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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban目的探究低氧暴露对小鼠脾脏组织碳代谢通路的调控机制。方法将C57BL/6小鼠分别在海拔400 m和4 200 m饲养，每组5只，30 d后无菌取出脾脏组织，通过转录组测序，蛋白质组学和非靶向代谢组学分析差异表达基因、差异蛋白以及差异代谢物，利用GO和KEGG富集分析，挖掘关键通路，并通过RT-qPCR和Western blot对通路中关键基因和蛋白进行验证。结果转录组测序发现，低氧暴露下有4 213个基因出现显著性差异表达，其中1 947个基因表达上调，2 266个基因表达下调 ...
陈晓晨 +5 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2017 目的探讨构建杠柳毒苷体外抑制胃癌细胞系SGC-7901细胞增殖能力的分子共调控网络,为解析杠柳毒苷抗肿瘤作用的分子机制提供理论支撑。方法本研究收集美国GEO公开数据库中已收录的所有杠柳毒苷处理胃癌SGC-7901细胞系前后的基因表达谱数据;通过差异表达分析获得经过杠柳毒苷处理后胃癌SGC-7901细胞系表达水平发生显著性改变的基因;通过GO基因功能注释以及KEGG代谢通路富集分析,探究杠柳毒苷作用后表达水平发生显著性改变基因的功能;最后结合TRED数据库中收录的人类转录因子信息,构建分子共调控网络 ...
王炬玮, 臧文远, 刁凯, 刘海燕
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Differential analysis of mRNA expression of neurological damage caused by heat stroke in rats based on GEO database [PDF]
, 2023 WANG Lei
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Zhongguo shiyan zhenduanxue目的探讨七氟烷吸入全身麻醉对高血压患者术前术后血清代谢组学的影响，通过识别差异代谢物并进行KEGG通路富集分析，以揭示七氟烷吸入麻醉在围术期对患者可能产生的潜在效应。方法本研究共纳入了15例拟行全身麻醉下行全髋关节置换的受试者，分别于术前术后1 h采集外周静脉血，共制备30例血清样本。采用气相色谱-质谱代谢组学法检测血清代谢物，使用R语言包对检测数据进行主成分分析（PCA）、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)，设置阈值为P<0.05和VIP值> ...
沈吉喆, 黄立政, 韩方雷, 陈曦
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Shuitu Baochi Xuebao, 2011 通过田间试验与室内分析相结合的方法研究长期不同施肥处理下土壤颗粒组成及其有效磷富集。结果表明,各施肥处理土壤颗粒组成都呈现颗粒愈小比例愈高的规律,而不同施肥处理对同一粒径颗粒含量又有一定的影响。在单施磷肥(P)的基础上,配施氮肥、有机肥(NP、PM、NPM ...
陈璐, 党廷辉, 杨绍琼, 戚瑞生
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Zhongguo shiyan zhenduanxue目的本研究采用LIMMA算法筛选糖尿病肾病中差异表达基因（DEGs），并通过蛋白质互作网络（PPI）进一步确定其中的关键基因，以揭示糖尿病肾病潜在的关键靶点。方法基于GEO数据库及R软件包“LIMMA”对糖尿病肾病进行差异表达基因的筛选，并对DEGs进行KEGG及GO富集分析。蛋白质互作网络（PPI）的构建通过STRING数据库完成，并经Cytoscape中CytoNCA算法确定Hub基因，同时对筛选出的Hub基因进行诊断性能评估。结果通过3个GEO数据集筛选出24个DEGs（logFC>1, P&
黄卓彦 +3 more
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[Screening of differentially expressed genes in gastric cancer based on GEO database and function and pathway enrichment analysis]. [PDF]
Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue BaoLiang Y +6 more
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[Proteomics analysis of the effect and mechanism of ADSCs on full-thickness skin defects in diabetic rats]. [PDF]
Zhonghua Shao Shang Yu Chuang Mian Xiu Fu Za ZhiGu Y, Chen YZ, Wang SY, Song HY, Bai N.
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[Metabolomic alterations in preterm infants with bronchopulmonary dysplasia]. [PDF]
Zhongguo Dang Dai Er Ke Za ZhiWu YY +10 more
europepmc +1 more source
[Single-cell RNA sequencing of B cells reveals molecular typing in Sjögren syndrome]. [PDF]
Beijing Da Xue Xue Bao Yi Xue BanLin W +6 more
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