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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2006 [目的]利用低密度基因芯片方法对人乳头瘤病毒（HPV）进行分型检测,建立一种经济实用的临床HPV感染的基因型检测方法.[方法]利用低密度基因芯片方法对145例阴道镜门诊病人的宫颈拭子标本进行HPV-DNA检测并分型.[结果]被检人群中共检测出57例HPV阳性,88例HPV阴性,HPV的感染率为39.3%,阳性标本中检测出12种高危型别,2种低危型别.其中单型感染51例（89%）,混合感染6例（11%）,16,31,18,58型检出率较高.[结论]低密度基因芯片是一种快速、简便、特异性强 ...
王敏 +4 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2014 摘 要:【目的】 应用微矩阵基因芯片技术筛选结直肠癌甲基化基因?【方法】 分别提取6对结直肠癌组织和癌旁正常组织DNA,超声破碎及甲基化DNA富集后与甲基化芯片(NimbleGen human DNA Methylation 3 × 720K CpG)进行杂交,杂交信号经扫描等处理后采用生物信息学对检测结果进行分析?并对筛选出来的基因进行验证?【结果】 一共发现有2 296个高甲基化基因,其中有293个基因无文献报道?生物信息学分析显示,所有的甲基化基因随机分布在24对染色体上?聚类分析结果显示 ...
doaj +1 more source
Advancements of biochips and their applications(生物芯片及其研究进展)
Zhejiang Daxue xuebao. Lixue ban, 2001 生物芯片主要有两种类型，分别以分子微阵列和结构微阵列为基础，前者通过原位化学合成和芯片外合成机械点样法构建高密度的探针微阵列，主要用于DNA序列测定、分析基因组突变和多态性位点以及测定基因表达水平和比较同源基因在不同条件下的表达差异等；后者通过电子工业中标准的蚀刻工艺，在片基上构建各种显微结构微阵列，用于样品的分离及分子扩增等.本文阐述了生物芯片在概念、加工制备及应用领域等方面的研究进展.
XUBing-sen(徐炳森) +2 more
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肝炎基因诊断芯片同时检测慢性乙型肝炎患者血清及肝组织HBVDNA的临床研究
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2003 目的 用肝炎基因诊断芯片同时检测乙型肝炎患者血清及肝组织中HBVDNA ,并与雅培试剂、免疫组织化学和原位分子杂交法比较。方法 用点样仪将PCR扩增的HBCDNA探针点到特殊处理过的玻片上制成基因芯片 ,对 15例慢性乙型肝炎患者的血清及肝活检组织 ,分别用基因芯片、原位分子杂交法、免疫组织化学法、雅培试剂检测HBVDNA、HBcAg、HBsAg、HBeAg .结果 15例HBsAg、HBeAg阳性的乙型肝炎血清 ,基因芯片检测均阳性。 15例肝组织标本 ,免疫组化法阳性 15例 ,原位分子杂交阳性 ...
赵伟 +5 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2013 目的探讨PCR-膜芯片技术直接应用于痰标本中结核杆菌耐药基因突变检测的可行性。方法采集82例痰标本（结核患者64例,非结核患者18例）,TB膜芯片检测标本中的结核杆菌IS6110基因,阳性者利用12对特异性引物进行多重PCR,扩增产物与含有59个探针的耐药-TB膜芯片反向点杂交检测结核杆菌耐药基因突变,测序验证并与药敏试验比对。结果 TB膜芯片检测痰标本中的结核杆菌IS6110基因,特异度为100%（18/18）,灵敏度为81.3%（52/64）,阳性预测值为100%（52/52）,阴性预测值为60 ...
谭景尹 +8 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2014 目的评价基因芯片技术在结核病防治工作中对结核分枝杆菌异烟肼和利福平耐药性的检测效果。方法利用基因芯片技术对38例涂阳肺结核患者的痰标本进行异烟肼和利福平耐药检测,以传统罗氏药敏试验为金标准,对基因芯片技术的检测效果进行评价。结果在38例菌株中,用基因芯片法进行异烟肼耐药基因检测,与罗氏药敏的符合率为84.2%,对38例进行利福平耐药基因检测,符合率为89.5%。结论基因芯片检测异烟肼和利福平的耐药性与罗氏药敏方法具有很好的一致性,具有简便快速,灵敏度高,特异性好的优点 ...
孙炳奇 +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2010 目的利用基因芯片筛选与精子发生相关的基因,并研究其表达特征。方法将4 d、9 d、18 d、35 d、54 d和6月龄小鼠睾丸组织cDNA与Affymetrix全基因组芯片进行杂交,筛选出差异表达的基因。通过RT-PCR分析差异表达基因在小鼠睾丸不同发育阶段中的表达。结果分析Affymetrix全基因组芯片杂交结果后,筛选得到1个差异表达杂交点,通过在NCBI网站与小鼠全基因组序列Blast分析可知该差异表达基因是Rfx2基因。该基因在4 d、9 d、18 d、35d、54 ...
王朝亮 +7 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2011 目的建立一种运用多重PCR方法结合基因芯片技术快速、准确检测11种常见致病菌的方法。方法筛选志贺氏菌、肠炎沙门氏菌、伤寒沙门氏菌、大肠杆菌O157、副溶血性弧菌、普通变形杆菌、蜡样芽孢杆菌、金黄色葡萄球菌、单核细胞增生李斯特菌、产气荚膜梭菌、空肠弯曲菌的特异基因作为目的基因。设计相应的引物及探针,进行多重PCR扩增,制备寡核苷酸芯片。将多重PCR扩增产物与带有11种特异探针的基因芯片杂交。用扫描仪扫描,判定细菌种类。结果该基因芯片可特异性地检测11种致病菌,具有良好的特异性,基因组DNA检测灵敏度可达2×
贺晨 +5 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2022 目的 探讨膀胱癌发病的关键基因以及发病机制通路。方法 通过GEO数据库搜索膀胱癌基因芯片测序结果，计算机R语言（limma数据包）对测序原始数据进行均一化处理，GEO2R检测差异基因，通过芯片融合分析锁定共同发病基因。使用最新版本生物信息学分析对膀胱癌测序结果进行数据挖掘，包括DAVID基因转换、基因本体分析、KEGG信号通路分析，STRING蛋白互作分析，Cytoscape可视化处理，cytohubba筛选膀胱癌关键基因。结果GSE61615包含2例膀胱癌组织和2例癌旁正常组织 ...
邢晨 +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2014 目的根据细菌16SrRNA基因特点设计常见病原菌的特异性探针,采用酶显色技术构建基因芯片,探讨其临床应用的可能性。方法选取肺炎链球菌、流感嗜血杆菌及铜绿假单胞菌等8种细菌性肺炎常见的病原菌的标准菌株作为研究对象,并选择12份患者的痰液标本进行检测。在16SrRNA基因保守区设计PCR反应的通用引物及革兰阳性菌、革兰阴性菌的通用探针,利用可变区的差异设计合成特异性探针,构建基因芯片。利用细菌16S rRNA基因设计的PCR通用引物进行扩增,所有8种细菌均获得350bp的扩增产物。以地高辛标记特异性探针 ...
董进浪 +5 more
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