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Study on Ensemble Algorithm for Multi-class Gene Microarray Datasets [PDF]
集成学习是当前机器学习领域的一个研究热点,具体到多分类问题,旨在通过一组差异的分类器共同解决起初的多分类问题,然后经过大多数投票等策略将各个分类器的输出结果进行融合。集成多分类算法相比于单个的优秀分类器往往性能上更准确、更稳定,同时还具有更强的泛化能力。在解决多分类问题时,基于纠错输出编码算法(ECOC)。这是解决多分类问题的一种灵活、高效的算法框架,关键要点是将多分类转变为多个二分类问题。此外,遗传规划算法可用于解决二分类问题,通过进化计算得到准确的分类规则。本文在已有的研究基础上 ...
曾志浩
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Genetic Fingerprint Concerned with Lymphatic Metastasis of Human Lung Squamous Cancer [PDF]
Background and objective With the most recent introduction of microarray technology to biology, it becomes possible to perform comprehensive analysis of gene expression in cancer cell. In this study the laser microdissection technique and cDNA microarray
Li CHEN +7 more
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The research of the detection of thalassaemia multiple mutations by next-generation sequencing technology [PDF]
地中海贫血又称珠蛋白生成障碍性贫血,早期的病例来自地中海地区,故称为地中海贫血,是世界范围内影响最大的单基因病之一,遵循孟德尔遗传定律。该病是由珠蛋白基因的缺失或点突变所致,根据其变异的肽链可分为α地贫和β地贫。由于其基因缺陷的复杂、多样,使缺乏的珠蛋白链类型、数量、临床症状变异较大。临床上对中、重度地中海贫血无行之有效的治疗方法,给社会、家庭、个人带来了沉重的经济及精神负担。故有效检出地中海贫血患者、进行婚前孕前指导、产前诊断、避免地中海贫血患儿的出生,有着极其重要的社会意义 ...
成明
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目的评价结核杆菌蛋白芯片对肺结核的诊断价值及其影响因素。方法对痰涂片阳性肺结核病患者结核杆菌蛋白芯片和胸部CT扫描结果进行对比,分析肺结核病变范围和类型等因素对结核杆菌蛋白芯片检测的影响。结果结核杆菌蛋白芯片阳性率72.0%,CT诊断阳性率为90.0%,两种方法同时检测阳性率达到96.0%;多个肺野肺结核的结核杆菌蛋白芯片阳性率高于单个肺野 ...
曹军皓, 黄前川, 赵冰红
doaj
The bioinformatics research of gene’s pausing and APA [PDF]
近年来,生化技术的不断优化以及二代测序的使用使得我们对基因的转录调控有了新的认识,尤其是在真核生物中聚合酶II的转录行为有了更为深入的了解。就目前的报道,我们知道聚合酶II在基因近端启动子的停留确定是转录过程中的限速步奏,同时也是对外界刺激的快速应答的调控方式,对细胞的增殖,发育等许多方面有着重要的作用,而就其调控基因的具体数量以及基因状态从未研究过。 高通量技术的应用过程中,我们发现在基因的3’UTR区域的可变聚腺苷酸化(APA)也是转录过程中重要的调控节点 ...
余斌
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目的研究AQP4在脑积水鼠中的遗传规律,探讨其在脑积水中的作用。方法随机选择未脑积水AQP4敲除雄鼠与AQP4敲除雌鼠交配,用其F1、F2、F3代建立遗传图谱,研究其遗传规律。提取大脑组织总RNA,制作基因芯片研究其在遗传中的作用。结果 AQP4基因敲除表型的是可遗传的且与性别无关,同时并非单基因遗传,且为常染色体遗传;小鼠全基因芯片表明在AQP4敲除的背景下脑积水表型的发生有其它遗传基因的参与。结论通过制作遗传图谱以及小鼠基因芯片,证明AQP4在先天性脑积水发病机制中有重要的作用。
乔小放 +6 more
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Development of a novel fast immunoassay for HBV genotyping and study on the clinical significance of the quantitative hepatitis B core antibody level [PDF]
乙型肝炎病毒(HepatitisBvirus,HBV)感染是一个严重的,世界范围内的公共卫生问题,可以导致肝炎,肝硬化(LC)和肝细胞癌(HCC),每年可以引起100万以上的人死亡。在HBV感染的临床诊断中,不同的HBV相关标志物指示了病毒产生,病毒多态性以及宿主免疫反应三个方面,从而全面了解HBV感染者的疾病状态,预测自然转归和治疗应答,监测疾病进展和治疗效果,对HBV感染者的管理和治疗起到关键的指导作用。目前在指示病毒产生的标志物方面,HBsAg,HBVDNA和HBeAg的检测手段相对成熟 ...
宋浏伟
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【目的】应用miRNAs芯片筛选原代培养的鼻咽癌细胞差异表达miRNAs,并寻找差异表达miRNAs调控的靶基因,为进一步研究其在鼻咽癌发病机制中的作用打下基础。【方法】运用miRNAs芯片技术筛选原代培养的鼻咽癌细胞差异表达miRNAs,同时运用miRNAs特异的引物组对差异表达的miRNAs进行荧光定量RTPCR验证。运用靶基因预测软件并结合全基因组表达谱芯片结果预测差异表达miRNAs可能调控的靶基因,并利用westernblot技术检测预测的靶基因在原代培养的鼻咽癌细胞中的表达。【结果 ...
李晓霞 +4 more
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BAG Family Gene and Its Relationship with Lung Adenocarcinoma Susceptibility [PDF]
Background and objective BAG genes (Bcl-2-associated athanogene) belong to a recently discovered multifunctional anti-apoptosis gene family that regulate various physiological processes which include apoptosis, tumorigenesis, neural differentiation ...
Heng WU +9 more
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Molecular mechanism of the role of ROS signaling pathway in the antioxidant properties of TKE2 cells [PDF]
目的:目前ROS在干细胞生物学中的作用还没有得到充分说明和了解。在过氧化氢(H2O2)诱导的氧化应激条件下,我们比较小鼠角膜上皮祖细胞(TKE2)[1]和成熟的小鼠角膜上皮细胞(MCE)的不同反应,重点研究是角膜干细胞的抗氧化细胞特性及相关机制。 方法:以小鼠角膜上皮祖细胞(TKE2)和成熟的小鼠角膜上皮细胞(MCE)为细胞模型,通过CCK8细胞活性实验检测不同浓度H2O2对小鼠角膜上皮的祖细胞(TKE2)和成熟的小鼠角膜上皮细胞(MCE)的影响。利用H2O2处理细胞24小时后 ...
葛连平
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