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随着后基因组时代(即功能基因组学)的到来,基因组学使得现代分子生物学从局部观走向整体观,从线性思维走向复杂思维,因此成为生命科学的研究热点,并在中医药领域得到广泛的应用。文章从基因组学在中医证候本质研究中的理论探讨、应用实例、存在问题及展望等方面进行了系统性的文献研究 ...
周昌乐, 许家佗, 齐真
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目的 建立组织芯片制备技术并观察在各种原位分析中的应用。方法 1 在传统病理学技术的基础上制备各种组织蜡块作为组织供体 ,再用组织阵列仪按照预先设计制作各种组织阵列蜡块 ,经切片和烤片后即成为各种组织芯片。 2 用各种组织芯片按照常规方法进行HE染色、免疫组化 (IHC)、原位杂交 (ISH)和原位PCR(IS PCR)实验分析。结果 (1)用本方法可分别制备低、中和高密度组织芯片 ,而且组织芯片排列整齐 ,外形美观 ,组织点大小一致且不易脱落。 (2 )HE染色结果均一 ,核浆对比明显 ...
李军 +5 more
doaj
Study of different classification models based-on microarray [PDF]
基因芯片技术的发展为生物信息学带来了机遇,使在基因表达水平上进行癌症诊断成为可能。但基因芯片数据高维小样本的特征也使传统机器学习方法面临挑战。本文利用真实的基因表达数据,测试了目前主要的分类方法和降维方法在癌症诊断方面的效果,通过实验对比发现:基于线性核函数的支持向量机可以有效地分类肿瘤与非肿瘤的基因表达,从而为癌症诊断提供借鉴。The development of microarray technology will bring opportunities to bioinformatics and ...
孙远帅, 江弋, 玄萍, 陈垚
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摘 要:【目的】 应用微矩阵基因芯片技术筛选结直肠癌甲基化基因?【方法】 分别提取6对结直肠癌组织和癌旁正常组织DNA,超声破碎及甲基化DNA富集后与甲基化芯片(NimbleGen human DNA Methylation 3 × 720K CpG)进行杂交,杂交信号经扫描等处理后采用生物信息学对检测结果进行分析?并对筛选出来的基因进行验证?【结果】 一共发现有2 296个高甲基化基因,其中有293个基因无文献报道?生物信息学分析显示,所有的甲基化基因随机分布在24对染色体上?聚类分析结果显示 ...
doaj
目的 DNA损伤修复基因在维持细胞稳定性的作用及头颈肿瘤表现染色体不稳定性研究。方法应用基因表达芯片在7例头颈肿瘤和6例正常口腔粘膜中筛查表达下调的基因,用实时定量RT-PCR证实基因芯片的结果,蛋白印迹检测蛋白表达,定量PCR检测其DNA拷贝数。结果 Hrad17是发现下调的基因之一,Z-score和倍数变化分别为-2.5和0.39,定量RT-PCR显示肿瘤组织中Hrad17 mRNA表达下降,均值为0.216 6,而正常粘膜为0.395 7 ...
赵明 +4 more
doaj
Functional Characterization of AtST39 in Stress Response and AtMPA Mediating Pollen Development [PDF]
基因芯片显示番茄细菌性叶斑病原菌Pseudomonassyringaepv.tomatoDC3000(PstDC3000),干旱、冷和盐等逆境处理及在开花关键基因lfy突变体中都能够上调AtST39(At3g46110)基因表达;AtMPA(At1g05577)在拟南芥单核花粉粒向三核花粉发育的过程中特异性表达。但是AtST39参与胁迫和AtMPA在介导花粉发育的分子机制知之甚少。我们主要对AtST39进行了探索研究,结果如下: (1)NCBI数据库显示YWC基因家族共有185个蛋白家族成员 ...
肖世民
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摘 要: 【目的】 分析圆头精子症患者的遗传学发病机制。 【方法】 回顾分析1例圆头精子症患者,对其进行多种遗传学方法的检测,包括染色体检查、Y染色体微缺失基因检测及通过array-CGH芯片技术和Sanger测序筛查候选基因DPY19L2、PICK1、SPATA16。 【结果】 该患者在我中心行两个卵胞浆内单精子显微注射(ICSI)周期后,其妻孕足月剖宫产一对异卵双胞胎女儿。患者染色体核型为46,XY、Y染色体微缺失基因检测未见异常,array-CGH芯片检测排除了DPY19L2 ...
doaj
MiR-192/-215靶向BIVM基因调控胃癌细胞生物学功能
: 【目的】研究miR-192/-215通过靶基因BIVM调控人胃癌发生发展的机制。【方法】首先利用靶基因 预测网站、基因芯片、实时荧光定量PCR技术筛选出miR-192/-215的靶基因BIVM,然后构建双荧光素酶报告 质粒,验证BIVM为miR-192/-215靶基因。随后通过转染BIVM-siRNA干扰BIVM表达后,检测其对胃癌细胞增 殖、凋亡的作用。8只裸鼠随机分为BIVM-siRNA实验组和NSC-siRNA对照组,将转染BIVM-siRNA的胃癌细胞 种植于裸鼠皮下 ...
林慧娟 +5 more
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本文提出在金基底上用阳离子聚电解质———聚二烯丙基二甲基胺氯化物 (poly(dial lyldimethylammoniumchloride) ,PDDA)自组装膜固定长链DNA的方法 ,用DiffuseReflectanceIn frared ,XPS和STM技术进行表征 ...
包烨 +7 more
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PRKCI基因在急性心肌梗死患者外周血白细胞中低表达及其临床意义
心肌梗死的发病率越来越高,且有年轻化的趋势。全基因组关联研究发现,基因的碱基突变可能是导致急性心肌梗死发生的原因之一[1-5]。课题组基因芯片研究发现,有559个基因在急性心肌梗死患者中的表达发生改变[6]。其中,PRKCI基因为显著低表达,P=0.003517699,LogFC=-1.563554087 ...
范琳, 孟赫禹, 孟繁波
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