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Length and sequence variation in mitochondrial DNA control region and genetic structure of Bostrichthy sinensis [PDF]
中华乌塘鳢(Bostrichthysinensis)属暖水性浅海咸淡水经济鱼类。本实验研究了来自越南(Y)、东兴(DX)、北海(BH)、湛江(ZJ)、珠海(ZH)、海丰(HF)、厦门(XM)、宁德(ND)8个不同区域的野生群体和1个东山养殖(S)群体共124尾,测定其线粒体DNA控制区(D-loop)全长895bp的序列,并在Genbank下载鰕虎鱼亚目Gobioidei不同科的8种鱼类进行比对。通过软件对塘鳢科鱼类D-loop区DNA序列结构和中华乌塘鳢的群体遗传结构进行分析,得出以下结论: 1 ...
王登玉
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东北虎(Panthera tigris altaica)是体型最大的猫科(Felidae)动物之一,是极具代表性的珍稀野生动物。现有研究表明,我国野生东北虎种群遗传多样性较低、近交水平较高。尽管目前我国野生东北虎的数量在逐步增长,但通过人工干预来提高野生东北虎的遗传多样性会更利于其数量的恢复,通过野化放归进行遗传拯救是一种关键策略,但实施遗传拯救之前,必须确定圈养个体与现存野生个体间的遗传关系。采用粪便DNA的高通量测序数据组装了51只横道河子圈养东北虎和13只完达山 ...
褚佳宁+11 more
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目前,栖息地的破坏是野生动物处于濒危状态的主要因素之一。东北马鹿是国家重点保护动物,近年来,人类活动的干扰使其生境明显减少并呈斑块状分布,这将使东北马鹿的种群遗传结构发生变化。然而,在野生动物遗传结构研究中,传统的取样方法直接或间接地对动物造成了伤害。因此,本文以粪便为研究材料,对来自完达山地区的9个东北马鹿样品进行mtDNA序列分析,共发现29个变异位点,定义了7个单倍型,其单倍型多样性(h)平均值为0.917、核苷酸多样性(π)平均值为2.803,种群总体遗传多样性较高 ...
刘艳华, 张明海
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Studies on Population Genetic Structure of Chiloscyllium plagiosum in the neritic waters of Southeastern China [PDF]
本文通过设计引物进行PCR扩增并测序,获得并分析条纹斑竹鲨(Chiloscylliumplagiosum,Bennett)的线粒体基因组(mtDNA)中细胞色素b基因(cytb)及控制区(controlregion)基因的全序列,探讨了条纹斑竹鲨琼海、湛江、厦门、平潭4个群体的遗传结构特点和群体分化,主要结果如下: 1.条纹斑竹鲨mtDNA的cytb全序列长度为1146bp。共发现20个变异位点,变异主要发生在三联密码子的第三个碱基上,在碱基组成上呈现显著的反G偏倚,在密码子使用上也存在明显偏倚性 ...
傅蒙娜
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为了解冠状病毒在猫科动物的感染情况,对采自上海某动物园的猫科动物144份样品进行检测,并对获得的阳性样品进行扩增和测序。结果显示:SARSCoV2荧光RTPCR检测全部为阴性;FCoV荧光RTPCR检测阳性3份。测序结果显示,检测到FCoV的ORF3、ORF7和S基因均呈遗传多样性,序列存在很大的个体间差异。3a、3b和3c基因主要表现为氨基酸突变。7a基因在第9位(F)、12位(V)和47位(S)均未发生氨基酸替换。它们均具有完整的7b基因。S基因的S1/S2裂解位点处有连续的RRS/A ...
杨德全鞠厚斌朱九超葛菲菲杨显超李鑫沈海潇赵洪进 王建
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Genetic diversity of amphioxus in China Seas and strain breeding in the laboratory [PDF]
头索动物文昌鱼进化地位特殊,具有脊索动物门祖先的原始特征,是进行脊椎动物起源和演化、胚胎发育和比较基因组学研究的重要材料,具有重要的科研价值,同时文昌鱼还是一种有养殖前景的经济物种。目前对文昌鱼的研究主要集中在进化和发育生物学方面,对其分类学、遗传多样性和育种方面的研究则相对滞后。 将材料运用于科学研究之前,首先必须对其进行正确的物种鉴定。本文根据形态特征鉴定了采集于粤东海域的短刀侧殖文昌鱼,并测定了其线粒体基因组全序列,结合已报道的其它8种文昌鱼线粒体基因组数据,对文昌鱼属的分类进行了探讨 ...
李伟业
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黄颊长臂猿属于IUCN濒危物种,仅分布于老挝、越南和柬埔寨。该物种微卫星的研究尚未报道。本研究,对黄颊长臂猿SSR位点进行筛选,并对南京地区圈养黄颊长臂猿种群进行了遗传多样性分析,统计了等位基因数、有效等位基因数,计算了群体杂合度、多态信息含量(PIC)、亲缘系数等参数。结果显示,共获得黄颊长臂猿11个多态性微卫星位点,等位基因数在2—5之间,多态信息含量为0.175—0.701,观测杂合度(Ho)为0.067—0.8,期望杂合度(He)为0.191—0.770,其个体间亲缘系数普遍偏高 ...
陈蓉吕, 冉程家, 求傅, 兆水
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