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Gold Nanoparticles Application in Gene Mutation Detection and SNP Analysis [PDF]
, 2008 [中文文摘]对特异核苷酸序列的高选择性检测在生物医学研究和临床检测中日趋重要.纳米金特殊的光学性质、电学性质、化学性质、以及良好的生物相容性,使之成为检测生物大分子的首选工具.本文介绍了几种典型的基因突变检测及单核苷酸多态性(SNP)分析系统:基因芯片、生物传感器和光学检测系统.综述了多种颇有新意的检测方法和原理,详细阐明了它们的检测机制和研究进展,分析并比较了纳米金不同的作用方式,为纳米金在突变检测上的进一步研究提供了一定思路和参考.[英文文摘]Highly selective detection ...
孙莉萍 +4 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 1994 从２０例人类白细胞抗原－ＤＲ（ＨＬＡ－ＤＲ）血清学特异性不同的血痕样本中抽提基因组ＤＮＡ，经ＰＣＲ扩增ＨＬＡ－ＤＲＢ基因第二外显子的高度多态区域。ＰＣＲ产物在５０％甲酰胺存在下加性获得单链ＤＮＡ片段后，经８％中性聚丙用酰胺凝胶电泳、银染显色分析。结果显示，ＤＲ血清学特异性不同的个体具有不同的电泳图型。而ＤＲ相同血清不同的个体却具有相同的电泳带型。在稳定条件下，单链电泳图型有着良好的重复性。与聚合酶链反应－制性片段长度多态性（ＰＣＲ－ＲＦＬＰ）或聚合酶链反应－序列特异寡核苷酸（ＰＣＲ－ＳＳＯ）探针法相比 ...
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383例汉族正常人群TGFβ1基因启动子区-509C/T单核苷酸多态性分析
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2006 目的探讨我国汉族人群转化生长因子β1（TGFβ1）基因启动子区-509C/T单核苷酸多态性（NCBI SNP数据库:rs1800469）分布的特征及种群间遗传差异。方法采用PCR—RFLP结合DNA测序技术,检测鉴定383例无血缘关系的健康中国汉族个体血样DNA的基因型,并与国外其他人群相比较。结果①我国汉族人群TGFβ1-509C/T基因型多态性CC∶CT∶TT=125(0.326∶189（0.494）∶69（0.180）;等位基因分布频率:C∶T=0.573∶0.427。②与日本 ...
薛超, 李幼姬, 王一鸣, 黄玮俊
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应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测载脂蛋白 E 基因多态性
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2004 【目的】应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测人类载脂蛋白E(apoE)基因的多态性。【方法】用PCR扩增出含apoE两个单核苷酸多态性(SNPs)位点(334T/C和472C/T)的DNA片段作为模板,经延伸反应,产物纯化后利用MALDI-TOFMS进行检测。从而确定样本apoE基因型。【结果】应用本技术对50例广东地区无关个体进行apoE基因多态性检测,共检出3种常见的apoE基因型,其中以apoEΣ3/3型最多,占总数的74.00%;等位基因频率分布以ε3(87.00%)最高。【结论 ...
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Study of the association of vascular endothelial growth facto（VEGF）936*T/C polymorphism with the transcription activity of VEGF [PDF]
, 2012 背景和目的 血管内皮生长因子(vascularendothelialgrowthfactor，VEGF)是已知作用最强的促血管生成因子之一，且研究表明VEGF在肿瘤的发生发展过程中起重要作用。VEGF基因上存在多个多态性位点，其中VEGF基因启动子区上游-2578C/A和下游+936C/T单核苷酸多态（singlenucleotidepolymorphism，SNP）已被证明可影响VEGF蛋白表达，且与多种疾病的发生发展相关。本课题通过研究内皮生长因子（VEGF）936*T ...
赵磬
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2011 目的构建检测冠心病（CAD）相关基因多重单核苷酸多态性（SNP）分型的方法。方法提取外周血白细胞DNA,选择CAD相关基因中国汉族人群的44个标签SNP,每个SNP设计3条引物,通过PCR扩增、延伸及杂交,应用SNP Stream基因分型系统对SNP位点进行基因分型。结果构建的44个SNP分型成功32个,分型成功率为72.7%（32/44）。通过对583份DNA标本进行检测,32个SNP的平均样本检出率为98.3%。结论本实验构建的32重SNP基因分型检测方法具有快速、准确、高通量、操作简单 ...
张阳东 +4 more
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Study on Ensemble Algorithm for Multi-class Gene Microarray Datasets [PDF]
, 2015 集成学习是当前机器学习领域的一个研究热点，具体到多分类问题，旨在通过一组差异的分类器共同解决起初的多分类问题，然后经过大多数投票等策略将各个分类器的输出结果进行融合。集成多分类算法相比于单个的优秀分类器往往性能上更准确、更稳定，同时还具有更强的泛化能力。在解决多分类问题时，基于纠错输出编码算法（ECOC）。这是解决多分类问题的一种灵活、高效的算法框架，关键要点是将多分类转变为多个二分类问题。此外，遗传规划算法可用于解决二分类问题，通过进化计算得到准确的分类规则。本文在已有的研究基础上 ...
曾志浩
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慢性HBV感染者核苷（酸）类似物长期治疗HBsAg转阴的影响因素
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2018 【目的】通过对核苷（酸）类似物（NA）治疗的慢性乙型肝炎（CHB）患者长期随访观察，了解CHB患 者的血清HBsAg转阴情况及其影响因素。【方法】回顾性分析1205例中山大学附属第三医院长期接受核苷（酸） 类似物抗病毒的CHB患者的临床资料，包括一般人口学、基线生化学、病毒学、血清学、影像学指标及动态变化， 了解其血清HBsAg转阴情况，并进行单因素和多因素COX回归分析。【结果】对1205例CHB患者随访10年，共 50例发生血清HBsAg转阴，每年转阴率为1.0%。单因素分析发现：年龄≥50岁 ...
李向永, 陈健宁, 顾玉荣
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Genetic mapping and quantitative trait loci analysis of growth-related traits in the small abalone Haliotis diversicolor using next-generation sequencing [PDF]
, 2016 杂色鲍(Haliotisdiversicolor)广泛分布于韩国、日本、中国、越南和菲利宾沿岸，是一种具有重要经济价值的养殖鲍种。应用传统的育种方式，杂色鲍育种工作虽然已经取得了一定进展，但是开展分子标记辅助选育仍然是加速该进程的必然选择。下一代测序技术可以高通量、低成本地完成SNP标记的发掘与分型，目前已被广泛应用于遗传研究的各个方面。本文利用下一代测序技术完成了杂色鲍的SNP标记开发与验证、高密度连锁图谱构建、QTL定位和候选基因的关联分析等工作。主要结果如下： (1) 杂色鲍高密度连锁图谱的构建 ...
任鹏
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Genetic Analysis on Grain Shape and Mapping, Cloning and Characterizing of Major Grain length Gene in rice [PDF]
, 2014 水稻是世界上最重要的禾谷类作物之一，提高水稻产量和改善稻米品质是水稻遗传与育种研究的永恒主题。水稻粒形是粒长、粒宽、长宽比及粒厚的综合性状，是稻米外观品质的重要指标，同时对稻米的碾磨品质、食味品质及产量均有重要影响。厦门大学水稻遗传育种研究室长期致力于大粒优质水稻新品种的遗传与育种研究，前期采用60Co-γ射线辐照水稻成熟花粉诱变方法，获得了一批遗传上稳定的长粒大粒水稻种质材料并广泛应用于优质籼稻育种中。为了解这些大粒材料谷粒性状的遗传基础，本研究选择其中的三个大粒品系JF171、JF178 ...
黄荣裕
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