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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2021 目的筛选缺血性脑卒中的关键基因及重要信号通路，预测可能对脑卒中有用的药物。方法从GEO数据库下载GSE98319基因芯片数据，该数据包含了假手术组、大脑中动脉梗塞组（MCAO）小鼠的基因芯片检测结果。用R语言的Limma包对数据进行差异表达分析，P<0.05且|log2FC|>0.6的基因为差异表达基因。借助STRING网站构建差异表达基因的蛋白质相互作用网络（PPIN）后由Cytoscape软件进行核心子网络筛选及可视化输出。筛选出核心基因后用实时荧光定量PCR（qRT- PCR ...
于瑜, 王钟兴
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Study on the effect and mechanism of sorting nexin 1 on inhibiting the proliferation and migration of colorectal cancer cells [PDF]
Objective·To explore the expression of sorting nexin 1 (SNX1) in colorectal cancer (CRC) and its impact on the proliferation and migration of CRC cells.Methods·Transcriptomic data and clinical pathological information of CRC were obtained from The Cancer
LI Shuxin +4 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue目的基于4D Lable-free蛋白质组学技术分析富氢水干预对老年性聋小鼠耳蜗差异蛋白表达的影响，探索其作用机制。方法20只雄性C57BL/6J小鼠随机分为5组（n=4）：年轻组、自然衰老组、诱导衰老组、自然衰老富氢水治疗组、诱导衰老富氢水治疗组。检测5组实验小鼠的听觉脑干反应（ABR）听力阈值，取耳蜗组织进行蛋白组学分析，包括差异蛋白筛选、基因本体（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果共鉴定到3 925个差异表达蛋白。年轻组与自然衰老组差异表达蛋白共有559个（上调蛋白400个，
于书剑, 汪欣, 于红
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2018 【目的】采用生物信息学方法探究肝细胞癌（HCC）发生的关键基因，望有助于了解HCC发生发展的分子机制。【方法】从GEO数据库中选择基因表达谱GSE76427，该数据集包含115例肝癌组织样本和52例肝癌临近非肿瘤组织样本。通过GEO2R工具在线分析，筛选出肝癌组织中差异表达基因（DEG），利用GO数据库获取DEG的功能注释，利用KEGG数据库进行通路富集分析。基于STRING数据库，利用MCC算法，筛选具有高度连接性的关键基因,基于TCGA数据库在线软件分析关键基因的预后效应。【结果 ...
曾洁, 邓伟, 黄天壬
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[Prognostic implications and functional enrichment analysis of LTB4R in patients with acute myeloid leukemia]. [PDF]
Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao, 2022 Zhang X +6 more
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基于蛋白质组学技术探讨7-羟乙基白杨素防治高原脑水肿的作用靶点
浙江大学学报. 医学版目的 研究7-羟乙基白杨素（7-HEC）治疗大鼠高原脑水肿的作用靶点及机制。 方法 54只雄性Wistar大鼠随机分为正常对照组、模型对照组和7-HEC组，每组18只。后两组于实验第4天置于模拟7000
张 冬梅 +5 more
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基于生物信息学途径评估 UBE2 家族及 UBE2T 基因在肺腺癌中的表达及临床意义 [PDF]
, 2020 【目的】探究泛素结合酶E2家族和泛素结合酶E2T（UBE2T）在肺腺癌中的表达情况及其与临床病理特征之间的关系。【方法】利用linkedomics平台进行UBE2C、UBE2M、UBE2S、UBE2T、UBE2V2 mRNA表达水平与肺腺癌临床特征之间的关系分析，对总生存时间（OS）（Cox回归检验）、总分期（Kruskal-WallisH检验）、T分期（Kruskal-WallisH检验）、N分期（Kruskal-WallisH检验）及M分期（Wilcox秩和检验）进行差异比较。运用肿瘤基因组图谱 ...
杨豪帅 +3 more
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Establishment of a prognostic risk scoring model for patients with pancreatic ductal adenocarcinoma based on cell ferroptosis-related genes and its application value [PDF]
Objective To establish a prognostic risk scoring model for patients with pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) based on cell ferroptosis-related genes, and to investigate its application value.
QING Gong, JING Xue, JIANG Yueping
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Screening of endoplasmic reticulum stress characteristic genes and immune infiltration manifestations in chronic obstructive pulmonary disease [PDF]
Objective To identify the core genes of endoplasmic reticulum stress (ERS) in chronic obstructive pulmonary disease (COPD) using the bioinformatics, various machine learning algorithms and experimental validation.
HE Zhiyi, LUO Chenyang, ZHANG Shuang
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Shuitu Baochi Xuebao, 2020 选取南方典型母质发育耕作土紫泥田和麻砂泥，通过添加不同浓度梯度的外源Cd （0，0.5，2.0，10.0，20.0 mg/kg）进行盆栽试验，并结合傅里叶红外与X射线衍射等手段，研究了象草在土壤Cd胁迫下的耐受能力及修复效果。结果表明：紫泥田与麻砂泥中象草对Cd的耐性指数为0.65~0.79，均表现出较好的耐性；外源Cd浓度为0，0.5，2.0 mg/kg时象草富集系数均大于1，表现出较好的Cd富集性；象草转运系数为0.60~0.84，属于非Cd超富集植物，但因地上部分生物量巨大 ...
覃建军 +6 more
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