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New Methods for NMR Metabolic Profiling Normalization and Fusion [PDF]
, 2017 高通量的现代分析技术在提供生物样品丰富代谢信息的同时，也为后续数据分析和解释带来极大的挑战。本文以代谢组学数据分析为主线，在数据预处理阶段的归一化方法和多变量统计分析建模阶段的整合分析方法两个方面提出新的方法以及研究思路，并将其应用在电针干预慢性萎缩性胃炎大鼠模型的代谢组学研究中，最后还设计了一款实用型的谱峰归属软件。主要研究成果包括： 第一部分提出了一种归一化新方法。该方法首先基于相对标准偏差将方差较大的变量剔除，随后结合概率商归一化方法求出整体浓度缩放系数 ...
郑旭娟
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Pifu-xingbing zhenliaoxue zazhi[目的] 分析神经梅毒患者的脑脊液代谢物，以确定潜在的诊断标志物。 [方法] 利用液相色谱-质谱联用技术的非靶向代谢组学，分析5例神经梅毒患者和5例梅毒/非神经梅毒患者的脑脊液样本。将原始数据经过质量控制和归一化处理后，进行数据分析（主成分分析、正交偏最小二乘判别分析、层次聚类分析）确定两组间的差异代谢物。 [结果] 神经梅毒患者体内，有6种代谢物显著升高，分别是Pro-leu、nudifloramide、N-oleoyl glycine、DMP 777 ...
贺 媛媛 +5 more
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Effects of electropuncture of acupoints on the foot Yangming stomach meridian on metabolic profiling of gastric mucosa in gastric ulcer rats [PDF]
, 2017 目的:采用核磁共振氢谱技术(1H; NMR)研究电针胃经穴对应激性胃溃疡大鼠胃黏膜组织代谢物谱的表达。方法:40只SD大鼠随机分为正常组、模型组、胃经组和胆经组。利用束缚-冷应激法; 制备应激性胃溃疡模型大鼠,光镜下观察大鼠胃黏膜组织病理形态学的变化,采用1H NMR技术获取胃黏膜组织1H; NMR谱,并利用模式识别方法分析各组间的代谢物谱的差异。结果:与正常组比较,模型组大鼠胃黏膜损伤和胃黏膜组织代谢轮廓差异明显,胃黏膜组织乙酸、肌; 醇、磷酸胆碱、谷氨酸、甘氨酸、乙醇胺、赖氨酸、3-羟基丁酸、缬氨酸、
刘密 +5 more
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氢谱磁共振代谢组学在2型糖尿病特征代谢物监测中的应用 [PDF]
, 2018 目的应用氢谱磁共振(~1H-NMR)代谢组学方法研究2型糖尿病(T2DM)患者尿液中小分子代谢物代谢轮廓的变化。方法选择T2DM患者98例及健康对照组82例,利用~1H-NMR方法检测尿液的代谢轮廓,结合偏最小二乘判别分析法的模式识别分析方法,比较两组尿液中小分子代谢物差异。结果尿液的偏最小二乘判别分析法得分图显示与T2DM有关的特征代谢物包括乙酸、乳酸、牛磺酸、乙酰乙酸、葡萄糖、丙氨酸、甲基丙二酸、肌酐、柠檬酸、三甲胺等。结论糖代谢紊乱、氧化应激、氨基酸及脂类代谢异常 ...
张志军, 董继扬, 马红
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2011 目的探讨我国吉林地区汉族代谢综合征及其相关表征的发生与LRP6基因R611C基因多态性的相关性。方法 194例研究对象为代谢综合征组（MS）（98例）和对照组（96例）,代谢综合征组包含血糖升高患者（>5.6 mmol/L）共58例、高血压共66例、高脂血症共62例 ...
王珺楠 +7 more
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NMR-based metabolomic comparative analysis between animal models and patients of pancreatic cancer [PDF]
, 2017 胰腺导管腺癌(PDAC)是最致命的肿瘤之一，且其早期诊断困难。作为唯一能无创伤性获得活体组织生化信息的技术，活体磁共振波谱（MRS）技术已被欧洲肿瘤学大会推荐为较好的癌症诊断方法。但目前MRS的应用受到信号灵敏度低、分辨率不足的限制。高分辨魔角旋转核磁共振（HR-MASNMR）技术可以大大提高组织样本的检测分辨率和灵敏度，可以作为MRS技术的离体替代技术。本论文工作利用此技术比较分析胰腺癌患者和动物模型的代谢异同点，增加对PDAC的代谢重构的理解，进一步为胰腺癌的临床诊断提供可靠的实验数据 ...
占博涵
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基于广州管圆线虫感染导致Balb/c小鼠大脑脱髓鞘的非靶向代谢组学分析
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban目的观察广州管圆线虫（AC）感染导致Balb/c小鼠大脑脱髓鞘症状并分析胼胝体非靶向代谢组的变化，探讨造成脱髓鞘的机制。方法将Balb/c小鼠随机分为对照组（6只）和感染组（6只），感染组每只经灌胃感染30条ACⅢ期幼虫，对照组灌胃等体积生理盐水。感染后第3、6、9、12、15、18、21天检测体质量、视觉及行为学评分评估小鼠神经功能学变化；取感染21 d后脑组织，免疫荧光染色、HE染色及透射电镜观察小鼠大脑髓鞘和视网膜形态学变化；代谢组学检测后，采用火山图和热图分析差异代谢物 ...
牛珍 +5 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2015 目的分析并研究钠代谢紊乱对重型颅脑损伤患者病情及预后评价的效果,从而为临床治疗提供依据和指导。方法依据纳入排除标准共选取96例重型颅脑损伤患者,根据患者血钠水平将其分为钠代谢正常组(对照组)和钠代谢紊乱组(研究组),对两组患者进行常规的颅脑损伤治疗,分析患者血钠异常的发生率,并对两组患者进行GCS评分和死亡率比较。结果钠代谢正常组(对照组)和钠代谢紊乱组(研究组),所占比例分别为62.5%,37.5%;研究组患者GCS评分(9.7±1.1)显著低于对照组;死亡率(36.1%)显著高于对照组 ...
袁莉
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Study on the central response mechanism in gastric ulcer rats treated by electroacupuncture using ~1H NMR metabolomics techniques [PDF]
, 2017 目的:采用核磁共振氢谱技术(~1H; NMR)研究电针胃经穴治疗应激性胃溃疡大鼠大脑皮质、下丘脑、延髓代谢物谱的表达。方法:40只Wistar大鼠随机分为正常组、模型组、胃经组和胆经; 组。利用束缚冷应激法制备应激性胃溃疡模型大鼠,造模成功后用电针分别刺激胃经组和胆经组相关穴位。收集大鼠大脑皮质、下丘脑、延髓,获取一维~1H; NMR谱,并利用模式识别方法分析各组间的代谢轮廓差异。结果:模型组与正常组、胃经组、胆经组大鼠大脑皮质、下丘脑和延髓代谢物谱均有明显区分,其中正; 常组与模型组分离最明显 ...
刘彩春 +5 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban目的探究低氧暴露对小鼠脾脏组织碳代谢通路的调控机制。方法将C57BL/6小鼠分别在海拔400 m和4 200 m饲养，每组5只，30 d后无菌取出脾脏组织，通过转录组测序，蛋白质组学和非靶向代谢组学分析差异表达基因、差异蛋白以及差异代谢物，利用GO和KEGG富集分析，挖掘关键通路，并通过RT-qPCR和Western blot对通路中关键基因和蛋白进行验证。结果转录组测序发现，低氧暴露下有4 213个基因出现显著性差异表达，其中1 947个基因表达上调，2 266个基因表达下调 ...
陈晓晨 +5 more
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