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Evaluating surrogates of genetic diversity for conservation planning
Conservation Biology, Volume 35, Issue 2, Page 634-642, April 2021., 2021 Abstract Protected‐area systems should conserve intraspecific genetic diversity. Because genetic data require resources to obtain, several approaches have been proposed for generating plans for protected‐area systems (prioritizations) when genetic data are not available. Yet such surrogate‐based approaches remain poorly tested.
Jeffrey O. Hanson +9 more
wiley +1 more source
野生动物学报, 2022 为了保证人工繁育的南白犀(Ceratotherium simum simum)种群能够健康长远发展,需要有详细准确的谱系记录,但是往往会存在子代亲生父亲不详的情况。通过亲子鉴定可以帮助确定子代亲生父本,从而获得准确的谱系记录。本研究在110只人工半散放南白犀群体中使用13个微卫星标记,对13个微卫星标记的多态性进行分析,计算非父排除概率和累积非父排除概率,结果显示:双亲已知时,13个位点的累积非父排除概率可达0.99以上,三联体父权分配时置信度可达到严格置信 ...
王予辰, 陈 莹, 王 宇, 金 煜
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野生动物学报, 2023 由于人类活动干扰及自然环境变化，东北马鹿（Cervus elaphus xanthopygus）的生存面临诸多问题。为掌握东北马鹿遗传多样性现状，进而为马鹿种群的健康状况提供评估依据，利用线粒体Cyt b基因和微卫星2种分子标记对内蒙古大兴安岭南麓高格斯台罕乌拉国家级自然保护区内的东北马鹿进行种群遗传多样性评估。结果表明：246份新鲜马鹿粪便隶属于182只个体；微卫星标记表明平均期望杂合度为（0.729±0.016），平均观测杂合度为（0.768±0.029），线粒体标记表明单倍型多样性为（0.347 ...
李峥, 郭金昊, 刘鑫鑫, 张明海
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野生动物学报, 2021 高原鼠兔（Ochotona curzoniae）是青藏高原的关键种，对其分子标记的开发有助于高原鼠兔种群生态等问题的研究。基于简化基因组测序技术获得了高原鼠兔简化基因组序列信息，并开发了微卫星分子标记。结果表明：通过MISA软件分析共检测到7 064个SSR位点，其中单核苷酸和二核苷酸重复基序数量最多，各占4615%和3837%。四核苷酸重复基序的类型最多，达83种；其次是三核苷酸重复基序的类型，为50种。不同类型SSR位点基序的重复次数也不同。通过取SSR与InDel的交集 ...
贺玉姣 1 胡万军 2 都玉蓉 1 王婷 1 杜雷 1 胡书立 1
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野生动物学报, 2022 以上海动物园圈养豚鹿(Axis porcinus)日常体检中抽取的血液为试验样品提取总DNA,利用高通量测序技术对通过探针富集得到的SSR序列测序,并用MISA检索SSR标记。结果表明:单碱基重复SSR到六碱基重复SSR在豚鹿基因组中均有分布,其中双碱基重复占比最高,在双碱基重复中以AC/GT重复为主。本研究成功开发出7个SSR标记,这些标记在22只豚鹿个体中检测到等位基因2～5个,在豚鹿种群中的平均多态信息含量(PIC)为0.421,平均期望杂合度(He)为0.513 ...
耿广耀, 由玉岩, 刘群秀
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中国南方食管鳞癌D5S107和D5S408杂合性丢失与微卫星不稳定性
Zhongshan Daxue xuebao. Yixue kexue ban, 2008 【目的】研究中国南方食管癌高发地区（潮汕地区）食管鳞癌5号染色体长臂（5q）部分微卫星标记的杂合性丢失（LOH）和微卫星不稳定（MSI），为食管鳞癌相关抑癌基因的定位提供依据。【方法】采用PCR银染技术，检测58例配对食管鳞状细胞癌标本多个微卫星标记（D5S107；SHGS31088；D5S816；D5S625和D5S408）的杂合性丢失和微卫星不稳定。【结果】SHGS31088，D5S816和D5S625杂合性丢失率和微卫星不稳定都较低；而D5S107和D5S408的杂合性丢失率分别为48.5%和34.
李小东 +7 more
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野生动物学报, 2018 微卫星广泛存在于真核生物和原核生物基因组中,是较为理想的分子标记。食蟹猴是生物医学研究领域中重要的灵长类动物模型,而食蟹猴基因组微卫星研究有助于筛选和开发更多的微卫星标记。利用生物信息学软件对食蟹猴全基因组微卫星进行了搜索,共搜索到微卫星总数为1284929个,微卫星序列长度为26044651 bp,占全基因组的0.890%。整个基因组微卫星平均丰度是451.3个/Mb,平均密度9118.7 bp/Mb。不同重复类型微卫星表现为单碱基(56.74%)>四碱基(16.72%)>二碱基(16.67 ...
涂飞云 刘 俊 韩卫杰 黄 挺 黄晓凤
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野生动物学报, 2019 大型猫科动物是顶级捕食者，它的存在依赖该地区的整个生态系统，也可以对整个地区的生态系统直接或间接产生强烈的影响。种群遗传学是保护遗传学的一个重要组成部分，对于野外种群来通过种群遗传学研究能了解种群的遗传多样性，种群大小，遗传结构等诸多信息。微卫星标记方法结合非损伤性取样方法在野生大型猫科动物保护遗传学的研究中有着重要地位，它具有诸多优点，广泛应用于种群遗传多样性、个体识别、亲缘关系鉴定等方面的研究。本文回顾大型猫科动物与微卫星标记方法的应用，虽然目前微卫星标记方法仍然具有一定的局限性，但是随着技术的发展，
王萌 1 朱思雨 2 薛茂盛 3 刘霖 3 任迎丰 3 李立新 3 许青 1 姜广顺 1
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野生动物学报, 2018 为探索东北地区野猪种群的遗传资源特征,本研究通过收集长白山北部林区5个地点的140份粪便样本,结合世界粮农组织(FAO)推荐的9个微卫星标记,使用Microsatellite Toolkit、GENEALEx软件计算相关遗传参数,评估各野猪局域种群的遗传多样性。研究结果表明,9个微卫星标记检测到的等位基因数目为6～15个,且PIC值为0.625～0.888,均为高度多态性位点。种群平均表观杂合度为0.760～0.813,平均期望杂合度为0.687～0.766,平均有效等位基因数为3.368～5.144个,
葛宝庆 胡素贤 孙铁铎 张崇颖 姜广顺
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野生动物学报, 2022 为有效保护浙江长兴尹家边扬子鳄保护区扬子鳄(Alligator sinensis)种群,丰富野放扬子鳄的遗传多样性,利用13个微卫星标记分析了该种群的遗传多样性,比较核心区和野放区种群的遗传多样性差异。结果显示:保护区扬子鳄种群共检测到31个等位基因,其中含2个稀有等位基因。野放区种群的平均有效等位基因数量(1.82)、平均观测杂合度(0.49)、平均期望杂合度(0.43)、平均多态信息含量(0.34)和平均香农信息指数(0.64)均低于核心区(1.89、0.52、0.46、0.37和0.70 ...
方黎明 +8 more
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