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IVF-ET患者HLA-DQB*0301基因rs6928482、rs1056315和-A*3101rs1061235单核苷酸多态性研究
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2020 目的从分子水平探讨HLA-DQB*0301等位基因在体外受精-胚胎移植(IVF-ET)患者不同妊娠结局中的表达差异。方法采用竞争性等位基因特异性PCR(KASP)对330例行IVF-ET手术的不孕症患者HLA-DQB*0301等位基因rs6928482、rs1056315以及HLA-A*3101rs1061235单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)进行了分析,其中妊娠成功组120例,妊娠失败组210例。结果 rs1056315基因型分布不符合Hardy
王惠莹 +4 more
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基于多数据集分析骨髓增生异常综合征相关的原发性免疫缺陷核心基因
Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2023 目的 利用生物信息学方法探索骨髓增生异常综合征(MDS)发生发展机制，为筛选早期MDS辅助诊断指标提供理论依据。方法 选择来源于Gene Expression Omnibus数据库的人类MDS基因芯片或高通量转录组测序数据，利用R语言及相关包对数据集进行差异表达分析，采用STRING结合CytoHubba分析差异表达基因互作网络关系，并获取degree值前10的核心基因；利用GSEA对数据集进行通路富集，从而获取与显著富集通路相关的核心基因并评价其诊断效能。结果 本研究以正常组为对照 ...
连晓强, 张稳, 张栋栋, 穆红
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2012 [摘 要] 目的：用全基因表达谱芯片技术筛选小鼠胚胎干细胞（ESC）定向分化为表皮样细胞(Epidermal-like cells, ELC)的差异表达的基因并对其进行分析，以进一步阐明ESC分化为ELC的分子机制。方法：利用人羊膜建立体外诱导体系，将小鼠ESC诱导定向分化为ELC，做3次生物学重复，分别取未分化的ESC和诱导分化的ELC提取总RNA进行扩增、Cy3标记，与NimbleGen 135k 小鼠全基因表达谱芯片（含44170个基因）杂交，荧光扫描，筛选出差异表达基因 ...
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2013 目的观察干细胞标志物Nanog基因在肺癌组织与癌旁组织中的表达情况,明确其在肺癌诊断中的作用。方法选择2011年1月至2013年7月在我院诊治且临床被诊断为肺癌的患者作为研究对象,分为肺腺癌（A组）和肺鳞癌（B组）。取患者癌组织与癌旁组织,以实时定量RT-PCR反应检测两组患者干细胞标志物Nanog基因的表达水平,并比较不同分化程度下各组织中Nanog基因的表达量。结果肺腺癌与肺鳞癌患者各年龄段的发病率大致相等,两组患者在性别、疾病分期及有无淋巴结转移方面无显著差异（P>0.05）;与I期、II期相比 ...
张洪彬, 张满娥
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2008 目的系统探讨水通道AQP4敲除鼠先天性脑积水大脑基因表达差异。方法利用小鼠基因表达谱芯片对水通道AQP4敲除鼠先天性脑积水大脑基因表达水平进行检测分析。结果超过100个基因的表达水平发生显著改变,其中有超过63个基因表达明显上调,超过37个基因表达显著下降。结论这些基因表达水平的改变可能与先天性脑积水的形成密切相关,深入研究相关基因可能发现先天性脑积水形成的新机制。
宗敏茹, 何成彦, 冯学超
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野生动物学报为探究低、中、高3个不同海拔梯度下喜马拉雅旱獭（Marmota himalayana）基因表达是否存在差异，筛选该物种与高原低氧及强紫外辐射环境适应的相关候选基因，采用Illumina HiSeq 2500高通量测序平台对喜马拉雅旱獭肝脏组织进行无参转录组学分析，通过对质控后测序数据与参考基因组的比较分析，筛选差异表达基因后进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果显示：乐都样品（低海拔组，LD）、玉树样品（高海拔组，YS）喜马拉雅旱獭肝脏组织中差异表达基因差异较大，刚察样品（中海拔组，GC ...
赵坤钰, 李优, 南新营, 李耀东
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2010 目的筛查宫颈癌组织中差异表达蛋白,探讨survivin基因与宫颈癌发生发展的关系。方法利用蛋白阵列方法分析宫颈癌组织与正常宫颈组织中蛋白表达的差异;将体外培养的宫颈癌Hela细胞分为对照组、空质粒组和实验组,转染survivin siRNA表达载体后,利用半定量RT-PCR和Western blotting方法检测各组细胞survivin基因的转录及蛋白表达情况;MTT法检测各组细胞的增殖能力;流式细胞术检测细胞周期和凋亡情况。结果正常宫颈组织与宫颈癌组织间有25种蛋白的表达存在明显差异 ...
徐红梅 +5 more
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2006 目的检测PTEN基因在胃癌组织中的表达,并研究其临床病理意义。方法采用逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）法检测PTEN在40例胃癌中的表达。结果①PTNM分期Ⅰ、Ⅱ期胃癌与对照组正常胃黏膜组织PTEN的表达有显著性差异 ...
赵刚, 王权, 赵光程
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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2007 目的用生物信息学分析新基因TSC21并进行蛋白表达及纯化。方法将不同发育阶段的小鼠睾丸组织cDNA探针与Affymetrix全基因组芯片进行杂交并筛选出差异表达的基因。用生物学信息软件对该基因进行生物学信息分析。运用RT-PCR分析该基因小鼠不同组织及人不同组织中的表达。对人的TSC21基因进行cDNA克隆、蛋白表达及纯化。结果通过不同日龄小鼠睾丸的芯片信号比较筛选出一个差异表达基因（GenBank登录号:NM-028825）,全长有810bp,含有543bp的完整ORF,编码一个有180个氨基酸 ...
余振东 +6 more
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2007 【目的】基因芯片技术建立颅内动脉瘤患者血液单核细胞基因表达谱,筛选与信号传导相关的基因表达情况。【方法】50例颅内动脉瘤患者外周血,10例正常成人作为对照组,分离血液单核细胞,提取总RNA,与含22215个人类基因的Affymetrix寡核苷酸基因芯片杂交、洗脱、染色和扫描,分析检测的数据。荧光定量RT-PCR验证芯片结果。【结果】检测的22215个基因中,颅内动脉瘤共差异表达的基因有325个,差异水平均达2倍以上的基因有35个,生物信息学分析发现信号传导相关基因有7个,其中上调基因5个,下调基因2个。【
石忠松 +6 more
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