Study on Data Scaling and Significant Metabolites Identification for NMR-based Metabolomics [PDF]
, 2011 代谢组学方法是上世纪90年代中期发展起来的一门新学科，它借助高通量、高灵敏度与高精确度的现代分析技术，分析细胞、组织和生物体液中内源性代谢物的整体组成，并通过代谢物复杂的、动态的变化，辨识和解析被研究对象的生理病理状态。 高通量、高分辨的现代分析仪器在获取生物样品中更丰富、更准确的代谢信息的同时，也给后续的数据分析带来了巨大的挑战。本文从数据预处理和特征选择两方面出发，深入研究核磁共振代谢组学数据处理，提出新的数据归一化方法和特征选择方法，增强后续数据统计分析的可靠性。本文工作包括如下两个创新点： 首先，
李伟
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2017 目的探讨低血红蛋白密度（low hemoglobin density,LHD）对铁缺乏不同阶段的评价,明确LHD在不同病因贫血鉴别诊断的临床应用价值。方法回顾性分析2016年5月-2016年7月吉林大学第一医院就诊的铁缺乏、肾性贫血、肿瘤性贫血的低血红蛋白密度及铁代谢等检验结果,以同期我院健康体检者为对照组。比较实验组内（铁缺乏组、肾性贫血组、肿瘤性贫血组）及实验组间（健康体检组）LHD和铁代谢参数,比较LHD在不同阶段铁缺乏状态的水平,绘制各参数对铁缺乏评估的ROC曲线,分析LHD与铁代谢指标的相关性。
师传帅, 续薇
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Recent Advances in Metabolomics-Based Analysis of Non-volatile Compounds in Chinese Yellow Rice Wine, Huangjiu [PDF]
Huangjiu, as a traditional fermented beverage in China, is rich in volatile organic compounds (VOCs) and non-volatile compounds (NVCs). VOCs include alcohols, esters, aldehydes, and ketones, which contribute to the unique flavor of Huangjiu. NVCs include
ZHAO Shirui, REN Qingxi, ZHOU Zhilei, JI Zhongwei, ZHOU Jiandi, XU Yuezheng, MAO Jian
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Zhongguo shiyan zhenduanxue信号转导与转录激活因子3(STAT3)通路在结直肠癌的发生发展中具有枢纽调控作用。本文介绍该通路在促进肿瘤增殖、免疫逃逸及代谢重编程中的分子机制，并结合转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学研究，系统总结STAT3通路相关的早期诊断性标志物的研究进展，多组学整合模型、人工智能算法在结直肠癌无创早筛中的应用前景，并梳理当前存在的技术瓶颈与临床转化挑战，为精准医学提供理论基础与实践路径。
王家麟, 刘明圣, 冯野
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Preparation, storage and experimental conditions of biofluid samples for NMR based metabolomics [PDF]
, 2009 自1999年Nicholson及其同事在核磁共振(NMR)研究的基础上提出代谢组学概念以来，基于NMR代谢组学得到了迅速地发展。目前基于NMR代谢组学的主要研究对象是体液样品的NMR谱。由于生物体液的储存、样品制备和实验条件都会对实验结果产生影响，因此研究样品制备、储存及实验条件可以了解外界条件对样品的具体作用效果，从而通过控制外界环境及人为操作，以保证试验数据的稳定性和可比较性。 本文以基于NMR代谢组学试验中的人体的尿液、血液和全唾液为主要研究对象，研究各类样品的储存 ...
曹红婷
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Non-targeted Metabolomics Analysis of Metabolite Differences amongst Different Parts of Physalis alkekengi L. var. franchetii [PDF]
Non-targeted metabolomics techniques were used to analyze the metabolite differences in the calyx, fruit, stem, and root of Physalis alkekengi L. var. franchetii (PAVF). The metabolomic profiles of PAVF were investigated by UHPLC-Q-Orbitrap HRMS with PCA,
Hao ZHANG +3 more
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Responses of Two Species of Abalone to Long Time Ocean Acidification Stress [PDF]
, 2017 化石燃料燃烧产生的CO2持续不断地释放到大气中，其中约有1/4~1/3会被海洋吸收，从而导致表层海水pH下降，造成所谓的海洋酸化，对海洋系统造成严重影响。有报道指出海洋酸化胁迫会影响海洋钙质生物的生长发育、基因表达和代谢过程，但关于海洋酸化对鲍基因表达及代谢过程影响的研究还较少。另外，有许多研究指出环境胁迫会改变生物的DNA甲基化状态，从而影响生物的基因表达，调节生物在胁迫环境中的生存与发育状态，但在海洋钙质生物中相关的研究有限。本实验通过模拟未来的海洋环境（对照组：400ppm、中度酸化组 ...
陆承宽
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Analysis of Taste and Differential Metabolites of Different Ganoderma lucidum Strains Based on Electronic Tongue and Non-targeted Metabolomics [PDF]
In order to explore the differences of taste and metabolites of different Ganoderma lucidum strains, the fruiting bodies of different Ganoderma lucidum strains were taken as samples, the taste of aqueous extracts of 21 different Ganoderma lucidum strains
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谷胱甘肽还原酶影响结肠癌代谢及预后：一项基于蛋白组学与微阵列芯片分析的研究 附视频
Zhongguo shiyan zhenduanxue目的 探讨谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase, GSR)对结肠恶性肿瘤代谢的影响及其对结肠癌患者的预后价值。方法 通过蛋白组学差异分析获得结肠癌组织和正常结肠上皮组织的差异蛋白，并通过富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)分析鉴定代谢通路中的关键蛋白，进行生存分析和临床信息相关性分析。收集120例结肠癌患者手术病理标本制作组织微阵列芯片，进行免疫组织化学染色。结果 蛋白组学差异分析共鉴定出1 209个差异表达蛋白。KEGG富集分析显示，差异蛋白显著富集于代谢通路 ...
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2009 目的探讨11β-羟类固醇脱氢酶1在代谢综合征大鼠模型中的表达及意义。方法健康雄性大鼠20只,随机分为2组,普通膳食对照组（A组）及高盐高热量膳食组（B组）,喂养期间每周测一次进食量、体重和血压,符合代谢综合征模型标准后,选择终止日期,禁食12小时,用自动生化分析测量空腹血糖、甘油三酯（TG）、总胆固醇（TC）、高密度脂蛋白（HDL-C）、低密度脂蛋白（LDL-C）,并将大鼠处死进行解剖,收集脂肪组织行RT-PCR检测11-βHSD 1mRNA表达的相对量,并进行统计学分析。结果高盐高热量膳食组体重、血脂、
张基昌, 李淑梅, 刘斌, 史永锋
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