Metabonomic Analysis Reveals Mechanisms for Both Renoprotection of Exendin-4 in Rats with Diabetic Kidney Disease and Adaptation of Microbacterium YLB-01 to High Pressure and Low Temperature [PDF]
基于核磁共振(NMR)的代谢组学是一门新兴的“组学”学科,它将1H-NMR波谱检测技术和模式识别分析技术相结合,被广泛应用于疾病的早期诊断、病理机制、药物的药效评估、微生物环境胁迫适应性等研究。本论文应用基于NMR技术的代谢组学方法,研究艾塞那肽Exendin-4(胰高血糖素样肽-1(GPL-1)类药物)对糖尿病肾病(DKD)大鼠的肾功能保护机制以及深海沉积微杆菌YLB-01耐受高压低温的分子机制。 糖尿病肾病(DKD)发病机制尚不完全明确。最近的研究表明GLP-1类药物(如Exendin-4 ...
胡晓敏
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目的 探讨血液透析滤过对终末期肾病患者钙磷代谢及心血管并发症发生的影响。方法 选取2021年1月至2022年1月我院收治的60例终末期肾病血液透析患者,将每周两次血液透析患者设为HD组,每周两次血液透析联合每两周一次血液透析滤过患者设为HDF组。比较两组患者治疗前后钙磷代谢指标变化及心血管并发症发生情况。结果 治疗后,两组患者血钙(Ca)、血磷(P)、甲状旁腺激素(iPTH)水平均较治疗前改善,差异有统计学意义 ...
张帆, 江杨, 龚宇, 罗逊
doaj
Study on Peak Alignment and Data Normalization for NMR-based Metabonomics [PDF]
代谢组学(metabonomics)是研究生物体受病理/生理刺激或基因改变后,定量分析内源性代谢产物的整体组成及其变化规律的科学。经过十几年的快速发展,代谢组学已成功地应用到病理学、毒理学、药理学、疾病诊断等诸多领域。核磁共振(NMR)由于其独特的优势,已成为代谢组学数据获取的重要手段之一。但由于生物系统及外部环境的复杂性,样本制备及实验操作的差异性,以及数据的高维度,代谢组学的数据分析常常面临巨大挑战。数据预处理可很大程度上抑制干扰,规范数据,有利于模式识别准确性的提高和生物标志物的发现 ...
黄赫
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New Variable Scaling Method for Metabolomic Data Analysis and its Application [PDF]
代谢组学,即利用高通量、高灵敏度与高精确度的现代分析技术,结合模式识别方法研究生物体系在受到外界刺激或干扰因素后,其内源性小分子代谢产物的动态变化,探究代谢模式变化与生命现象之间的关系,已成为当今系统生物学的一个研究热点领域。随着研究的深入,数据分析的问题越来越突出,并已成为代谢组学研究的关键技术和瓶颈之一。本文以代谢组学数据尺度缩放为主要研究内容,发展新的代谢组学数据分析方法,并将其应用于鱼类营养代谢组学研究中。主要的研究内容包括: 一、提出了模型自适应尺度缩放方法。该方法根据后续的多元统计模型 ...
刘新卓
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圈养动物尿液中含有丰富的代谢产物,是代谢组学分析中用以判定动物发情、妊娠、健康状态、应激水平及动物福利的重要生物检材。因采样困难及安全考虑,目前多选择动物离开或转移后采集遗留在圈舍地面的尿液样本,这种样本容易被污染而影响检测结果,因此探索一种低污染、方便且快捷的尿液采集和预处理方法非常必要。针对8只(3♀,5)圈养大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)的27份尿液样品,分别采用不做处理(对照组)、0.22 μm滤膜过滤和添加叠氮钠3种预处理方法,然后通过微生物培养 ...
闫拯 +12 more
doaj
NMR-based metabolomic analysis for mechanisms of both protections of HDL and apoA-I mimetic peptide D-4F, and injury of contrast media on endothelial cells [PDF]
细胞代谢组学将高通量检测技术与多种数据分析方法结合,用于揭示细胞内整体、动态的代谢变化,在药物研究中发挥着重要的作用。本论文采用基于1H核磁共振(NMR)的细胞代谢组学方法,探讨与内皮细胞代谢相关的药物作用机制。 研究表明,载脂蛋白A-I(apoA-I)模拟肽D-4F展现出许多与高密度脂蛋白(HDL)相似的内皮保护功能。但是,目前并不清楚D-4F的内皮保护机制是否与HDL完全一样。因此,我们运用基于1HNMR的代谢组学方法,比较HDL和D-4F拮抗氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL ...
徐文琦
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New methods of NMR-based metabonomics data processing and its application [PDF]
代谢组学是关于定量描述生物内源性代谢物质的整体及其对内因和外因变化应答规律的科学,是系统生物学的有机组成部分。以核磁共振(NuclearMagneticResonance,NMR)为主要分析手段的代谢组学通常称为NMR代谢组学,已经广泛地应用到了包括药物研发,分子生理学,分子病理学,基因功能组学,营养学,环境科学等重要领域。NMR代谢组学的数据具有非线性、高维性、小样本性等特点,开发符合这些特性、且具有一定普适性的数据分析方法是代谢组学发展的关键。本文从数据预处理和数据分析两个方面入手 ...
徐乐
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Research Progress of Metabolomics in Forensic Pathology [PDF]
Metabolomics is an interdisciplinary subject that rose in the post-genomic era, which focuses on quantitative study of the response of living organisms to outside stimulation and pathophysiological changes, as well as multiple dynamic response of the ...
DU Tie-shuai, MENGXI Mai-meng, YE Xing1, et al
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NMR-based metabolomic comparative analysis between animal models and patients of pancreatic cancer [PDF]
胰腺导管腺癌(PDAC)是最致命的肿瘤之一,且其早期诊断困难。作为唯一能无创伤性获得活体组织生化信息的技术,活体磁共振波谱(MRS)技术已被欧洲肿瘤学大会推荐为较好的癌症诊断方法。但目前MRS的应用受到信号灵敏度低、分辨率不足的限制。高分辨魔角旋转核磁共振(HR-MASNMR)技术可以大大提高组织样本的检测分辨率和灵敏度,可以作为MRS技术的离体替代技术。本论文工作利用此技术比较分析胰腺癌患者和动物模型的代谢异同点,增加对PDAC的代谢重构的理解,进一步为胰腺癌的临床诊断提供可靠的实验数据 ...
占博涵
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Effects of electropuncture of acupoints on the foot Yangming stomach meridian on metabolic profiling of gastric mucosa in gastric ulcer rats [PDF]
目的:采用核磁共振氢谱技术(1H; NMR)研究电针胃经穴对应激性胃溃疡大鼠胃黏膜组织代谢物谱的表达。方法:40只SD大鼠随机分为正常组、模型组、胃经组和胆经组。利用束缚-冷应激法; 制备应激性胃溃疡模型大鼠,光镜下观察大鼠胃黏膜组织病理形态学的变化,采用1H NMR技术获取胃黏膜组织1H; NMR谱,并利用模式识别方法分析各组间的代谢物谱的差异。结果:与正常组比较,模型组大鼠胃黏膜损伤和胃黏膜组织代谢轮廓差异明显,胃黏膜组织乙酸、肌; 醇、磷酸胆碱、谷氨酸、甘氨酸、乙醇胺、赖氨酸、3-羟基丁酸、缬氨酸、
刘密 +5 more
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