯宝华, 简志祥
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2000 ９０年代初，由美国Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ公司的Ｆｏｄｏｒ博士提出并开始基因芯片技术的研究。至今，ＤＮＡ芯片技术在医学各个 领域中已显示出巨大的发展潜力并取得一定成功，他以一次性检查上万个基因活动的优势相继在人类肿瘤疾病的研究、艾 滋病的研究、细菌感染患者的研究、遗传病的研究等临床医学各个领域中取得了巨大突破，并且成形的己用于临床诊断的 ＤＮＡ芯片已在１９９７年后相继问世并投入商业化生产。此技术对患者的发病机制，临床诊断，患者的预后及监控患者在用药 方面的临床反应，制定患者的治疗方案中发挥了极大的作用 ...
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应用基因芯片技术研究硫酸氨基葡萄糖对骨性关节炎相关炎性基因表达谱的影响
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2019 目的利用基因表达谱芯片技术对硫酸氨基葡萄糖作用于骨性关节炎关节软骨胶原酶和磷脂酶A2基因表达谱的改变进行研究,为硫酸氨基葡萄糖的作用机制提供基因学证据,并验证基因芯片技术检测胶原酶和磷脂酶A2基因表达差异的可靠性。方法收集9例软骨样本,其中正常膝关节软骨样本3例,6例来源于髋关节骨性关节炎关节置换软骨样本,体外分离培养组织样本。将每株细胞分为正常对照组、炎症对照组(炎症介质刺激)、药物干预组(硫酸氨基葡萄糖+炎症介质)。行基因芯片杂交,并进行芯片扫描和数据分析,分别对比正常对照组与炎症对照组 ...
桑平, 李高峰, 李雪鹏, 张季铠
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2021 目的筛选缺血性脑卒中的关键基因及重要信号通路，预测可能对脑卒中有用的药物。方法从GEO数据库下载GSE98319基因芯片数据，该数据包含了假手术组、大脑中动脉梗塞组（MCAO）小鼠的基因芯片检测结果。用R语言的Limma包对数据进行差异表达分析，P<0.05且|log2FC|>0.6的基因为差异表达基因。借助STRING网站构建差异表达基因的蛋白质相互作用网络（PPIN）后由Cytoscape软件进行核心子网络筛选及可视化输出。筛选出核心基因后用实时荧光定量PCR（qRT- PCR ...
于瑜, 王钟兴
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[Analysis of Gene Variation in Thymoma by Microarray]. [PDF]
Zhongguo Fei Ai Za Zhi, 2020 Wang L, Yu L, Du X, Huo C.
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2020 【目的】为了研究合并心力衰竭的扩张型心肌病发生发展相关的差异基因与调控信号通路，利用生物信息学方法探讨了基因表达汇编（GEO）中的基因芯片和人类基因和遗传疾病的在线目录（OMIM）中扩张型心肌病相关基因。【方法】本研究选择了由德国波鸿大学Herz-&DiabeteszentrumNRW实验室利用临床病例心肌活检标本在GPL570平台进行测序并上传至GEO公共数据库的两张芯片基因集：GSE29819和GSE21610。将合并心力衰竭的扩张型心肌病和正常心脏功能的心肌活检标本分别作为实验组 ...
李果 +6 more
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