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[Lipid metabolomics-based biomarker analysis of neonatal sepsis in serum and cerebrospinal fluid]. [PDF]
Se Pu新生儿败血症是导致新生儿发病和死亡的主要原因，但目前缺乏敏感、特异的早期生物标志物，尤其是关于脑脊液（CSF）脂质代谢的系统研究仍较有限。本研究纳入17例血培养阳性的败血症新生儿及其同期阴性对照，采用液相色谱-质谱联用技术对其血清与CSF样本进行靶向脂质组学分析。首先通过单变量和多变量分析筛选差异代谢物，然后进行通路富集分析。进一步结合Boruta算法与受试者工作特征（ROC）曲线分析，筛选并评估潜在诊断标志物的效能。结果显示，败血症组血清中除甘油三酯（TAG）和二酰基甘油（DAG）外 ...
Wu WX +5 more
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[Identification and Underlying Mechanisms of Immune Cell- and Senescence-Related Biomarkers in Atrial Fibrillation]. [PDF]
Sichuan Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban目的 探讨免疫细胞（immune cells, ICs）与衰老相关生物标志物在心房颤动（atrial fibrillation, AF）中的分子机制。 方法 本研究通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）在GSE2240数据集获得免疫细胞相关基因（immune cell-related genes, ICRGs）。随后，将ICRGs、衰老相关基因（senescence-related genes, SRGs）和通过AF组与窦性心律（sinus rhythm, SR）组差异表达分析得到的差异表达基因 ...
Huang W, Liu E, Fu H.
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[Single-cell transcriptomic analysis reveals immune dysregula-tion and macrophage reprogramming in diabetic foot ulcers]. [PDF]
Zhejiang Da Xue Xue Bao Yi Xue Ban目的 阐明糖尿病足溃疡（DFU）皮肤组织中巨噬细胞介导的炎症和组织损伤机制。 方法 收集DFU患者和非DFU者的皮肤组织标本，通过单细胞RNA测序获得79 272个高质量细胞转录组数据。采用无偏聚类方法识别细胞亚群，通过Seurat函数筛选DFU组与非DFU组间的差异表达基因，基因本体（GO）富集分析揭示基因功能，构建细胞间通信网络并进行配体-受体互作分析，从多维度揭示DFU微环境中细胞互作及信号调控机制。 结果 DFU皮肤组织中髓系细胞显著扩增，而内皮细胞、上皮细胞和平滑肌细胞等结构细胞显著减少 ...
Huang C +5 more
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Se pu = Chinese journal of chromatography, 2022 基于在碱性环境下硼酸能与顺式二醇化合物可逆共价结合形成稳定的五元或六元环酯,而在酸性环境下环酯开环释放顺式二醇化合物这一特性,设计合成高效、高选择性、高富集性能的硼亲和材料的研究备受关注。近年来,许多研究工作者合成了各种类型的硼亲和材料,应用于高选择性富集顺式二醇化合物。金属有机骨架(MOFs)和共价有机骨架(COFs)由于具有孔径可调、高孔隙率、高比表面积、骨架结构可调和化学及热稳定性良好等特点,被广泛应用于色谱分离和样品前处理领域。为赋予MOFs和COFs材料对顺式二醇化合物的富集选择性 ...
An Zhang, Juan Zhang
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基于串联质量标记的帕金森病血浆及血浆外泌体定量蛋白质组学分析
Se pu = Chinese journal of chromatography, 2023 外泌体是一类可由各种细胞在生理和病理条件下释放的细胞外囊泡,其携带了多种生物活性分子,是疾病标志物的良好载体。目前,帕金森病(Parkinson’s disease, PD)的诊断主要依靠临床表现,缺乏客观的疾病诊断标志物。因此,新型外周血特异性标志物的开发将有助于PD的早期筛查与诊疗。在本研究中,选取PD患者与正常对照人群的血浆及血浆外泌体作为研究对象,采用基于串联质量标记(tandem mass tag, TMT)的液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术对其进行定量蛋白质组学分析 ...
Yuan-Yu Zhao +5 more
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Se pu = Chinese journal of chromatography, 2023 真菌毒素是真菌产生的一类有毒的次级代谢产物,对人体具有致癌、致畸、致突变等严重危害,已引起世界范围的广泛关注。因此,建立准确、快速、灵敏的真菌毒素检测方法具有非常重要的意义。色谱法是常用的检测真菌毒素的方法,但由于真菌毒素种类繁多,分布范围广泛,样品基质复杂,且各类真菌毒素在实际样品中含量极低,难以对其进行直接分析。因此,发展适宜的样品前处理方法,并用于真菌毒素的高效分离富集是必不可少的步骤。近年来,以金属有机框架(MOF)、共价有机框架(COF)为代表的多孔有机框架材料因具有大的比表面积、高的孔隙率 ...
Wei Liu +4 more
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Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences, 2023 目的 探究转化生长因子-β1（TGF-β1）诱导肾纤维化的机制。 方法 将TGF-β1处理和未处理的肾成纤维细胞NRK-49F进行转录组测序，采用DESeq2分析测序结果，以错误发现率低于0.05且log2FC绝对值大于1为标准筛选差异表达的基因，并对差异表达的基因进行基因本体（GO）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。进一步筛选差异表达基因中编码转录因子的基因 ...
Hua'nan Li +6 more
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基于SiO2@Fe3O4的磁性纳米材料分离富集谷物中痕量黄曲霉毒素B1
Se pu = Chinese journal of chromatography, 2022 将SiO2包覆的Fe3O4磁性纳米材料(SiO2@Fe3O4)表面偶联识别黄曲霉毒素B1(AFB1)的抗体(Ab),用于特异性分离富集谷物中的AFB1,进而与高效液相色谱-串联质谱法(HPLC-MS/MS)结合,用于大米、玉米和小麦中AFB1的高效准确检测。采用微波辅助水热合成法制备得到Fe3O4磁性纳米颗粒,并用100 μL正硅酸乙酯(TEOS)对其进行SiO2的包覆,得到SiO2@Fe3O4磁性纳米材料,随后进行抗体的偶联得到Ab-SiO2@Fe3O4;以pH=7.4的磷酸盐缓冲液(PBS ...
Xiaohan Li +7 more
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基于超高效液相色谱-串联质谱的股骨头坏死组织外泌体脂质代谢组学分析
Se pu = Chinese journal of chromatography, 2022 股骨头坏死(ONFH)是一种可导致股骨头塌陷进而需要接受全髋关节置换的疾病。外泌体作为一种细胞间交流的方式,在一系列生理和病理过程中起着至关重要的作用,已在疾病的诊断和治疗中发挥独特作用。该研究利用非靶向代谢组学方法,探讨股骨头坏死组织外泌体内的脂质代谢特征,阐释股骨头坏死时机体发生的脂质代谢变化。该研究采用超速离心的方法,对股骨头坏死组织的外泌体进行了分离富集,并使用动态光散射(DLS)、蛋白质免疫印迹和透射电子显微镜(TEM)3种方法鉴定外泌体。采用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS ...
Minkang Guo, Jian Zhang
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Se pu = Chinese journal of chromatography, 2022 苯丙酮尿症等代谢病患者因基因缺陷无法正常代谢食物中的芳香族氨基酸(aromatic amino acids, AAA),常规饮食可能会造成永久性生理损伤,低AAA肽是其重要的蛋白质等同物来源。AAA分离分析技术对低AAA肽的制备和检测至关重要。该领域研究者探索了多种高效的吸附、分离材料,从复杂的蛋白质水解液中选择性吸附脱除AAA以制备符合特定氨基酸限量的低AAA肽类食品,或者建立对AAA特异性提取富集的分离分析策略。该文分析了AAA的结构特点与理化性质,总结了近年来基于活性炭 ...
Chen-wei Lu +4 more
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