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Effects of Simulated Acid Rain on Some Physiological Characteristics and Gene Expression Profiles of Arabidopsis thaliana [PDF]

open access: yes, 2009
酸雨是世界性的环境污染问题之一,它可导致环境酸化,影响植物的正常生长和发育。本文以模式植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)为材料,对其进行模拟酸雨处理,研究了其在酸雨处理下某些生理指标的变化,并利用基因芯片技术检测了酸雨对拟南芥基因表达谱的影响,为后续耐酸相关基因的克隆和抗酸性新品种的培育提供良好的基础。 本文采用pH2.5、3.0、4.0、5.6(对照)的模拟酸雨喷洒处理野生型拟南芥(WT)和钙受体蛋白CAS反义植株(CASas),探讨了不同pH值模拟酸雨对两种拟南芥材料叶片伤害 ...
牛力
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Effects of exogenous IBA on antioxidant property and IAA biosynthesis pathway in cuttings of Ficus carica [PDF]

open access: yes
[Objective] Exploring the effects of suitable concentrations of indole butyric acid (IBA) on rooting and sprouting as well as on antioxidant property and gene expression related to growth hormone biosynthesis pathway of fig(Ficus carica L.) cuttings ...
Bahayiding Wufue   +4 more
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C14orf48基因在人精液精子中的表达和生物信息学分析

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2011
目的筛选与弱精子症发生相关的基因。方法采集正常男性和弱精患者精液精子,非连续梯度离心法分离纯化精子,收集95%percoll以下和57%与76%Percoll层之间的精子,以排除生精细胞和白细胞的污染。将纯化后精子的cDNA探针与Affymetrix全基因组芯片杂交。筛选出差异表达的基因,利用生物信息学方法对该基因进行分析。用RT-PCR验证该基因在正常男性和弱精患者精液精子中的差异表达,并用RT-PCR方法分析该基因在人不同组织(心、肝、脾、肺、肾、胃、脑、睾丸)中的表达。结果分析芯片杂交结果 ...
李如凯, 郭龙华
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空肠弯曲杆菌诱导的结直肠癌的转录组学分析

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2022
目的探究空肠弯曲杆菌(C. jejuni)的致癌机制。方法将18只雌性的C57BL/6 ApcMin/+小鼠随机分为C. jejuni感染组9只和空白对照组9只。采用灌胃C. jejuni和葡聚糖硫酸盐共同诱导ApcMin/+小鼠产生结直肠癌。实验终点时,取各组小鼠结直肠组织解剖计数肿瘤个数,分别提取C.
李燕, 毛玉丹, 张幸鼎, 牟相宇
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Effects of 1-MCP on the genes related to wax anabolism in pear peel based on transcriptomics [PDF]

open access: yes
[Objective] According to the investigation and laboratory research of our study group for several years, it has been found that the main pear cultivar Yuluxiang was easy to become greasy in the early stage of shelf life at room temperature, and also in ...
JIA Xiaohui   +4 more
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基因表达谱芯片筛选奥沙利铂作用后的人结肠癌细胞凋亡基因的研究

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2005
目的研究奥沙利铂作用于人结肠癌细胞系Sw1116后,诱导细胞基因表达发生差异,阐明奥沙利铂诱导肿瘤细胞凋亡的基因机制。方法用奥沙利铂(40μg/ml)处理人结肠癌细胞系Sw111612hrs,通过透射电子显微镜观察肿瘤细胞的凋亡形态学改变,通过基因表达谱芯片检测药物作用后的基因表达差异。结果经奥沙利铂作用Sw1116细胞,表现典型的凋亡形态学改变,细胞表面质膜突起消失,核固缩成团块状,染色质浓缩,沿核膜排列,线粒体基质肿胀,空泡形成,有凋亡小体形成;共有722条基因发生了差异表达 ...
田素礼   +5 more
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高原低氧环境抑制小鼠脾脏组织碳代谢的分子机制

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban
目的探究低氧暴露对小鼠脾脏组织碳代谢通路的调控机制。方法将C57BL/6小鼠分别在海拔400 m和4 200 m饲养,每组5只,30 d后无菌取出脾脏组织,通过转录组测序,蛋白质组学和非靶向代谢组学分析差异表达基因、差异蛋白以及差异代谢物,利用GO和KEGG富集分析,挖掘关键通路,并通过RT-qPCR和Western blot对通路中关键基因和蛋白进行验证。结果转录组测序发现,低氧暴露下有4 213个基因出现显著性差异表达,其中1 947个基因表达上调,2 266个基因表达下调 ...
陈晓晨   +5 more
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LncRNA与凋亡相关基因在小鼠肠缺血再灌后肠黏膜表达谱中的变化及共表达网络关系

open access: yesZhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2019
【目的】研究小鼠肠I/R损伤早期肠黏膜中长链非编码RNA(lncRNA)的变化,建立差异表达的lncRNA表达谱及功能角色,并对lncRNA和凋亡相关基因进行编码-非编码基因共表达(CNC)生物信息学分析。【方法】采用lncRNA芯片高通量筛选小鼠肠I/R损伤早期肠黏膜中差异lncRNA的变化并用qRT-PCR验证芯片重复性,通过对与lncRNA同时差异表达的mRNA进行基因本体论(GO)富集分析,重点分析凋亡相关功能。最后,挑选差异变化的已知凋亡相关基因的mRNA ...
许淼   +6 more
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Identification and Analysis of Differentially Expressed Genes in Haemocytes of Variously Colored Abalone (Haliotis diversicolor Reeve,1846) Challenged with Bacteria [PDF]

open access: yes, 2008
鲍以其丰富的营养价值在民间一直被认为是与鱼翅、燕窝齐名的营养食品。养殖鲍市场价格高且稳定,销路畅通,利润空间大,深受水产养殖户的欢迎,是我国重要的海水养殖经济物种。杂色鲍(HaliotisdiversicolorReeve,1846)隶属于软体动物门,腹足纲,前鳃亚纲,原始腹足目,鲍科,是我国南方鲍种,因其生长迅速,一直在南方沿海海域得到广泛的养殖。但近年来由于养殖海域水质影响及养殖鲍种自身退化,使得人工养殖杂色鲍抗病力低,时有疫病发生,给养鲍业带来很大的经济损失。因此 ...
任洪林
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基于多数据集分析骨髓增生异常综合征相关的原发性免疫缺陷核心基因

open access: yesZhongguo shiyan zhenduanxue, 2023
目的 利用生物信息学方法探索骨髓增生异常综合征(MDS)发生发展机制,为筛选早期MDS辅助诊断指标提供理论依据。方法 选择来源于Gene Expression Omnibus数据库的人类MDS基因芯片或高通量转录组测序数据,利用R语言及相关包对数据集进行差异表达分析,采用STRING结合CytoHubba分析差异表达基因互作网络关系,并获取degree值前10的核心基因;利用GSEA对数据集进行通路富集,从而获取与显著富集通路相关的核心基因并评价其诊断效能。结果 本研究以正常组为对照 ...
连晓强, 张稳, 张栋栋, 穆红
doaj  

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