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基于生物信息学探讨合并心力衰竭的扩张型心肌病靶基因的预测 [PDF]
, 2020 【目的】为了研究合并心力衰竭的扩张型心肌病发生发展相关的差异基因与调控信号通路，利用生物信息学方法探讨了基因表达汇编（GEO）中的基因芯片和人类基因和遗传疾病的在线目录（OMIM）中扩张型心肌病相关基因。【方法】本研究选择了由德国波鸿大学Herz-&DiabeteszentrumNRW实验室利用临床病例心肌活检标本在GPL570平台进行测序并上传至GEO公共数据库的两张芯片基因集：GSE29819和GSE21610。将合并心力衰竭的扩张型心肌病和正常心脏功能的心肌活检标本分别作为实验组 ...
关畅 +6 more
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Conservation benefits of a large marine protected area network that spans multiple ecosystems
Conservation Biology, Volume 39, Issue 4, August 2025.Abstract Marine protected areas (MPAs) are widely implemented tools for long‐term ocean conservation and resource management. Assessments of MPA performance have largely focused on specific ecosystems individually and have rarely evaluated performance across multiple ecosystems either in an individual MPA or across an MPA network.
Joshua G. Smith +23 more
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肾透明细胞癌Caki-1细胞系差异表达基因的生物信息学分析 [PDF]
, 2018 目的比较肾透明细胞癌Caki-1细胞系与正常肾上皮细胞系ASE-5063中的差异表达基因(DEGs),寻找潜在的肾透明细胞癌特异性分子标志物。方法利用GEO数据库自带的GEO2R在线分析工具分析基因芯片GSE78179,将筛选出的DEGs分别导入Metascape、STRING以及Cytoscape进行综合分析并筛选出核心基因。最后使用Fun Rich等软件对筛选出的核心基因进行GO和KEGG富集分析。结果共筛选出562个DEGs,其中上调基因345个,下调基因217个 ...
朱合欢 +5 more
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Integrative Conservation, Volume 4, Issue 2, Page 246-253, June 2025.After the great Chinese poet Qu Yuan (屈原) was exiled to Xupu (溆浦) county in Hu' nan province, he described the forest there as follows: “mysterious is the deep forest, the place where Yuán yòu dwell (深林杳以冥冥兮,乃猿狖之所居).” What is the referent of the name Yuán yòu in this sentence?
Kefeng Niu
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2022 目的 非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌死亡的最主要原因，本研究通过获取NSCLC组织和正常组织的mRNA和microRNA表达数据集，分析影响NSCLC预后的基因及其可能的致癌机制。方法 从GEO数据库中获取5个mRNA数据集和1个miRNA数据集，利用limma软件包从mRNA数据集中筛选差异表达基因（DEGs），进一步利用ClueGO插件分析其通路富集信息，并利用GEPIA软件分析DEGs与肿瘤分期和预后的相关性。然后通过ENCORI、GENEMANIA和STRING数据库预测相互作用的miRNA ...
孙珊珊, 冯虎, 毕莎杉
doaj
Morphological Observation and Transcriptome Analysis During True-vivipary Development in Mangrove Kandelia obovata [PDF]
, 2017 植物界中的胎生现象是指有性生殖产生的后代在母体上不经休眠或短暂休眠即萌发，以潮间带红树植物最为显著。虽然在形态结构、生理生化、生态适应等水平对红树植物的胎生现象已有所研究，但其涉及的分子机制仍未被阐明。本论文以我国广泛分布并具有重要生态学价值的显胎生红树代表物种秋茄(Kandeliaobovata)为研究材料，对从胚珠受精到胚轴掉落的一系列发育过程进行形态观察，确定具有转变性意义的阶段及组织，并对其中7个关键组织(受精后的胚胎、胚胎突出种皮前后的子叶及下胚轴 ...
周晓旋
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Functional Ecology, Volume 39, Issue 5, Page 1274-1287, May 2025.Read the free Plain Language Summary for this article on the Journal blog. Abstract Interactions between plants and soil microorganisms in the rhizosphere are vital for maintaining the nutrient cycle and stability of terrestrial ecosystems. Nitrogen, closely related to carbon (C) cycling and ecosystem productivity, undergoes transformation by soil ...
Ru Wang +9 more
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Shuitu Baochi Xuebao, 2007 以南湖水体中的水、表层沉积物、生物膜和悬浮物为研究对象,对美国EPA规定的16种优控PAHs中13种PAHs的分布与富集特征进行了研究。结果表明,表层沉积物中检出12种PAHs,生物膜和水相中均检出11种PAHs,而悬浮物中只检出7种PAHs;生物膜和悬浮物富集PAHs的能力相近,比表层沉积物的富集能力大一个数量级;相关分析表明,生物膜和悬浮物富集PAHs的能力归因于其有机质（TOC）的含量高于表层沉积物中有机质的含量。根据菲/蒽比值和PAHs环数相对丰度对南湖表层沉积物中PAHs的来源进行了分析 ...
王晓丽 +5 more
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基于多数据集分析骨髓增生异常综合征相关的原发性免疫缺陷核心基因
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2023 目的 利用生物信息学方法探索骨髓增生异常综合征(MDS)发生发展机制，为筛选早期MDS辅助诊断指标提供理论依据。方法 选择来源于Gene Expression Omnibus数据库的人类MDS基因芯片或高通量转录组测序数据，利用R语言及相关包对数据集进行差异表达分析，采用STRING结合CytoHubba分析差异表达基因互作网络关系，并获取degree值前10的核心基因；利用GSEA对数据集进行通路富集，从而获取与显著富集通路相关的核心基因并评价其诊断效能。结果 本研究以正常组为对照 ...
连晓强, 张稳, 张栋栋, 穆红
doaj
Allelic Imbalance in Four Tumor Types [PDF]
, 2017 肿瘤是人最主要的致死性疾病，其发生发展过程中均伴随着大量的基因组改变。当同源染色体片段相对于另一条同源染色体的拷贝数增加或减少时，伴随着一个现象的发生，等位基因不平衡。如果被扩增的同源染色体的片段携带着比另一条同源染色体更有利于肿瘤生长的遗传变异位点，则此片段在肿瘤细胞生长过程中有选择性优势。高通量测序技术的快速应用与精准医疗研究的快速发展，产生了海量基因组学数据，现在我们可以较容易且准确的获得整个基因组的完整信息。本研究从一个独特的视角来探究四种高发肿瘤（乳腺腺癌、结直肠腺癌、肺腺癌和前列腺癌 ...
曾园媛
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