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Zhongguo shiyan zhenduanxue, 2022 目的 利用16SrRNA基因序列分析方法鉴定临床非典型细菌，为临床细菌分类鉴定新方法提供补充。方法提取细菌的DNA，自行设计引物并利用PCR技术扩增细菌16SrRNA基因片段，并对扩增片段进行序列测定，利用Blast等在线软件进行序列同源性分析。结果 在32株临床非典型细菌中，3株细菌可以鉴定到“属”，29株细菌可以鉴定到“种”，其中2株可以鉴定到“亚种”。结论 16SrRNA基因序列分析法是有效的病原细菌分类鉴定的补充。
白志鹏 +7 more
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基于经验模型分析2018年2月台湾花莲地震序列特征及其前震的成因机制
Dizhen xuebao, 2020 利用地震学的三个经典经验模型（古登堡-里克特定律、修正的大森定律和巴特定律）和描述前震活动的Dieterich前震模型对2018年2月中国台湾花莲地震序列的特征进行了分析。将该地震序列分为ML5.5前震序列、ML5.5余震序列和ML6.0余震序列等3段子序列进行研究，结果显示：利用古登堡-里克特定律得到的ML5.5余震序列和ML6.0余震序列的b值近似为1，ML5.5前震序列的b值近似为0.5；利用修正的大森定律得到的ML5.5余震序列和ML6.0余震序列的p值近似为0.9；利用修正的巴特定律得出ML5.
Yuancheng Shang, Baoping Shi
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Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2007 [目的]构建基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台。[方法]基于工作站和Linux操作系统,利用公开的日本血吸虫或相关资源,收集有关生物信息学序列分析工具,并自行编写相关软件实现多种资源的有机整合。[结果]构建了本地化的日本血吸虫序列分析平台,在此基础上,自主设计了日本血吸虫EST序列的电子延伸系统、基于日本血吸虫EST数据库的同源全长cDNA序列检索系统和序列自动注释系统等。[结论]所构建的序列分析平台不仅可以完成常规的序列分析工作,还可成功地完成EST序列的电子延伸 ...
刘稳升 +5 more
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四川大学学报. 自然科学版, 2005 人类基因组计划中的DNA序列图谱是生命科学和基因工程中的伟大成就.要解译隐藏在基因组中的生物信息还有一段很长的路要走.这是因为DNA序列的结构很难分析和识别.作者提出一种用于DNA序列结构分析的特征抽取方法.这种方法采用DNA序列码序的共生概率来抽取高维特征.然后采用相关法和/或贝叶斯分类器来分类结构模式.一些仿真试验的结果表明这种方法适合于DNA序列的结构分析。
罗代升, 膝奇志, 余艳梅
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野生动物学报, 2011 对黑颈鹤病原菌进行快速鉴定及毒力因子分析。采用16S rRNA序列分析法鉴定黑颈鹤病原菌,其毒力基因分别用大肠杆菌的irp2、papC、iucD、tsh、iss毒力基因的特异性引物进行PCR检测,并将扩增出来的irp2基因序列与GenbankTM相应序列进行同源性分析。分离菌株鉴定为大肠埃希氏菌,鉴定结果与生化检测结果一致,分离菌携带irp2毒力基因,这从毒力试验得到证实,其序列与与GenbankTM上发表的HPI irp2基因序列同源性高达98%以上。采用16S ...
余绍华, 陈武, 莫卓东
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野生动物学报, 2014 为了鉴定从广东某地圈养的白鹈鹕体内的线虫种类,2个样本通过形态学观察初步鉴定为对盲囊线虫后,对虫体核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区ITS-1、ITS-2及5.8S rDNA序列进行扩增和测序,并与GenBankTM公布的序列进行比对,构建系统发育树分析,确定其种类。结果显示,白鹈鹕体内线虫符合对盲囊线虫的形态学特征,其ITS-1序列长度为463 bp,与Contracaecum sp.(GenBankTM登录号:KF990496.1)ITS-1的序列相似性分别为98.9%、99.8%; ITS ...
陈绚姣 宋美冉 单 芬 陈 武 李少基 彭仕明
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四川大学学报. 自然科学版, 2005 利用抑制削减杂交和基因芯片技术获得一批黄孢原毛平革菌特异表达的EST序列,使用Phrap、EMBOSS、Blast、GENSCAN、MZEF软件,基于Linux操作系统,构建EST序列分析系统,完成了从EST和基因组Blast数据库的构建,载体序列的去除,EST序列的分类和组装,EST序列在基因组上的定位,外显子和内含子的识别以及基因预测.并通过使用perl语言结合bioperl模块写的脚本程序使分析过程自动化,从而可以快速地对大批EST序列进行分析 ...
李校, 江明锋, 张义正
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四川大学学报. 自然科学版, 2007 运用子波变换的分析方法,研究金融时间序列多尺度局域结构的波动性.通过对具体的股指数据分析表明,利用子波分析法,不仅能准确判定出序列的稳定周期大小和相对强弱,而且能提取序列的局部波动和突发波动信息.
陈理, 袁晓, 汤韩杰, 帅晓飞
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四川大学学报. 自然科学版, 2009 基于 Linux 操作系统,利用 Phrap/Consed、crossmatch、blast 等软件和自主开发程序,构建了批量 ESTs 序列的检测系统,对麻疯树胚乳 cDNA 文库部分测序结果进行生物信息学分析,包括载体序列的去除、序列格式的转换、重复序列鉴定、序列的同源性比对、GO 生物学过程以及 GO 细胞组分分类.
熊瑛 +4 more
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四川山鹧鸪脑源性神经营养因子(BDNF)基因的扩增与序列分析
四川大学学报. 自然科学版, 2000 :参照人BDNF基因序列设计出一对引物 ,利用聚合酶链式反应 (PCR)方法 ,从四川山鹧鸪 (Arborophilarufipectus)基因组DNA中扩增到BDNF基因 .序列分析表明 ,该基因序列长 736bp ,与人和鸡BDNF基因的核苷酸同源性分别为 84 % ,95% ,推导的蛋白质序列与人和鸡相应序列的同源性分别为 92 %和 98% .实验扩增并分析了四川山鹧鸪的BDNF基因 ,为四川山鹧鸪的保护和繁育提供了重要资料 .
杨光垚 +5 more
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