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四川大学学报. 自然科学版, 2011 选取三例经分型明确为HPV16感染的宫颈癌病例,取癌组织(T)、癌旁组织(N)及远瘤正常宫颈组织(F)标本,用Roche NimbleGen芯片系统筛选出差异表达的基因并进行分析.三例标本中,癌组织与远瘤正常宫颈组织相比,差异表达基因共有673个,其中261个上调,412个下调;差异表达基因主要有原癌基因、抑癌基因、细胞信号转导、代谢、免疫应答、细胞受体、蛋白翻译合成有关基因等.
王有良, 丁显平
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2014 摘 要: 【目的】 筛选与儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)预后相关的microRNA(miRNA),旨在寻找与ALL预后相关的分子标记物,为临床ALL患儿分层治疗提供实验室依据? 【方法】 采用基因芯片技术检测10例初发-缓解配对的ALL患儿骨髓细胞的miRNA表达谱(基因芯片组),定量RT-PCR(qRT-PCR)方法验证异常miRNA在ALL患儿骨髓细胞内的表达(qRT-PCR组),结合患儿临床资料分析异常表达的miRNA与ALL预后的关系?【结果】 基因芯片结果显示:初发患儿miR-708 ...
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2008 目的筛选与精子发生相关的睾丸特异性新基因。方法将不同发育阶段的小鼠睾丸组织cDNA探针与Affymetrix全基因组芯片进行杂交,通过杂交信号的比较,筛选出差异表达的基因。用生物学信息软件对该基因进行生物学信息分析。RT-PCR分析该基因在小鼠不同发育阶段睾丸、小鼠不同组织及人不同组织中的表达。结果通过4、9、18、35、54日龄和6月龄小鼠睾丸的芯片信号比较筛选出一个差异表达基因（GenBank登录号:XM-156106）,全长有1364 bp,含有1146 bp的完整ORF,编码一个有381个氨基酸、
余振东 +7 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2012 [摘 要] 目的：用全基因表达谱芯片技术筛选小鼠胚胎干细胞（ESC）定向分化为表皮样细胞(Epidermal-like cells, ELC)的差异表达的基因并对其进行分析，以进一步阐明ESC分化为ELC的分子机制。方法：利用人羊膜建立体外诱导体系，将小鼠ESC诱导定向分化为ELC，做3次生物学重复，分别取未分化的ESC和诱导分化的ELC提取总RNA进行扩增、Cy3标记，与NimbleGen 135k 小鼠全基因表达谱芯片（含44170个基因）杂交，荧光扫描，筛选出差异表达基因 ...
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2008 目的了解人乳头瘤病毒（HPV）在宫颈损害病人中的感染情况,及其临床作用。方法应用基因芯片技术对1 308名患者进行HPV23种基因型检测,并结合其细胞学诊断。结果1 308名女患者中共检出HPV阳性者225名,阳性率为17.2%,其中HPV-16型119人,HPV-58型29人,HPV-18型24人。同时,在对1 308名患者进行细胞学检查中,发现宫颈上皮细胞病变（CIN）患者235名,其中63名为HPV-16型感染者,大多患者以宫颈上皮细胞低度病变为主 ...
解晶, 张仙森, 阮荣华
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2006 目的筛选与精子发生相关的基因。方法将不同发育阶段的小鼠睾丸组织cDNA探针与Affymetrix全基因组芯片进行杂交,通过杂交信号的比较,筛选出差异表达的基因。利用网络信息资源对该基因进行生物学信息分析。RT-PCR分析该基因在小鼠不同发育阶段睾丸及小鼠不同组织中的表达。结果通过4、91、8、35、54、日龄和6月龄小鼠睾丸的芯片信号比较筛选出一个差异表达杂交点（GenBank登录号:NM-026234）,生物信息学分析发现该基因全长3 979 bp,含有1 272 bp的完整ORF ...
唐爱发 +7 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2019 【目的】利用生物信息学的方法，对GEO和TCGA两个基因组学数据库进行分析，探究与前列腺癌相关的差异基因及相关的调控网络。【方法】综合GEO数据库的前列腺癌基因表达芯片数据（GSE46602、GSE55945）和TCGA数据库的RNA-seq数据，利用GEO2R及R语言的edgeR包进行基因差异分析，获得共同的显著差异基因，结合R语言的clusterProfiler包进行GO功能分析及KEGG通路分析，同时利用string网站进行蛋白互作网络分析，筛选出前列腺癌中调节蛋白表达量的关键基因 ...
李志标
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2017 随着高通量测序、基因芯片等技术的兴起以及生物信息学的应用,大量的基因组转录本被揭示,从此众多的研究成果不断涌现,为揭示基因中的奥秘提供了新思路。研究发现[1],人类93%的基因组DNA可转录成RNA,编码蛋白的基因仅仅为人类基因组的2%[2],而其余98%则为不具有或具有极低蛋白质编码功能的非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）。成百上千个非编码RNAs被转录,并且被认为是具有不同大小、结构和生物功能的功能性RNA ...
孙延文, 印璞, 于庭
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2011 【目的】 全基因芯片技术筛选伴肉眼门静脉癌栓(PVTT)肝细胞癌患者的基因谱,并进一步分析筛选出的基因的临床预测价值【方法】 40例伴有PVTT的肝癌根据术后中位生存期分为2组:长生存期组与短生存期组,采用全基因芯片技术和交叉检验重复抽样方法筛选出具有表达差异的基因谱,并进一步采用免疫组织化学方法验证筛选出的基因的临床意义【结果】本研究共筛选出的10个表达差异显著的基因,包括AKR1C1TARDBPEIF4EMFN1SNRNP25LOC55908ARPP19RORCPEX11B和EGFR2 ...
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[High expression of CFL1 and phospho-CFL1 predicts poor prognosis and promotes migration of colon cancer cells <i>in vitro</i>]. [PDF]
Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue BaoWang L +8 more
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