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Searching Differential Expression Gene in Prostate Cancer Cell Lines Using Microarray and Analysis of Gene Function [PDF]
人类基因组测序工作的完成使人们可以方便调用任何基因序列,但仅有基因序列并不能解释众多的生物学问题,这要求人们发展一种高通量的技术用于研究基因的生物学功能以及与其他基因相互作用的关系。DNA微阵列技术以其高通量的特点已经在肿瘤生物学的研究中逐渐被采用。由于癌症是源于基因表达谱改变的一种基因疾病,通过DNA微阵列技术研究代表肿瘤发展各阶段细胞之间的基因表达差异将会使人们更好的了解肿瘤的形成和发展过程。前列腺癌是引起西方男性死亡的主要癌症,而且也是最常见的诊断性癌症。通常,前列腺癌变的速度很慢 ...
涂智杰
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Analysis of gene expression patterns based on microarrays [PDF]
基因芯片含有寡核苷酸探针或者cDNA探针,用来在一次实验中同时测量成千上万个基因的表达水平。基因表达模式分析系统(GEPS:theGeneExpressionPatternScanner)是一个在线的交互式基因芯片数据分析平台,可对基因表达谱进行相关性分析,相似性分析和特异表达分析。这些分析模式是利用空间几何,相关性分析的方法,系统地、全局地鉴定的,并且有图形化和量化显示。用户可以设置分析时的阀值。另外,为了更好地理解基因表达模式 ...
王玉鹏
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目的评价结核杆菌蛋白芯片对肺结核的诊断价值及其影响因素。方法对痰涂片阳性肺结核病患者结核杆菌蛋白芯片和胸部CT扫描结果进行对比,分析肺结核病变范围和类型等因素对结核杆菌蛋白芯片检测的影响。结果结核杆菌蛋白芯片阳性率72.0%,CT诊断阳性率为90.0%,两种方法同时检测阳性率达到96.0%;多个肺野肺结核的结核杆菌蛋白芯片阳性率高于单个肺野 ...
曹军皓, 黄前川, 赵冰红
doaj
Study on Ensemble Algorithm for Multi-class Gene Microarray Datasets [PDF]
集成学习是当前机器学习领域的一个研究热点,具体到多分类问题,旨在通过一组差异的分类器共同解决起初的多分类问题,然后经过大多数投票等策略将各个分类器的输出结果进行融合。集成多分类算法相比于单个的优秀分类器往往性能上更准确、更稳定,同时还具有更强的泛化能力。在解决多分类问题时,基于纠错输出编码算法(ECOC)。这是解决多分类问题的一种灵活、高效的算法框架,关键要点是将多分类转变为多个二分类问题。此外,遗传规划算法可用于解决二分类问题,通过进化计算得到准确的分类规则。本文在已有的研究基础上 ...
曾志浩
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目的研究AQP4在脑积水鼠中的遗传规律,探讨其在脑积水中的作用。方法随机选择未脑积水AQP4敲除雄鼠与AQP4敲除雌鼠交配,用其F1、F2、F3代建立遗传图谱,研究其遗传规律。提取大脑组织总RNA,制作基因芯片研究其在遗传中的作用。结果 AQP4基因敲除表型的是可遗传的且与性别无关,同时并非单基因遗传,且为常染色体遗传;小鼠全基因芯片表明在AQP4敲除的背景下脑积水表型的发生有其它遗传基因的参与。结论通过制作遗传图谱以及小鼠基因芯片,证明AQP4在先天性脑积水发病机制中有重要的作用。
乔小放 +6 more
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The bioinformatics research of gene’s pausing and APA [PDF]
近年来,生化技术的不断优化以及二代测序的使用使得我们对基因的转录调控有了新的认识,尤其是在真核生物中聚合酶II的转录行为有了更为深入的了解。就目前的报道,我们知道聚合酶II在基因近端启动子的停留确定是转录过程中的限速步奏,同时也是对外界刺激的快速应答的调控方式,对细胞的增殖,发育等许多方面有着重要的作用,而就其调控基因的具体数量以及基因状态从未研究过。 高通量技术的应用过程中,我们发现在基因的3’UTR区域的可变聚腺苷酸化(APA)也是转录过程中重要的调控节点 ...
余斌
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【目的】应用miRNAs芯片筛选原代培养的鼻咽癌细胞差异表达miRNAs,并寻找差异表达miRNAs调控的靶基因,为进一步研究其在鼻咽癌发病机制中的作用打下基础。【方法】运用miRNAs芯片技术筛选原代培养的鼻咽癌细胞差异表达miRNAs,同时运用miRNAs特异的引物组对差异表达的miRNAs进行荧光定量RTPCR验证。运用靶基因预测软件并结合全基因组表达谱芯片结果预测差异表达miRNAs可能调控的靶基因,并利用westernblot技术检测预测的靶基因在原代培养的鼻咽癌细胞中的表达。【结果 ...
李晓霞 +4 more
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The research of the detection of thalassaemia multiple mutations by next-generation sequencing technology [PDF]
地中海贫血又称珠蛋白生成障碍性贫血,早期的病例来自地中海地区,故称为地中海贫血,是世界范围内影响最大的单基因病之一,遵循孟德尔遗传定律。该病是由珠蛋白基因的缺失或点突变所致,根据其变异的肽链可分为α地贫和β地贫。由于其基因缺陷的复杂、多样,使缺乏的珠蛋白链类型、数量、临床症状变异较大。临床上对中、重度地中海贫血无行之有效的治疗方法,给社会、家庭、个人带来了沉重的经济及精神负担。故有效检出地中海贫血患者、进行婚前孕前指导、产前诊断、避免地中海贫血患儿的出生,有着极其重要的社会意义 ...
成明
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Scanning of immune relevant genes from Pseudosciaena crocea and characterization of RPL10/QM-like gene from two sciaenoid fishes [PDF]
本研究以石首鱼科大黄鱼(Pseudosciaenacrocea)为研究对象,利用基因芯片和Real-time等技术筛选了大黄鱼免疫相关基因,研究了大黄鱼核糖体蛋白L10(RPL10/QM-like)基因及其表达产物,同时研究了大黄鱼亲缘种眼斑拟石首鱼(Sciaenopsocellatus)的RPL10/QM-like基因,研究结果充实了石首鱼类免疫学研究内容,也为鱼类的进化研究提供有价值的参考资料。主要结果如下: 1、 病原菌的鉴定 本研究从患病中华乌塘鳢中分离出两种病原菌,经过回归感染,再次分离 ...
陈心
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[Interferon-related gene array in predicting the efficacy of interferon therapy in chronic hepatitis B]. [PDF]
Wang J, Lu J, Zhou C, Du L, Tang H.
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