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Differential expression of microRNAs between LESCs and SESCs and pilot study of their functions [PDF]
, 2014 目的:通过基因芯片技术找出角膜上皮干细胞和皮肤上皮干细胞差异性表达的microRNAs并对其在增殖和分化方面的功能及作用机制进行初步的研究和探讨。 方法： 1. 运用克隆培养方法分别培养三组人角膜和皮肤上皮干细胞，进行microRNA基因芯片分析，找出有显著差异性表达的microRNA(p≤0.05差异倍数≥1.5)。 2. 对基因芯片分析出的差异性表达的microRNA进行荧光实时定量PCR，筛选出表达模式与芯片结果一致并且差异倍数较大的microRNA。 3.
杜慧怡
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基因芯片技术在分枝杆菌菌种鉴定和结核耐药性检测中的应用及评价
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2015 目的探讨基因芯片技术在结核病快速诊疗中的应用价值。方法对抗酸染色涂片阳性的肺结核患者痰标本同时进行基因芯片菌种鉴定和BACTEC MGIT 960培养,对结核阳性的样本分别用以上两种方法检测利福平和异烟肼的耐药性。以培养法为参考方法,评价基因芯片法菌种鉴定和耐药检测的敏感度、特异度和符合率。采用Kappa检验分析两种方法的一致性。结果 656例涂片阳性的患者中,两种方法各检出非结核分枝杆菌21例,符合率为100%。耐药性检测发现,基因芯片对利福平的敏感度为87.8%（86/98）,特异度为96.0 ...
李晓非 +4 more
doaj
Genome-Wide Detection of Tissue-Specific Genes & Database Construction [PDF]
, 2010 组织特异表达基因（Tissue-SpecificGene）是指在某一种或少数几种组织或细胞中特异表达的基因。研究组织特异表达基因有助于我们更好地理解组织和基因的关系，有助于我们找到疾病的发病原因，同时有助于我们发现新的组织特异的药物靶点。 目前已出现不少研究组织特异表达基因的方法，包括传统的实验方法、高通量实验方法以及生物信息学方法。在使用生物信息学方法研究组织特异表达基因领域，虽然已经有了组织特异表达基因的数据库，例如GEO，ArrayExpress，TiGER，BODYMAP ...
肖生建
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The Application of Multiple Classifier System to the Analysis of Microarray Datasets Based on Independent Component Analysis [PDF]
, 2011 基因微阵列技术是一种由物理学、微电子学与分子生物学几个领域综合交叉形成的高新技术，在生物学和医学研究中正受到越来越多的重视和应用。癌症基因微阵列数据分析使得在大规模基因水平上深入研究癌症的发生、扩散和转移等病理特征成为可能，并被公认为癌症研究与治疗的强大工具。然而，由于其高维小样本的特点，基于传统机器学习方法对基因微阵列数据进行研究分析难以取得好的结果。 由于集成学习系统能大幅度提高弱分类器的识别率，因而近年来，集成学习系统受到了研究者的广泛重视，并被应用于各种复杂数据的判别分析上 ...
黄丽冰
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Identification of hub genes and transcription factors involved in periodontitis on the basis of multiple microarray analysis. [PDF]
Hua Xi Kou Qiang Yi Xue Za Zhi, 2021 Zeng XL +6 more
europepmc +1 more source
Exomic somatic variation of esophageal squamous cell carcinoma [PDF]
, 2015 目的：食管鳞状细胞癌（esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC）是全球常见的致死性恶性肿瘤。为进一步探讨其分子机制，我们利用全基因组外显子测序技术寻找食管鳞癌中多发的突变，包括点突变、结构变异等，并且进一步鉴定食管鳞癌中多发的单核苷酸变异（Singlenucleotidevariation,SNV）。在体细胞水平探讨食管鳞癌发生发展的分子机制。 方法：1.通过外显子测序生成并收集数据库ESCC测序数据。2.128对食管鳞癌外显子测序数据采用新一代基因序列比对方法 ...
李慧莉
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2017 目的从基因和分子水平探讨头颈部鳞状细胞癌（head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC）的发生机制。方法从GEO数据库下载人HNSCC相关基因芯片数据,使用BRB-Array Tools软件筛选差异表达基因,采用DAVID、ToppGene、STRING、Cytoscape工具进行生物信息学分析。结果 BRB分析共筛选出263条差异表达基因,其中上调基因134个,下调基因共129个,对其进行生物信息学分析发现COL1A1、MMP9、COL1A2、COL3A1 ...
向琳 +4 more
doaj
Study of Ferric Uptake Regulator of Deep Sea Bacterium Shewanella piezotolerans WP3 [PDF]
, 2009 深海是一个特殊的生态环境，这里不仅低温、高压、黑暗、寡营养，而且氧气浓度也较低。深海特殊的生态环境造就了生活在该环境下生物的特异生理代谢特性，研究该生态系统下的微生物的生理特性，对于了解极端微生物的生活特性，极端微生物资源的开发利用具有重要的意义。 本文所研究的细菌ShewanellapiezotoleransWP3为一株分离自西太平洋1914米深海沉积物中的一株革兰氏阴性菌。WP3为一杆状的兼性厌氧菌，属于r-proteobacterium，具有55个编码细胞色素C的基因 ...
孙坪
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2012 【目的】 利用microRNA芯片技术分析比较两组不同复发倾向肝癌患者的miRNA表达谱,并在更大样品的基础上进行实验验证?【方法】收集10例原发性肝癌组织标本根据术后复发情况分2组:早期复发组与非早期复发组,运用microRNA芯片技术筛选出差异表达显著的microRNAs?结合文献报道,选择mir-144?mir-502-3p作为其他82例肝癌组织标本qReal-time PCR验证的检测指标?并利用生物信息学方法预测其靶基因?【结果】本研究共筛选获得7个差异表达的microRNAs ...
区应亮, 侯宝华, 简志祥
doaj
Molecular mechanism of the role of ROS signaling pathway in the antioxidant properties of TKE2 cells [PDF]
, 2016 目的:目前ROS在干细胞生物学中的作用还没有得到充分说明和了解。在过氧化氢（H2O2）诱导的氧化应激条件下，我们比较小鼠角膜上皮祖细胞（TKE2）[1]和成熟的小鼠角膜上皮细胞（MCE）的不同反应，重点研究是角膜干细胞的抗氧化细胞特性及相关机制。 方法:以小鼠角膜上皮祖细胞（TKE2）和成熟的小鼠角膜上皮细胞（MCE）为细胞模型，通过CCK8细胞活性实验检测不同浓度H2O2对小鼠角膜上皮的祖细胞（TKE2）和成熟的小鼠角膜上皮细胞（MCE）的影响。利用H2O2处理细胞24小时后 ...
葛连平
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